出芽酵母の転写単位確定とノンコーディングRNA発現の全貌把握

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22710182
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 三浦 史仁 東京大学, 大学院・理学系研究科, 特任助教 (50447348)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: トランスクリプトーム

研究概要

出芽酵母においてmRNAの5'末端と3'末端を同時に確定することを試みた。対数増殖期の細胞と減数分裂誘導直前と誘導後2時間毎に6回の回収を行った細胞を用意した。それぞれから独自に開発したクローニングフリーGIS法により配列決定のための鋳型を調製し、次世代シークエンサで配列決定を行った。このデータを用いて、出芽酵母遺伝子の転写開始点と終結点の双方の情報を同時に格納したユニークなデータベースを作成している。

研究成果

• [雑誌論文] 進化したメチローム解析技術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、伊藤隆司
  • 雑誌名: 医学の歩み 巻: 236巻6号 ページ: 643-651
• [雑誌論文] ゲノム網羅的メチル化解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、伊藤隆司
  • 雑誌名: 実験医学増刊「エピジェネティクスと疾患」 巻: 28巻15号 ページ: 2407-2414
• [学会発表] ゲノム網羅的バイサルファイトシークエンシングの高感度化への取り組み (2011)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、伊藤隆司
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20111213-16
• [学会発表] Whole genome bisulfite sequencing from subnanogram quantities of DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumihito Miura, Yusuke Enomoto, Ryo Dairiki and Takashi Ito
  • 学会等名: The 9th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20110712-14
• [学会発表] サブナノグラムからはじめるゲノム網羅的バイサルファイトシークエンシング (2011)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、榎本悠佑、伊藤隆司
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会第5回年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 20110519-20
• [学会発表] サブナノグラムからはじめるゲノム網羅的バイサルファイトシークエンシング (2010)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、榎本悠佑、伊藤隆司
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] ナノグラムからはじめるゲノム網羅的バイサルファイトシークエンシング (2010)
  • 著者名/発表者名: 三浦史仁、榎本悠佑、伊藤隆司
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会第4回年会
  • 発表場所: 米子
  • 年月日: 20100528-29
• [備考]
  • URL: http://itolab.cb.k.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/DesktopTracks/bin/Browser