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本研究では、転写伸長一時停止機構の全容解明を目的とし、挿入的クロマチン免疫沈降法(iChIP法)を用いて、c-fos遺伝子上の転写伸長一時停止領域を単離し、そこに結合している因子(蛋白質・DNA・RNA)を網羅的に同定することを目指した。まず、ニワトリのB細胞株であるDT40のc-fos遺伝子上の転写伸長一時停止部位にLexA結合配列を挿入するためのターゲティングベクターを作製した。現在、LexA結合配列を挿入するためのターゲティングを進めている。ターゲティングできた細胞株を得しだい、転写伸長一時停止領域を単離・解析する。また、iChIP法を最適化することで、低コピー数の解析対象とするゲノム領域を効率よく単離し、そこに結合する蛋白質およびRNAを同定することに成功した。
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