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2010 年度 実績報告書

真正粘菌変形体にみられる遷移ダイナミクスに対する数理モデルの作成とその数理解析

研究課題

研究課題/領域番号 22740064
研究機関京都大学

研究代表者

上田 肇一  京都大学, 数理解析研究所, 助教 (00378960)

キーワード数理モデル / 真正粘菌変形体 / 細胞運動 / 環境適応性 / 遷移ダイナミクス / 反応拡散系
研究概要

真正粘菌変形体は単細胞生物であり、脳のような高次機能を持たないにもかかわらず、餌のある場所に集まり、忌避物質に接した際にはその場所から離れるといった適応的な振る舞いを示すことが知られている。しかしながら、そのような環境適応性に対する数理的な理解に至っていないのが現状である。本研究の目的は、収縮弛緩運動と伸展運動によって発生する遷移ダイナミクスの数理的機構を解明するために解析手法を開発し、真正粘菌にみられる遷移ダイナミクスの発生機構を明らかにすることによって、環境適応的な振る舞いを可能にする数理的機構を明らかにすることである。本年度は真正粘菌の移動運動およびパターンダイナミクスに関する数理解析を行った。収縮弛緩運動とゾルを相互作用させた数理モデルの作成、および数値シミュレーションを行い、生物実験結果との比較を行った。移動運動の再現においては細胞先端部で起きる化学反応を考慮に入れることによって忌避物質に接した時に示す遷移ダイナミクスを定性的に再現することに成功した。この結果から、細胞先端部における化学反応の活性化が移動運動において重要であることを示すことができた。さらに、その数理モデルを改良することによって定在波、およびスパイラルパターンを再現する数理モデルの構築を試みた。定在波の再現において収縮弛緩運動にかかわる化学反応が有する非線形性が重要であることが数値シミュレーションによって明らかになった。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Pinned fronts in heterogeneous media of jump type2011

    • 著者名/発表者名
      Peter van Heijster, Arjen Doelman, Tasso J Kaper, Yasumasa Nishiura and Kei-Ichi Ueda
    • 雑誌名

      Nonlinearity

      巻: 24 ページ: 127-157

    • DOI

      DOI:10.1088/0951-7715/24/1/007

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mathematical model for contemplative amoeboid locomotion2011

    • 著者名/発表者名
      Kei-Ichi Ueda
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 83 ページ: 021916-1-021916-9

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Numerical approach to transient dynamics of oscillatory pulses in a bistable reaction-diffusion system2010

    • 著者名/発表者名
      Masaharu Nagayama, Kei-ichi Ueda and Masaaki Yadome
    • 雑誌名

      Japan Journal of Industrial and Applied Mathematics

      巻: 27 ページ: 295-322

    • DOI

      DOI:10.1007/s13160-010-0015-8

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chaotic motion of propagating pulses in the Gray-Scott model

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Yadome
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: (掲載確定)

    • 査読あり
  • [学会発表] 真正粘菌変形体にみられる外部刺激に対する情報処理2010

    • 著者名/発表者名
      上田肇一
    • 学会等名
      2010年度応用数学合同研究集会
    • 発表場所
      龍谷大学
    • 年月日
      2010-12-18
  • [学会発表] Behavior of a true slime mold crossing an environmental barrier2010

    • 著者名/発表者名
      Kei-Ichi Ueda
    • 学会等名
      Statistical Physics and Biology of Collective Motion, International Workshop
    • 発表場所
      Max-Planck-Institut fur Physik komplexer Systeme, Dresden, Germany
    • 年月日
      2010-11-08
  • [学会発表] 真正粘菌変形体にみられる環境適応性2010

    • 著者名/発表者名
      上田肇一
    • 学会等名
      応用数理学会
    • 発表場所
      明治大学
    • 年月日
      2010-09-08

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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