人工蛋白質を用いたDNAメチル化の検出および可視化技術の開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22750162
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 同志社大学 (2011); 独立行政法人理化学研究所 (2010)
• 研究代表者: 野村 章子 同志社大学, 研究開発推進機構, 特別研究員 (40443006)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: 生物有機化学

研究概要

メチル化DNAの検出方法の開発を目的として、メチルシトシンを特異的に認識する人工蛋白質・ペプチドの開発を行った。亜鉛フィンガー蛋白質を基本骨格として、分子モデリング計算からメチルシトシンとの相互作用を検討し、リン酸化チロシンを有する人工亜鉛フィンガーペプチドを得た。NMR測定およびゲルシフトアッセイから人工亜鉛フィンガーペプチドの構造とメチル化DNA認識能を評価した。人工亜鉛フィンガーペプチドを蛍光分子でラベルし、蛍光偏光測定を用いて二本鎖DNAのメチル化検出を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Akimitsu Okamoto, Detection of methylation status of DNA by designed phosphopeptide (2012)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura
  • 雑誌名: Peptide Sci 巻: 2011 ページ: 323-324
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and characterization of zinc chelator conjugated with cationic peptide (2012)
  • 著者名/発表者名: Yukata Hitomi, Akihiro Kashida, Akiko Nomura, Masanori Hayashi, Masahito Kodera
  • 雑誌名: Peptide Sci 巻: 2011 ページ: 319-322
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discrimination between 5-hydroxy methylcytosine and 5-methylcytosine by a chemically designed peptide (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Kaori Sugizaki, Hiroyuki Yanagisawa, Akimitsu Okamoto
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 47 ページ: 8277-8279
  • DOI: DOI:10.1039/C1CC12131F
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphopeptides designed for 5-methyl cytosine recognition (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 50 ページ: 3376-3385
  • DOI: DOI:10.1021/bi102053d
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recognition of methylcytosine in duplex DNA by artificial zinc finger peptide (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 雑誌名: Peptide Sci 巻: 2010 ページ: 226
  • 査読あり
• [学会発表] Detection of Methylated DNA by Designed Zinc Finger Peptide (2011)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] リン酸化ペプチドによるDNAメチル化の検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 野村章子、岡本晃充
  • 学会等名: 第48回ペプチド討論会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2011-09-28
• [学会発表] Recognition of methylcytosine in duplex DNA by artificial zinc finger peptide (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 学会等名: 5th International Peptide Symposium
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] Photocontrol of DNA binding by zinc finger peptide (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 学会等名: The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Yokohama, Japan
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] Artificial zinc finger peptide for recognition of methylated DNA duplex (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 学会等名: The 5th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
  • 発表場所: Kaohsiung, Taiwan
  • 年月日: 2010-11-04
• [学会発表] Recognition of methylated DNA by zinc finger peptide (2010)
  • 著者名/発表者名: Akiko Nomura, Akimitsu Okamoto
  • 学会等名: The 60th Anniversary Conference on Coordination Chemistry in OSAKA
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2010-09-27
• [学会発表] メチル化DNAを認識するペプチドの設計 (2010)
  • 著者名/発表者名: 野村章子、岡本晃充
  • 学会等名: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-26
• [産業財産権] メチル化DNA結合ペプチド (2010)
  • 発明者名: 岡本晃充、野村章子
  • 権利者名: 独立行政法人理化学研究所
  • 産業財産権番号: PCT、JP2010/068194
  • 出願年月日: 2010-10-15
  • 外国