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2010 年度 実績報告書

糸状菌転写因子結合配列の網羅的解析とエンジニアリング

研究課題

研究課題/領域番号 22760605
研究機関名古屋大学

研究代表者

兒島 孝明  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (40509080)

キーワード発現制御 / 生体機能利用 / 核酸 / 蛋白質 / 遺伝子
研究概要

本研究課題では、W/OエマルジョンPCRを利用したビーズディスプレイシステム用い、糸状菌由来の転写因子結合配列の大規模ライブラリースクリーニングを行い、糸状菌転写因子新規結合配列の獲得、改変プロモーターの創製を試み、バイオプロセス改変による有用物質の高効率生産への応用を目指す。
まず、糸状菌、Aspergillus nidulans由来転写因子AmyRを用いたスクリーニング系の確立を行った。塩基配列をN(A,T,GもしくはC)x22としたランダムDNAライブラリーを作製し、上記W/OエマルジョンPCRを用いてランダムDNAビーズライブラリーを調製した。転写因子AmyR溶液及び蛍光標識抗体をこのビーズライブラリーに加え、転写因子を介した蛍光複合体[ビーズ-結合DNA-転写因子-蛍光標識抗体]を形成させ、高い蛍光強度を保持するビーズ複合体をセルソーターを用いて回収する操作を計5ラウンド行った。その結果、5ラウンド後においてAmyR結合コンセンサス配列、CGGN8CGGが多数(109クローン中19クローン)確認された。現在、これら獲得クローンの評価を行っている。
また、酵母由来転写因子Gal4を用いて無細胞蛋白質合成系による転写因子結合部位スクリーニング系の確立を試み、ビーズ-Gal4結合DNA-in vitro発現Gal4-蛍光標識抗体の蛍光複合体形成に成功した。
さらに、このビーズディスプレイ法を用いたプロモーター活性選別法の開発を行い、T7プロモーター活性を指標としたスクリーニング系の確立に成功した。
今後、上記手法を組み合わせ、糸状菌ゲノムライブラリーもしくはランダムDNAライブラリーを用いた種々の転写因子結合配列のゲノムワイドスクリーニング、バイオプロセス改変による有用物質の高効率生産への応用を試みる。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2011 2010

すべて 学会発表 (2件)

  • [学会発表] DNAビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用のハイスループット検出法2011

    • 著者名/発表者名
      王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      要旨集
    • 年月日
      2011-03-05
  • [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性選別法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2010-10-29

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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