糸状菌転写因子結合配列の網羅的解析とエンジニアリング

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22760605
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物機能・バイオプロセス
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 兒島 孝明 名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (40509080)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 転写因子 / プロモーター活性 / エマルジョンPCR / 糸状菌 / ハイスループットスクリーニング

研究概要

ビーズディスプレイ法は、DNA ライブラリーをマイクロビーズ上に高集積に構築する手法である。この手法を用いてランダムDNAライブラリー及びゲノムライブラリーを用いて糸状菌転写因子AmyRの結合配列の解析を行い、AmyR結合モチーフの抽出及び種々の新規AmyR結合配列の獲得に成功した。さらに、このビーズディスプレイ法とリガーゼリボザイムを用いたプロモーター活性ハイスループット解析法を確立した。

研究成果

• [雑誌論文] High-throughput screening method for promoter activity using bead display and a ligase ribozyme (2012)
  • 著者名/発表者名: Kojima, T., Ohuchi, S., Ito, Y., Nakano, H.
  • 雑誌名: J. Biosci Bioeng. 巻: 114 ページ: 671-676
  • URL: http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiosc.2012.06.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive Analysis of the DNA-Binding Specificity of an Aspergillus nidulans Transcription Factor, AmyR, by using a Bead Display System (2011)
  • 著者名/発表者名: Wang, P., Kojima, T., Kobayashi, T., and Nakano, H
  • 雑誌名: Biotechnol. Biochem 巻: 76 ページ: 1128-1134
  • URL: http://dx.doi.org/10.1271/bbb.110949
  • 査読あり
• [学会発表] ビーズディスプレイ法を用いたin vitroプロモーターハイスループットスクリーニング法の確立 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
  • 学会等名: 日本農芸化学会中部支部第165回例会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20121000
• [学会発表] ビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用検出システム (2012)
  • 著者名/発表者名: 江崎俊文、王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
  • 学会等名: 日本農芸化学会中部支部第165回例会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20121000
• [学会発表] Comprehensive analysis of transcription factor binding site using bead display of DNA (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakano, H.,Wang, P.W. and Kojima, T
  • 学会等名: The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
  • 発表場所: Kanazawa
  • 年月日: 20120500
• [学会発表] In vitro high-throughput promoter screening system using a bead display and a class I ligase ribozyme (2012)
  • 著者名/発表者名: Ito, Y., Kojima, T., Ohuchi, S. and Nakano, H
  • 学会等名: The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
  • 発表場所: Kanazawa
  • 年月日: 20120500
• [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスI リガーゼ・リボザイムを用いたハイスループットなin vitro スクリーニング法の確立 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20120300
• [学会発表] ビーズディスプレイを用いたDNA-転写因子相互作用検出システムに関する研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 王ハン暉、兒島孝明、中野秀雄
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 20120300
• [学会発表] エマルジョンPCRを用いた分子間相互作用ハイスループットスクリーニング系 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中野秀雄、兒島孝明
  • 学会等名: 平成23年度生物工学技術セミナー企画
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20111100
• [学会発表] Novel screening method for promoter activity using a bead display and a ligase ribozyme (2011)
  • 著者名/発表者名: Kojima, T., Ito, Y., Ohuchi, S. and Nakano, H.
  • 学会等名: 第5回GCOEリトリート
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 20110900
• [学会発表] Detections of DNA-Transcription Factor Interactions using a Microbeads Display System (2011)
  • 著者名/発表者名: Wang, P., Kojima, T. and Nakano, H
  • 学会等名: 第5回GCOEリトリート
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 20110900
• [学会発表] ビーズディスプレイ法とクラスIリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitroハイスループットスクリーニング (2011)
  • 著者名/発表者名: 兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
  • 学会等名: 日本生物工学会2011年63回大会
  • 発表場所: 小金井
  • 年月日: 20110900
• [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitro 選別法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
  • 学会等名: 生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー2011
  • 発表場所: 笛吹
  • 年月日: 20110700
• [学会発表] DNAのビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用のハイスループット検出法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 王 ハン輝、児島 孝明、中野 秀雄
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都→震災の為発表中止
  • 年月日: 20110300
• [学会発表] Beads display:A Novel High-throughput Screening Technology to Explore Functional Biomolecules (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, T. and Nakano, H
  • 学会等名: The Eleventh China-Japan-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
  • 発表場所: Chengdu, China
  • 年月日: 20101100
• [学会発表] 無細胞蛋白質合成系を用いた1分子・1細胞由来mRNAの解析技術。 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中野秀雄、兒島孝明
  • 学会等名: 日本生物工学会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 20101000
• [学会発表] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性選別法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 兒島孝明、大内将司、中野秀雄
  • 学会等名: 日本生物工学会2010年62回大会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 20101000
• [学会発表] High-throughput Screening of DNA Binding Sites for Fungus Transcription Factor, AmyR, Using Beads Display System of DNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, T., Hashimoto, Y., Kato, M., Kobayashi, T. and Nakano, H
  • 学会等名: グローバルCOE第4回リトリート
  • 発表場所: 豊橋
  • 年月日: 20100900
• [学会発表] etections of DNA-transcription factor interactions using a Microbeads Display System (2010)
  • 著者名/発表者名: Wang, P., Kojima T. and Nakano, H
  • 学会等名: グローバルCOE第4回リトリート
  • 発表場所: 豊橋
  • 年月日: 20100900