転写因子ＴＦＩＩＨサブ複合体の構造解析

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22770110
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 香川大学 (2013); 兵庫県立大学 (2010-2012)
• 研究代表者: 小森 博文 香川大学, 教育学部, 准教授 (30382261)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: タンパク質 / Ｘ線結晶構造解析 / 結晶 / 転写因子

研究概要

本研究は、RNAポリメラーゼIIによるDNA転写制御機構を明らかにするために、Ｘ線結晶解析によって転写因子の立体構造を決定し、転写制御の分子機構を解明することを目的としている。転写因子は様々な種類のタンパク質の複合体として機能する。結晶化に適する試料を調整するために、転写制御に関わる重要なタンパク質複合体について、昆虫細胞や大腸菌の共発現系を利用して精製を行った。

研究成果

• [雑誌論文] New insights into the catalytic active site structure of multicopper oxidase (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, R. Sugiyama, K. Kataoka, K. Miyazaki, Y. Higuchi & T. Sakurai
  • 雑誌名: Acta Cryst. D 巻: 70 ページ: 772-779
• [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria constituents on recombinant human histidine decarboxylase (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Nitta, H. Kikuzakic, T. Azuma, Y. Ye, M. Sakaue, Y. Higuchi, H. Komori, & H. Ueno
  • 雑誌名: Food Chemistry 巻: 138 ページ: 1551-1556
• [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from D. vulgaris Miyazaki F with visible light (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Osuka, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata, S. Nagao, Y. Higuchi, & S. Hirota
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun 巻: 430 ページ: 284-288
• [雑誌論文] Cyrstal structure of the CueO mutants at Glu506, the key amino acid located in the proton transfer pathway for dioxygen reduction (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, T. Kajikawa, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun 巻: 438 ページ: 686-690
• [雑誌論文] Formation of Oligomeric Cytochrome c during Folding by Intermolecular Hydrophobic Interaction between Nand C-Terminal α-Helices (2013)
  • 著者名/発表者名: P. P. Parui, M. Deshpande, S. Nagao, H. Kamikubo, H. Komori, Y. Higuchi, M. Kataoka, & S. Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 ページ: 8732-8744
• [雑誌論文] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, R. Sugiyama, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
  • 雑誌名: Angew chem 巻: 51 ページ: 1861-1864
• [雑誌論文] Structural and enzymatic characterization of BacD, an L-amino acid dipeptide ligase from B. subtilis (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura, E. Hinokuchi, H. Ikeda, A. Senoo, Y. Takahashi, J. Saito, H. Komori, N. Shibata, Y. Yonetani, & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Protein Sci 巻: 21 ページ: 707-716
• [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, Y. Nitta, H. Ueno, & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Acta Cryst. F 巻: 68 ページ: 675-677
• [雑誌論文] Structural study reveals Ser345 determines substrate specificity on human histidine (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, Y. Nitta, H. Ueno, & Y. Higuchi
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 287 ページ: 29715-19183
• [雑誌論文] Domain swapping of the heme and N-terminal α-helix in Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 dimer (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, & S. Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 ページ: 8608-8616
• [雑誌論文] Positively charged residues located downstream of PIP-box, together with TD amino acids within PIP-box, are important for CRL4Cdt2-mediated proteolysis (2011)
  • 著者名/発表者名: M. Michishita, A. Morimoto, T. Ishii, H. Komori, Y. Higuchi, Y. Shiomi & H. Nishitani
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16 ページ: 12-22
• [雑誌論文] Crystallographic characterization of the DIX domain of the Wnt signalling positive regulator Ccd1 (2011)
  • 著者名/発表者名: S. Terawaki, K. Yano, T. Katsutani, K. Shiomi, K. Keino-Masu, M. Masu, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Acta Cryst. F 巻: 67 ページ: 758-761
• [雑誌論文] Role of π-Electron Systems in Stabilization of the Oxidized Tetraheme Architecture in Cytochrome c3 and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Takayama, M. Taketa-Sato, H. Komori, K. Morita, SJ. Kang, Y. Higuchi, & H. Akutsu
  • 雑誌名: Bulletin of the Chemical Society of Japan 巻: 841 ページ: 1096-1101
• [雑誌論文] Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Shibata, H. Tamagaki, S. Ohtsuki, N. Hieda, K. Akita, H. Komori, Y. Shomura, S. Terawaki, K. Mori, N. Yasuoka, Y. Higuchi & T. Toraya
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 285 ページ: 26484-26493
• [雑誌論文] Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix (2010)
  • 著者名/発表者名: S. Hirota, Y. Hattori, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, Z. Wang, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 107 ページ: 12854-12859
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of dimeric and trimeric cytochromes c from horse heart (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Taketa, H. Komori, Y. Hattori, S. Nagao, S. Hirota, & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Acta Cryst. F 巻: 66 ページ: 1477-1479
• [雑誌論文] Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd3 (2010)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimasu, H. Komori, Y. Higuchi, H. Nishimasu & H. Hiroaki
  • 雑誌名: Kobe J Med Sci 巻: 56 ページ: E125-139
• [雑誌論文] Crystal structure analysis of Bacillus subtilis ferredoxin-NADP+ oxidoreductase and the structural basis for its substrate selectivity (2010)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, D. Seo, T. Sakurai & Y. Higuchi
  • 雑誌名: Protein Sci 巻: 19 ページ: 2279-2290
• [学会発表] 構造解析に向けた鉄調節性転写因子の精製
  • 著者名/発表者名: 小森 博文
  • 学会等名: 日本生物高分子学会2013年度大会
• [備考]
  • URL: http://www.ed.kagawa-u.ac.jp/~komori/