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2010 年度 実績報告書

イカロドプシン反応中間体のX線結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 22770146
研究機関名古屋大学

研究代表者

村上 緑  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (20324387)

キーワード光生物 / ロドプシン
研究概要

ロドプシンが担う光情報変換過程は、ロドプシン分子内に含まれる発色団レチナールが光を吸収し11-cis型から全トランス型へと異性化することで開始される。我々は、イカロドプシンの結晶を用いて、光反応初期中間体の構造解析を試みている。反応中間体は結晶中での形成率が必ずしも大きくないこともあり、形成率を正しく見積もらないと間違ったモデルを導く可能性が大きくなる。本課題では、様々な視点から形成率を正しく見積もることを試みた。イカロドプシン結晶に対し液体窒素温度下でさまざまな波長の光を照射すると、11-cis型基底状態、9-シス型イソロドプシン、全トランス型バソ中間体の3状態間で平衡状態を形成した。様々な波長を当て、結晶中での各光異性体の形成率を正確に見積もった。バソ中間体が多く蓄積される青色光、基底状態が多い赤色光を交互に照射し収集したX線回折データから、X線照射量が少ない場合のみ活性部位近傍の電子密度に有意な差が観察された。この差マップもX線量が増えるに従って差が減少したため、X線照射によってタンパク質が壊れ正常な光化学反応が生じないX線産物に不可逆に変化したと判断した。オンライン顕微分光測定を行い、この不可逆な変化を定量的に解析し、X線照射した結晶中でのバソ中間体の形成率を正確に見積もった。さらに、あらゆる波長領域でイソドプシンの形成率が大きいことが分かったので、イソロドプシンの構造解析も行い、バソ中間体の正しいモデルを構築することができた。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] 無脊椎動物のロドプシン研究2010

    • 著者名/発表者名
      村上緑
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 50 ページ: 274-275

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural divergence and functional versatility of the rhodopsin superfamily2010

    • 著者名/発表者名
      Kouyama T, Murakami M
    • 雑誌名

      Photochem Photobiol Sci

      巻: 9 ページ: 1458-1465

    • 査読あり
  • [学会発表] ハロロドプシンのアザイド結合の状態2011

    • 著者名/発表者名
      中西太市,金田創運,竹口優,村上緑,井原邦夫,神山勉
    • 学会等名
      平成22年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20110330-31
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのLeu93の役割に関するX線結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      張進,山崎芳和,樋掛正則,村上緑,井原邦夫,神山勉
    • 学会等名
      平成22年度生物物理学会中部支部講演会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20110330-31
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのLeu93の役割に関するX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      張進,山崎芳和,樋掛雅則,村上緑,井原邦夫,神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20100920-22
  • [学会発表] Natronomonas pharaonis由来の光駆動塩素イオンポンプ・ハロロドプシンのX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      神山勉,金田創運,張進,竹口優,村上緑,井原邦夫
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20100920-22
  • [学会発表] イカロドプシン光異性化反応産物のX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      村上緑, 神山勉
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20100920-20100922
  • [学会発表] X-ray crystallography of the primary photoreaction intermediate of squid rhodopsin2010

    • 著者名/発表者名
      M.Murakami, T.Kouyama
    • 学会等名
      14th International Conference on Retinal Proteins
    • 年月日
      20100802-20100806

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公開日: 2013-06-26  

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