大腸菌小分子RNAによるmRNA抑制機構の解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22770175
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 鈴鹿医療科学大学
• 研究代表者: 森田 鉄兵 鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 助手 (10444366)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: 低分子RNA / 遺伝子発現抑制 / 大腸菌 / 塩基対形成 / RNAシャペロン

研究概要

本研究は、sRNAの1つであるSgrSをモデルsRNAとして用いて、sRNA/mRNA間の塩基対形成の詳細、およびRNA結合タンパク質であるHfqによるsRNA/mRNA間の塩基対形成の促進モデルの解明を目的とした。研究成果として、SgrS168-181 nt領域とptsG mRNAとで形成される塩基対が機能的に十分な最小の塩基対であること、またsRNAの3'末端に位置する連続したU塩基がsRNA機能に重要であることを示した。さらに、Hfqと結合しsRNAに標的化されたmRNAを速やかに分解されるRNase EとHfqとの結合領域を決定した。これらの成果は、sRNAによるmRNA抑制機構の全容解明につながる成果である。

研究成果

• [雑誌論文] PolyU tail of rho-independent terminator of bacterial small RNAs is essential for Hfq action (2011)
  • 著者名/発表者名: Hironori Otaka, Hirokazu Ishikawa, Teppei Morita, and Hiroji Aiba
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 108(32) ページ: 13059-13064
  • 査読あり
• [雑誌論文] 原核生物の制御RNA (2011)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、饗場弘二
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 238(5) ページ: 394-399
• [雑誌論文] Hfq binding at RhlB-recognition region of RNase E is crucial for the rapid degradation of target mRNAs mediated by sRNAs in E (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, Y., Yagi, M., Morita, T., and Aiba, H
  • 雑誌名: Coli. Mol. Microbiol 巻: 79(2) ページ: 419-432
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNase E action at a distance : degradation of target mRNAs mediated by an Hfq-binding small RNA in bacteria (2011)
  • 著者名/発表者名: Morita, T., and Aiba, H
  • 雑誌名: Genes Dev 巻: 25(4) ページ: 294-298
  • 査読あり
• [雑誌論文] A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translational repression of ptsG mRNA (2010)
  • 著者名/発表者名: Maki, K., Morita, T., Otaka, H., and Aiba, H
  • 雑誌名: Mol. Microbiol 巻: 76(3) ページ: 782-792
  • 査読あり
• [学会発表] (2011)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第5回日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: ろうきん研修所富士センター(静岡)
  • 年月日: 20110929-30
• [学会発表] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング
  • 発表場所: あいち健康プラザ(愛知)
  • 年月日: 20110830-0901
• [学会発表] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第5回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: 桂浜荘(高知)
  • 年月日: 20110808-10
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAのHfq作用領域の解析:塩基対形成領域と転写終結領域間の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第5回細菌学若手コロッセウム
  • 発表場所: 桂浜荘(高知)
  • 年月日: 20110808-10
• [学会発表] Poly tail of rho-independent terminator of bacterial small RNA acts an essential Hfq-binding site for riboregulation. (2011)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 20110614-18
• [学会発表] Identification of Hfq binding sites on RNase E in E. coli (2011)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、金井昭夫、饗場弘二
  • 学会等名: The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 20110614-18
• [学会発表] Both polyU tail and the upstream region of rho-independent terminator are required for the functional interaction of SgrS with Hfq (2011)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 20110614-18
• [学会発表] Generation of functional E. coli DicF small RNA and the role of the 3' polyU stretch in Hfq binding (2011)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、飯田芳文、饗場弘二
  • 学会等名: The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
  • 発表場所: 京都国際会議場(京都)
  • 年月日: 20110614-18
• [学会発表] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第8回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル木曽路(長野)
  • 年月日: 20110518-19
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAのHfq作用領域の解析:塩基対形成領域と転写終結領域間の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第8回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル木曽路(長野)
  • 年月日: 20110518-19
• [学会発表] Identification of Hfq binding sites on RNase E in E. coli (2010)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAであるSgrSの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、牧貴美香、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市
  • 年月日: 20101001-02
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAであるSgrSの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森田鉄兵、牧貴美香、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
  • 学会等名: 第4回細菌学・若手コロッセウム
  • 発表場所: 静岡県伊豆市
  • 年月日: 20100826-28
• [学会発表] Heterogeneity of RNA degradosome of Escherichia coli : RNase E forms several distinct complexes with partner proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: International symposium on Biodiversity Sciences 2010
  • 発表場所: 愛知県名古屋市
  • 年月日: 20100731-0803
• [学会発表] Implication of spacer length between base-pairing and Hfq-binding region in bacterial small RNA function (2010)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: International symposium on Biodiversity Sciences 2010
  • 発表場所: 愛知県名古屋市
  • 年月日: 20100731-0803
• [学会発表] The 3' terminator poly-U tract of SgrS plays a crucial role in Hfq-dependent gene silencing (2010)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: International symposium on Biodiversity Sciences 2010
  • 発表場所: 愛知県名古屋市
  • 年月日: 20100731-0803
• [学会発表] SgrS3'末端のポリU配列はRNA抑制機能に重要な役割を果たす (2010)
  • 著者名/発表者名: 大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第12回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東京都千代田区
  • 年月日: 20100727-29
• [学会発表] 大腸菌小分子RNAの作用機構の解析:塩基対形成領域とHfq結合領域間の距離の重要性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第12回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東京都千代田区
  • 年月日: 20100727-29
• [学会発表] Identification of Hfq binding sites onRNase E in E. coli (2010)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription
  • 発表場所: 沖縄県国頭郡
  • 年月日: 20100701-05
• [学会発表] Implication of spacer length between base-pairing and Hfq-binding region in bacterial small RNA function (2010)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription
  • 発表場所: 沖縄県国頭郡
  • 年月日: 20100701-05
• [学会発表] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第7回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 熊本県阿蘇郡
  • 年月日: 20100603-04
• [学会発表] 大腸菌sRNAであるSgrSの機能領域の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
  • 学会等名: 第7回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 熊本県阿蘇郡
  • 年月日: 20100603-04