ヒトとチンパンジーの比較トランスクリプトーム・メチローム研究

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22770240
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 自然人類学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 郷 康広 京都大学, 霊長類研究所, 助教 (50377123)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: 進化 / 霊長類 / ゲノム / 遺伝子発現 / チンパンジー / トランスクリプトーム

研究概要

ヒトとチンパンジーにおいて、父親.母親.子供トリオを用いたゲノムワイドな発現(トランスクリプトーム)解析を行った。次世代型シーケンサーによるメッセンジャーRNAの配列解読を行い、遺伝子発現量の定量化を行った。親と子供の多型情報とアリル単位での発現量を組み合わせることにより、子供ゲノムにおける由来既知のアリル特異的な発現定量が可能となった。その結果、チンパンジーでは、約17%にあたる遺伝子においてアリル間の発現に偏りがあることが分かった。現在、ヒトにおける同様の解析とメチル化解析も進行中である。

研究成果

• [雑誌論文] Diversification of bitter taste receptor gene family in wester nchimpanzees (2011)
  • 著者名/発表者名: Toru Sugawara, Yasuhiro Go, Toshifumi Udono, Naruki Morimura, Masaki Tomonaga, Hirohisa Hirai, and Hiroo Imai
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol 巻: 28 ページ: 921-931
  • DOI: DOI:10.1093/molbev/msq279
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of non-taster Japanese macaques for aspecific bitter taste (2010)
  • 著者名/発表者名: Nami Suzuki, Toru Sugawara, Atsushi Matsui, Yasuhiro Go, Hirohisa Hirai, and Hiroo Imai
  • 雑誌名: Primates 巻: 51 ページ: 285-289
  • DOI: DOI:10.1007/s10329-010-0209-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Degeneration of olfactory receptor gene repertories in primates : no direct link to full trichromatic vision. (2010)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsui, Yasuhiro Go
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol 巻: 27 ページ: 1192-1200
  • DOI: DOI:10.1093/molbev/msq003
  • 査読あり
• [学会発表] チンパンジーの味覚に地域差はあるか?～分子遺伝学からの考察～ (2011)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志
  • 学会等名: SAGA14
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] Comparative transcriptome and genome analysis in a chimpanzee trio (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Go
  • 学会等名: International Symposium of Developmental Systems Biologyon Gene Regulation and Aging
  • 発表場所: Shanghai, China
  • 年月日: 2011-10-13
• [学会発表] コモンマーモセットにおける消化器系での味覚情報伝達物質の定量的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 権田彩
  • 学会等名: 第45回味と匂い学会大会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2011-10-06
• [学会発表] ニホンザルエキソーム解析-実験動物化にむけた遺伝的バックグラウンドの解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-07-30
• [学会発表] ニホンザルにおける地域特異的な苦味感受性変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木南美
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-07-30
• [学会発表] チンパンジー3亜種における苦味受容体遺伝子ファミリーの分子進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-07-30
• [学会発表] ゲノムを通して我が身を知る-ヒトとチンパンジーの間にあるもの (2011)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2011-07-18
• [学会発表] ニホンザルにおける苦味受容体TAS2R38の地域特異的な感受性変異 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木南美
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2011-07-17
• [学会発表] チンパンジー3亜種における苦味受容体遺伝子ファミリーの分子進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2011-07-17
• [学会発表] ニホンザルエクソーム解析-実験動物化にむけた遺伝的バックグラウンドの解明- (2011)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 学会等名: 第27回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2011-07-17
• [学会発表] 霊長類における味覚受容体の進化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 学会等名: 第82回日本遺伝学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] Evolutionary dynamics of bitter taste receptor gene repertoires in primates (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Go
  • 学会等名: European Chemoreception Research Organization XXth CONGRESS
  • 発表場所: Avignon, France
  • 年月日: 2010-09-18
• [学会発表] Genetic Polymorphismin Sensory Receptor Genesof Primates (2010)
  • 著者名/発表者名: Nami Suzuki
  • 学会等名: The 4th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2010-09-12
• [学会発表] チンパンジー亜種集団間における苦味受容体遺伝子配列の比較解 (2010)
  • 著者名/発表者名: 早川卓志
  • 学会等名: 第12回日本進化学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-08-04
• [学会発表] チンパンジー親子トリオトランスクリプトーム解析による遺伝子発現制御機構の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 学会等名: 第12回日本進化学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-08-03
• [学会発表] Comparative transcriptome analysis in a chimpanzee trio (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Go
  • 学会等名: Society Molecular Biology and Evolution
  • 発表場所: Lyon, France
  • 年月日: 2010-07-07
• [学会発表] DEGENERATION OF OLFACTORY RECEPTOR GENE REPERTORIES IN PRIMATES : NO DIRECT LINK TO FULL TRICHROMATIC VISION (0)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsui
  • 学会等名: International Primatological Society XXIII Congress
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 00000916
• [学会発表] Comparative Transcriptome Analysisin Chimpanzee Trio (0)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Go
  • 学会等名: International Primatological Society XXIII Congress
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 00000913
• [学会発表] Region-specific distribution of non-taster Japanes emacaques (0)
  • 著者名/発表者名: Nami Suzuki
  • 学会等名: International Primatological Society XXIII Congress
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 00000913
• [学会発表] DIVERSIFICATION OF BITTER TASTE RECEPTOR GENE FAMILY IN CHIMPANZEES (0)
  • 著者名/発表者名: Toru Sugawara
  • 学会等名: International Primatological Society XXIII Congress
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 00000913
• [学会発表] INTRASUBSPECIFIC POLYMORPHISMS AND INTERSUBSPECIFIC DIVERGENECE OF BITTER TASTE RECEPTOR GENES IN CHIMPANZEES (0)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa
  • 学会等名: International Primatological Society XXIII Congress
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 00000913
• [学会発表] Comparative transcriptome and genome analysis in a chimpanzee trio (0)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Go
  • 学会等名: Young Researchers Conferenceon Evolutionary Genomics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 00000802
• [学会発表] Molecular Evolution of the Bitter Taste Receptor Gene Familyin Three Chimpanzee Subspecies (0)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hayakawa
  • 学会等名: Young Researchers Conferenceon Evolutionary Genomics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 00000802
• [図書] Post Genome Biology of Primates (2012)
  • 著者名/発表者名: Hirohisa Hirai, Hiroo Imai, Yasuhiro Go
  • 出版者: Primatology Monographs
• [図書] 受容体遺伝子の進化「化学受容の科学」 (2012)
  • 著者名/発表者名: 郷康広
  • 総ページ数: 71-82
  • 出版者: 化学同人
• [備考]
  • URL: http://www.pri.kyoto-u.ac.jp/bunshi/idenshi/index.html