• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2011 年度 実績報告書

いもち病菌における高頻度遺伝子ターゲッティング法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22780038
研究機関明治大学

研究代表者

大里 修一  明治大学, 農学部, 講師 (30533228)

キーワードいもち病菌 / 相同組換え / 遺伝子ターゲッティング
研究概要

Zinc finger nuclease(ZFNs)は標的配列に対し,正確に二本鎖切断を導入して相同組換えを誘導する,遺伝子ターゲッティング法に用いられる.すでに低頻度ながらone step disruptionの系が利用可能な糸状菌において,ヌクレアーゼやZFNsを用いた例はないことから,イネいもち病菌においてZFNs活性および相同組換え誘導とその促進条件について検討した.YFP遺伝子とブラストサイジン耐性遺伝子を融合したEYFP::BSD配列を元に,二本鎖切断により誘導された相同組換えを非破壊でモニターできるTG-RSマーカー系を導入したイネいもち病菌より,相同組換え検出系統の取得と高頻度相同組換え条件を確立した.特に本菌はストレス条件において,予想以上に相同組換え効率が高いことが明らかとなった.酵母ミトコンドリアDNAより得た低出現頻度の制限酵素I-sce 1遺伝子を糸状菌のコドン利用頻度に最適化して本菌へ導入したところ,高頻度の相同組換えが確認された.市販制限酵素や大腸菌から精製したI-Sce Iタンパク質を用いて,TG-RSマーカー株より作製したプロトプラストへ導入したところ,遺伝子によらない二本鎖切断により,相同組換えを誘導することに成功した.TG-RSマーカー配列をターゲットとしてZFNを構築するにあたり,DNA結合領域とFok Iヌクレアーゼ領域を糸状菌のコドン利用頻度に最適化して導入することで,出現するYFP蛍光コロニー数より相同組換え頻度を算出してその効果を評価し,ZFNsの最適条件を決定した.最終的にイネいもち病菌において,ZFNsを用いて二本鎖切断を導入する遺伝子ターゲッティング法が可能であることを示した.

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Disinfection using ozone microbubbles to inactivate Fusarium oxysporum f.sp.melonis and Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum2011

    • 著者名/発表者名
      F.Kobayashi, H.Ikeura, S.Ohsato, T.Goto, M.Tamaki
    • 雑誌名

      Crop protection

      巻: 30 ページ: 1514-1518

    • DOI

      10.1016/j.cropro.2011.07.018

    • 査読あり
  • [学会発表] DNA二本鎖切断はイネいもち病菌における遺伝的多様性を誘導する2012

    • 著者名/発表者名
      荒添貴之, 大里修一, 有江力, 米山勝美, 桑田茂
    • 学会等名
      平成24年度日本植物病理学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] イネいもち病菌におけるジンクフィンガーヌクレアーゼによる相同組換えの誘導2012

    • 著者名/発表者名
      用之丸哲也, 荒添貴之, 大里修一, 有江力, 桑田茂, 米山勝美
    • 学会等名
      平成24年度日本植物病理学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2012-03-29
  • [学会発表] いもち病菌感染イネのジベレリン分析2012

    • 著者名/発表者名
      真籠洋, 藤枝俊介, 花田篤志, 大里修一, 神谷勇治, 山口信次郎
    • 学会等名
      平成24年度日本植物病理学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2012-03-28
  • [学会発表] 赤かび病菌のトリコテセン系かび毒の後期生合成機構2012

    • 著者名/発表者名
      前田一行, 富永直樹, 兵藤壮一郎, 大里修一, 鎌倉高志, 米山勝美, 吉田稔, 木村真
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-25
  • [学会発表] 分泌性リパーゼの進化により生じるトリコテセン系かび毒の側鎖多様性-Tri104遺伝子の同定と側鎖脱アセチル化酵素の性質2012

    • 著者名/発表者名
      前田一行, 富永直樹, 兵藤壮一郎, 大里修一, 鎌倉高志, 米山勝美, 吉田稔, 木村真
    • 学会等名
      日本マイコトキシン学会第70回学術講演会
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 年月日
      2012-01-06
  • [学会発表] イネいもち病菌における人為的DNA二本鎖切断誘導と相同組換え修復2011

    • 著者名/発表者名
      荒添貴之, 大里修一, 有江力, 米山勝美, 桑田茂
    • 学会等名
      第11回糸状菌分子生物コンファレンス
    • 発表場所
      東京大学農学部,弥生講堂
    • 年月日
      2011-11-16
  • [学会発表] GFP遺伝子を導入したカーブラリア葉枯病菌の侵入観察2011

    • 著者名/発表者名
      藤枝俊介, 大里修一, 有江力, 米山勝美
    • 学会等名
      芝草学会,秋期大会
    • 発表場所
      信州大学農学部
    • 年月日
      2011-10-22
  • [学会発表] 相同組換えマーカー系を用いたイネいもち病菌の相同組換え機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      荒添貴之, 大里修一, 有江力, 米山勝美, 桑田茂
    • 学会等名
      日本植物病理学会関東部会
    • 発表場所
      文部科学省研究交流センター2階国際会議場
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] Identification of deacetylase genes that determine the side-chain modification patterns of trichothecenes in the late biosynthetic grid of type B trichothecenes2011

    • 著者名/発表者名
      K. Maeda, T. Tokai, M. Sato, S. Hyodo, N. Takahashi-Ando, S. Ohsato, M. Fujimura, T. Kamakura, K. Yoneyama, M. Yoshida, M. Kimura
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress_XIII, International Congress of Mycology
    • 発表場所
      札幌,札幌コンベンションセンター/札幌市産業振興センター
    • 年月日
      2011-09-10
  • [学会発表] ゲノム再編誘発技術の開発に向けたイネ相同組換え検出系の構築2011

    • 著者名/発表者名
      杉崎彰, 大里修一, 佐久間美子, 近藤聡, 村本伸彦, 杉本広樹, 米山勝美, 光川典宏, 大音徳, 太田邦史
    • 学会等名
      日本分子細胞生物学会(第29回)
    • 発表場所
      九州大学箱崎キャンパス
    • 年月日
      2011-09-07

URL: 

公開日: 2013-06-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi