微生物センサーを利用した新規スクリーニング法の開発

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22780081
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 独立行政法人産業技術総合研究所
• 研究代表者: 内山 拓 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究員 (70450658)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: メタゲノム / バイオテクノロジー / 微生物センサー / ゲルマイクロドロップ / 酵素

研究概要

PIGEX法にフローサイトメーターによるソーティングとゲルマイクロドロップ法を組み合わせた、新規スクリーニング法の開発をおこなった。当該手法を用いて、大腸菌を宿主に用いたライブラリーから、任意の酵素活性を発現する陽性クローンをスクリーニングすることに成功した。一方自然環境中の微生物細胞群から、任意細胞をスクリーニングするためには、ある程度集積培養が必要であることを示唆するような結果が得られた。

研究成果

• [雑誌論文] メタゲノムからの未知遺伝子スクリーニング法 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 雑誌名: 土と微生物 巻: Vol.65 ページ: 73-77
• [雑誌論文] Product induced gene expression, a product responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme encoding genes (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓、宮崎健太郎
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 巻: Vol.76 ページ: 7029-7035
  • 査読あり
• [学会発表] PIGEX法のハイスループット化の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山拓、宮崎健太郎
  • 学会等名: 第63回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] PIGEX法のさらなるハイスループット化の検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山拓、宮崎健太郎
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-03-28
• [学会発表] メタゲノムからの有用遺伝子取得法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 学会等名: LS-BT合同研究発表会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2011-02-01
• [学会発表] メタゲノムからの未利用遺伝子資源の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 学会等名: 第5回産業用酵素シンポジウム
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 2010-11-06
• [学会発表] PIGEX(Product Induced Gene Expression):微生物センサーを利用した酵素遺伝子スクリーニング法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓、宮崎健太郎
  • 学会等名: 第62回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2010-10-28
• [学会発表] メタゲノムを活用した有用酵素の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 学会等名: 平成22年度産学官連携推進会議
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-06-05
• [図書] Metagenomics ; Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression(SIGEX) screening ; a method for high-throughput screening of metagenome libraries (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓、宮崎健太郎
  • 総ページ数: 153-168
  • 出版者: Springer
• [図書] 難培養微生物研究の最新技術II.ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望.、SIGEX :メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 内山拓
  • 総ページ数: 61-70
  • 出版者: シーエムシー出版