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2010 年度 実績報告書

好熱菌におけるロイシンシグナリングの分子機構・構造基盤の解析

研究課題

研究課題/領域番号 22780084
研究機関東京大学

研究代表者

富田 武郎  東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教 (50447364)

キーワード好熱菌 / グルタミン酸脱水素酵素 / アロステリック調節
研究概要

Thermus thermophilus由来グルタミン酸脱水素酵素(GDH)のGdhAおよびGdhBサブユニットからなるヘテロ複合体の調製法を確立し、結晶化に成功した。これまでに、我々が決定しているGdhAおよびGdhBのホモオリゴマー構造を用いた分子置換法により、2.6Å分解能のGdhA/GdhB/Leu複合体の立体構造を決定することに成功した。GDHは4つのGdhAサブユニットと2つのGdhBサブユニットからなるヘテロヘキサマー構造を有していた。ロイシンは、サブユニット境界面に存在する新規なアロステリックサイトに結合していた。GdhA内のアロステリックサイトを形成するアミノ酸残基を置換した変異体を複数作製し解析した結果、多くの変異体でロイシンによる活性化が大幅に減少したことから、この結合サイトがGDHのアロステリック調節において主要な役割を担っていることが明らかになった。このサイトを形成する主要なアミノ酸残基がヒト等の哺乳類由来GDHにおいて保存されていることが明らかになり、T.thermophilusとヒトで生物種としては異なるものの、類似のアロステリック調節機構が存在する可能性が示唆された。DNAマイクロアレイを用いてT.thermophilusのロイシンによる転写調節の網羅的解析を行った。その結果、T.thermophilusはロイシンの添加により、ロイシン生合成経路遺伝子の転写抑制および分解経路遺伝子の活性化の他に、解糖系やTCAサイクルなどのエネルギー生産系やリボソームタンパク質、ロイシン以外のアミノ酸の代謝などのような幅広いシステムの調節に関与することを示唆する予備的なデータを得た。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Hetero-oligomeric glutamate dehydrogenase from Thermus thermophilus2010

    • 著者名/発表者名
      T. Tomita, T. Miyazaki, J. Miyazaki, T. Kuzuyama, M. Nishiyama
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 156 ページ: 3801-13

    • 査読あり
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来グルタミン酸脱水素酵素のロイシンによるアロステリック調節の構造基盤2011

    • 著者名/発表者名
      富田武郎、葛山智久、西山真
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会(京都)
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-03-27
  • [学会発表] Thermus thermophilus由来グルタミン酸脱水素酵素における活性調節の分子機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      富田武郎、西山真
    • 学会等名
      高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第9回連携研究会
    • 発表場所
      播磨(Spring-8)
    • 年月日
      2010-08-20
  • [学会発表] Mechanism for Allosteric Regulation of Glutamate Dehydrogenase from Thermus thermophilius2010

    • 著者名/発表者名
      富田武郎、葛山智久、西山真
    • 学会等名
      アメリカ結晶学会2010 Annual meeting
    • 発表場所
      シカゴ USA
    • 年月日
      2010-07-25
  • [備考]

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/biotec-res-ctr/saiboukinou/

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公開日: 2012-07-19  

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