レクチン様天然物Pradimicinによる糖認識機構の解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22780109
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物生産化学・生物有機化学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 中川 優 独立行政法人理化学研究所, 伊藤細胞制御化学研究室, 専任研究員 (90452284)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: Antibiotic / Carbohydrate recognition / Lectin / Natural product / Pradimicin / Solid-state NMR

研究概要

Pradimicin(PRM)は, Ca^<2+>イオン存在下D-マンノース(Man)と特異的に結合する天然抗生物質群である.本研究では,「固相中での分子相互作用解析」という全く新しい解析戦略のもと, PRMとManとの複合体の固体NMR解析を行なった.その結果, PRMがCa^<2+>イオンを介してManと結合していることを明らかにするとともに, PRMにおけるMan結合部位を初めて特定することに成功した.

研究成果

• [雑誌論文] Carbohydrate-Binding Molecules with Non-Peptidic Skeletons (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Trends Glycosci. Glycotechnol 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR analysis of calcium and D-mannose binding of BMY-28864, a water-soluble analogue of pradimicin A (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Doi, T., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Bioorg. Med. Chem. Lett. 巻: 22 ページ: 1038-1041
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mapping of the Primary Mannose-Binding Site of Pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Doi, T., Masuda, Y., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 巻: 133 ページ: 17485-17493
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-state NMR Spectroscopic Analysis of the Ca^<2+>-dependent Mannose Binding of Pradimicin A (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, Y., Masuda, Y., Yamada, K., Doi, T., Takegoshi, K., Igarashi, Y., and Ito, Y.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 50 ページ: 6084-6088
  • 査読あり
• [学会発表] Pradimicin Aの水溶性アナログ・BMY-28864とマンノースとの複合体の固体NMR解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川優,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012年度大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-03-24
• [学会発表] 固体NMRによるPraidimicin Aのマンノース認識機構解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 第53回天然有機化合物討論会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] Praidimicin AによるCa^<2+>依存的マンノース結合の固体NMR解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会
  • 発表場所: 長岡
  • 年月日: 2011-07-13
• [学会発表] Pradimicin Aによるマンノース認識機構の固体NMR解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川優,増田裕一,山田啓太,土井崇嗣,竹腰清乃理,五十嵐康弘,伊藤幸成
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-03-27
• [備考] RIKEN RESEARCH Highlights
  • URL: http://www.rikenresearch.riken.jp/eng/research/6837
• [備考] SpectroscopyNOW. com
  • URL: http://www.spectroscopynow.com/coi/cda/detail.cda?id=26834 & type=Feature & chId=5 & page=1