PNA/DNAインベージョン複合体の固定化を利用したゲノムDNA高次構造の解析

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22850004
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 愛場 雄一郎 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任助教 (10581085)
• 研究期間 (年度): 2010
• キーワード: 核酸 / バイオテクノロジー / 遺伝子 / ゲノム / PNA

研究概要

人工核酸の一つであるペプチド核酸PNAは、他の核酸アナログとは一線を画す非常に高いDNAとの親和性を有しており、インベージョン(2本鎖DNA中に潜り込み、新たに2組のPNA/DNA2本鎖を形成する現象)という特徴的なDNA認識が可能となっている。本研究では、PNAによるインベージョンの生体内応用を志向し、化学的なアプローチからインベージョンをより効率的かつ、安定化するための新規修飾PNAの設計・開発を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Manipulation of Single-Stranded DNA Using Artificial Site-Selective DNA Cutter Composed of Ce(IV)/EDTA and Phosphonate- Oligonucleotide Conjugates (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aiba, T.Lonnberg, M.Komiyama
  • 雑誌名: Chemistry-An Asian Journal (accepted.)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Artificial DNA Cutters for DNA Manipulation and Genome Engineering (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Aiba, J.Sumaoka, M.Komiyama
  • 雑誌名: Chemical Society Reviews 10 ページ: 1039/C1CS15039A
  • 査読あり
• [学会発表] PNA-peptide conjugateによる2重鎖DNA位置選択的切断への応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・亀島渡・Accetta Alessandro・Sforza Stefano・Marchelli Rosangela・Corradini Roberto・小宮山眞
  • 学会等名: 第60回高分子討論会
  • 発表場所: 岡山大学(発表予定)
  • 年月日: 20110900
• [学会発表] 細胞内応用を志向した人工DNAカッター(ARCUT)の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・本田祐太・亀島渡・菊池宏海・鴫成美・須磨岡淳・小宮山眞
  • 学会等名: 第21回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 関西大学(口頭発表予定)
  • 年月日: 20110700
• [学会発表] Ce(IV)/EDTAとペプチド核酸・ペプチドコンジュゲートによる位置選択的DNA切断 (2011)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・Accetta Alessandro・Sforza Stefano・Marchelli Rosangela・Corradini Roberto・小宮山眞
  • 学会等名: 第28回希土類討論会
  • 発表場所: タワーホール船堀(口頭発表)
  • 年月日: 2011-05-12
• [学会発表] PNA-Peptide conjugateを利用したDNA位置選択的切断 (2011)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・Accetta Alessandro・Sforza Stefano・Marchelli Rosangela・Corradini Roberto・小宮山眞
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学(口頭発表)
  • 年月日: 2011-03-29
• [学会発表] Strict recognition of double- stranded DNA by chemically modified PNA (Peptide Nucleic Acid). (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Aiba・M.Komiyama
  • 学会等名: 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] Site-selective scission of double- stranded DNA by Ce(IV)/EDTA and only one mixed-base PNA. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Aiba・Y.Hamano・A.Accetta・S.Sforza・R.Marchelli・R.Corradini・M.Komiyama
  • 学会等名: 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] Incorporation of a flexible linker into pseudo-complementary PNA for the strict recognition of DNA. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Aiba・Y.Nishiyama・M.Komiyama
  • 学会等名: The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Yokohama, Japan(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] 単一のPNA-peptide コンジュゲートを利用した位置選択的DNA切断 (2010)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・Accetta Alessandro・Sforza Stefano・Marchelli Rosangela・Corradini Roberto・小宮山眞
  • 学会等名: 第4回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 大阪大学(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-09-26
• [学会発表] 単一のPNA-peptideコンジュゲートを利用した位置選択的DNA 切断 (2010)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・濱野悠也・Accetta Alessandro・Sforza Stefano・Marchelli Rosangela・Corradini Roberto・小宮山眞
  • 学会等名: 第25回生体機能関連化学シンポジウム「若手フォーラム」
  • 発表場所: 大阪大学(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 機能性リンカー導入による新規PNA修飾法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 愛場雄一郎・小宮山眞
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学部会若手の会サマースクール
  • 発表場所: 三重県(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-07-16
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.mkomi.rcast.u-tokyo.ac.jp/member/aiba.html