大腸菌シャペロンによるタンパク質凝集抑制効果の大規模解析

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22870010
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 丹羽 達也 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (50588530)
• 研究協力者: 田口 英樹 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40272710)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: タンパク質のフォールディング / タンパク質凝集 / 分子シャペロン

研究概要

約800種類のフォールディング(立体構造形成)しにくい大腸菌細胞質タンパク質に対して、大腸菌の細胞質で働く主要な3種の分子シャペロン(タンパク質のフォールディングを助ける機能を持つタンパク質)を作用させてその効果を網羅的に調べた結果、約800個のうちのほとんどが2種類のシャペロンのどちらかによって凝集を形成しなること、及び3種のシャペロンを同時に作用させるとほぼ全てのタンパク質が凝集を形成せず、水に溶けるようになることが明らかとなりました。

研究成果

• [雑誌論文] Global analysis of chaperone effects using a reconstituted cell-free translation system Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2012)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Niwa, Takashi Kanamori, Takuya Ueda, Hideki Taguchi
  • 雑誌名: Early Edition
  • 査読あり
• [雑誌論文] Difference in the distribution pattern of substrate enzymes in the metabolic network of Escherichia coli, according to chaperonin requirement (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuhiro Takemoto, Tatsuya Niwa, Hideki Taguchi
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 巻: 5 ページ: 98
  • 査読あり
• [雑誌論文] Amphiphilic Polysaccharide Nanogels as Artificial Chaperones in Cell-Free Protein Synthesis (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshihiro Sasaki, Wakiko Asayama, Tatsuya Niwa, Shin-ichi Sawada, Takuya Ueda, Hideki Taguchi, Kazunari Akiyoshi
  • 雑誌名: Macromolecular Bioscience 巻: 11(6) ページ: 814-20
  • 査読あり
• [学会発表] 無細胞蛋白質合成系を利用した蛋白質凝集の網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 丹羽達也、上田卓也、田口英樹
  • 学会等名: 公開シンポジウム「蛋白質の機能を解き明かす多彩なアプローチ」(招待講演)
  • 発表場所: 横浜市立大学鶴見キャンパス
  • 年月日: 2011-10-17
• [学会発表] 再構築型生体外蛋白質合成系を用いた分子シャペロンによる凝集抑制効果の網羅解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丹羽達也、上田卓也、田口英樹
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター
  • 年月日: 2010-06-17
• [備考] 本研究の成果が国立遺伝学研究所の菅原秀明教授らによってパブリックデータベースとして公開されました。
• [備考] データベースの名称:eSOLデータベースGoogle検索で「eSOL、データベース」で検索可能
  • URL: http://tp-esol.genes.nig.ac.jp/