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2011 年度 実績報告書

超高分解能蛍光顕微鏡技術を用いた間期細胞核のクロマチン高次構造の解析

研究課題

研究課題/領域番号 22870042
研究機関独立行政法人情報通信研究機構

研究代表者

松田 厚志  独立行政法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所・バイオICT研究室, 専攻研究員 (20585723)

キーワード遺伝子 / 発現制御 / 生物物理 / 画像 / 生体生命情報学
研究概要

本研究の目的達成には、真核生物クロマチン繊維を、超分解能蛍光顕微鏡手法の3DSIMを用いて、可能な限り生体内に近い条件で観察する必要があった。本年度は、3DSIMによる生細胞観察手法を実現した。生細胞を観察するためには、細胞周辺の屈折率の違いが大きな問題となるが、光学的調整によりこの問題を解消し、生きた分裂酵母のクロマチンを直接観察した。生きた分裂酵母の間期クロマチンは、120nm以下の径を持つ比較的大きな繊維状の高次構造を形成していた。生きた細胞でDNA繊維が観察されたのはこれが初めてである。
この繊維構造をより詳細に解析するため、固定細胞を用いて実験を行った。これに先立ち、生きた細胞におけるクロマチン構造と同様の構造を保持する化学固定条件を検討した。ほとんどの化学固定液では、クロマチン繊維の径が膨張する傾向が見られたが、DNA消化酵素を阻害した上、高速に固定が進行する固定液を用いることにより、生細胞とほぼ等しい繊維構造を保持できるようになった。このように作成した標本を用いて、分解能が約30nmのSTORMによりDNAを観察したところ、約100nmの数珠状の繊維構造が観察された。このような数珠状構造は、近年の生化学的な研究報告で予想された構造であるが、顕微鏡で観察されたのはこれが初めてである。さらに、多色画像を正確に位置合わせするプログラムを作成した。これを用いて、ヒストン修飾の抗体染色を行い、ヒストン修飾とDNA繊維を多色3DSIM観察し、重なりを定量化したところ、ヘテロクロマチンとユークロマチンはほとんどの領域で同様に凝縮していることが明らかになった。また、転写部位は脱凝縮して繊維から突出していることを見出した。これまで、ユークロマチンに関して明確な凝縮率が報告されていなかったが、この結果は転写不活性なユークロマチンが高い凝縮率を持つことを明快に示している。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (7件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Highly precise and developmentally programmed genome assembly in Paramecium requires ligase IV-dependent end joining2011

    • 著者名/発表者名
      Kapusta A, Matsuda A, Marmignon A, Ku M, Silve A, Meyer E, Forney JD, Malinsky S, Betermier M
    • 雑誌名

      PLoS Genet

      巻: 7(4) ページ: 1002049

    • DOI

      DOI:10.1371/journal.pgen.1002049

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inner Nuclear Membrane Protein Ima1 is Dispensable for Intranuclear Positioning of Centromeres2011

    • 著者名/発表者名
      Yasushi Hiraoka, Hiromi Maekawa, Haruhiko Asakawa, Yuji Chikashige, Tomoko Kojidani, Hiroko Osakada, Atsushi Matsuda, and Tokuko Haraguchi
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 16(10) ページ: 1000-1011

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-2443.2011.01544.x

    • 査読あり
  • [学会発表] Localization microscopy with conventional GFP and noisy biological samples2012

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Matsuda
    • 学会等名
      Superresolution Microscopy Workshop
    • 発表場所
      Biopolis, Singapore
    • 年月日
      2012-03-28
  • [学会発表] Five-dimensional super-resolution imaging with OMX2012

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Matsuda
    • 学会等名
      Superresolution Microscopy Workshop
    • 発表場所
      Biopolis, Singapore
    • 年月日
      2012-03-28
  • [学会発表] 超分解能蛍光顕微鏡により観察する分裂酵母のクロマチン2012

    • 著者名/発表者名
      松田厚志
    • 学会等名
      第29回染色体ワークショップ
    • 発表場所
      仙台秋保温泉、宮城県
    • 年月日
      2012-01-25
  • [学会発表] 超分解能蛍光顕微鏡3DSIMにより見る間期核クロマチン2012

    • 著者名/発表者名
      松田厚志
    • 学会等名
      神戸大学重点研究チーム学術講演会
    • 発表場所
      神戸大学、兵庫県
    • 年月日
      2012-01-10
  • [学会発表] Spatial organization of fission yeast chromatin observed with super-resolution fluorescent microscopy2011

    • 著者名/発表者名
      松田厚志,平岡泰,原口徳子
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • 年月日
      2011-12-16
  • [学会発表] 高分解能顕微鏡2011

    • 著者名/発表者名
      松田厚志
    • 学会等名
      第17回細胞生物学ワークショップ
    • 発表場所
      情報通信研究機構、兵庫県
    • 年月日
      2011-08-12
  • [学会発表] 回析限界を超えた蛍光顕微鏡により見る細胞核内クロマチン2011

    • 著者名/発表者名
      松田厚志
    • 学会等名
      第37回レーザ顕微鏡研究会
    • 発表場所
      理化学研究所、埼玉県
    • 年月日
      2011-07-06
  • [備考]

    • URL

      http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/

  • [備考]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/hiraoka/index.html

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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