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2022 年度 実施状況報告書

光化学系II蛋白質における金属阻害機構の構造化学的解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K06100
研究機関名古屋大学

研究代表者

梅名 泰史  名古屋大学, シンクロトロン光研究センター, 准教授 (10468267)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
キーワード金属阻害 / 光合成蛋白質 / 結晶構造解析
研究実績の概要

本年度はターゲットとする光化学系II蛋白質(PSII)に光エネルギーを供給する、アンテナ蛋白質フィコシアニン(PC)に水銀イオンと鉛イオンの結合構造を決定した。その結果、3つの色素分子フィコシアノビリンの内の1つが、水銀イオンを取替囲むように大きく構造変化することが初めて明らかになり、それに伴って蛋白質構造も大きく変化することが明らかになった。
一方、鉛イオンはサブユニット蛋白質境界の表面に結合するだけで蛋白質構造に大きな影響を及ぼさず、また色素分子への影響も少ないことがわかった。このことは、過去の研究報告から、水銀イオンによってPCの吸収スペクトルの最大値が減少するが、一定以下には下がらない事が知られており、1分子のフィコシアノビリンが崩れるが他の2つには影響を受けないことから、阻害機能と構造との相関が明らかになった。また、鉛イオンは水銀イオンほど吸収スペクトルに影響を及ぼさない要因も、色素分子への結合しないことから明らかになった。しかし、PCは有害金属のスカベンジャーとして報告されていることから、水銀イオンは色素分子によって、鉛イオンは蛋白質-蛋白質界面に取り込むことで金属を取り込む機構を結晶構造から明らかにすることができた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

光合成蛋白質のフィコシアニンに重金属の水銀イオンと鉛イオンが結合した構造を初めて解明し、これまで生化学的な実験と分光学的な実験により、阻害機構が推察されていた現象を初めて、立体構造に基づいて議論することができたためである。

今後の研究の推進方策

今年度は、光化学系II蛋白質(PSII)の結晶試料の調製に難航しためて、PSIIと生体内で結合しているアンテナ蛋白質の重金属イオンによる結晶構造を解明したが、次年度は本来の目的のPSIIを対象に重金属イオンの結晶構造解析を目指した研究をすすめる。そして、複数の重金属イオン結合構造から、PSIIの電子伝達機構を阻害する重金属イオンの阻害様式を立体構造に基づいて解明することをめざす。

次年度使用額が生じた理由

本年度の研究では試料調製の最適化に重点がおかれ、既存の試薬などで対応ができた。また、放射光施設での実験に至らないこともあり、次年度以降jに予算を繰り越して、研究を継続する計画である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Observation of energy transfer dynamics in a phycocyanin protein crystal by utilizing femtosecond transient absorption microscopy2023

    • 著者名/発表者名
      Katayama Tetsuro、Ueda Shuto、Fujita Yuma、Akagi Yuichiro、Koinkar Pankaj、Umena Yasufumi、Furube Akihiro
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics

      巻: 62 ページ: SG1045~SG1045

    • DOI

      10.35848/1347-4065/acc3a9

  • [雑誌論文] Development of serial X-ray fluorescence holography for radiation-sensitive protein crystals2023

    • 著者名/発表者名
      Ang Artoni Kevin R.、Umena Yasufumi、Sato-Tomita Ayana、Shibayama Naoya、Happo Naohisa、Marumi Riho、Yamamoto Yuta、Kimura Koji、Kawamura Naomi、Takano Yu、Matsushita Tomohiro、Sasaki Yuji C.、Shen Jian-Ren、Hayashi Kouichi
    • 雑誌名

      Journal of Synchrotron Radiation

      巻: 30 ページ: 368~378

    • DOI

      10.1107/S1600577522011833

  • [学会発表] 光合成アンテナ蛋白質のフィコシアニンにおける光エネルギー移動の構造研究2022

    • 著者名/発表者名
      , 梅名泰史、片山哲郎、高山友理子、中根崇智
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
  • [学会発表] 混合緩衝液を使った光化学系II のpH 依存の構造変化と機能相関2022

    • 著者名/発表者名
      梅名泰史,安達麻由帆,沈建仁
    • 学会等名
      2022年度日本結晶学会年会
  • [学会発表] Combining in situ diffraction with microfluidic sample handling2022

    • 著者名/発表者名
      Leonard Chavas, 梅名泰史
    • 学会等名
      2022年度日本結晶学会年会

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公開日: 2023-12-25  

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