研究課題/領域番号 |
22K10057
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研究機関 | 岡山大学 |
研究代表者 |
小山 絵理 岡山大学, 大学病院, 医員 (60779437)
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研究分担者 |
後藤 和義 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (20626593)
大野 彩 (木村彩) 岡山大学, 大学病院, 講師 (20584626)
窪木 拓男 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (00225195)
大森 江 岡山大学, 大学病院, 医員 (30884879)
大野 充昭 岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60613156)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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キーワード | 腸内細菌叢 / 16sリボソーム解析 / 要介護高齢者 |
研究実績の概要 |
フレイルや要介護状態の高齢者における二次性低栄養の発症原因は不明である.一方,我々の腸内には,複雑な腸内生態系(腸内エコシステム)が存在しており,近年この腸内エコシステムの変調が肥満など様々な疾患と大きく関わっていることが報告されている.そこで,本研究計画では,低栄養発症における腸内細菌叢の関与を明らかにすることを目的に,低栄養状態にない高齢者を,長期に経過観察する前向きコホート研究を実施し,各種口腔栄養関連指標とともに,どの様な腸内細菌(叢)が後期高齢者における二次性低栄養の誘引となるかを明らかにすることを明らかにする.そして,この前向きコホート研究により同定された候補腸内細菌とその代謝産物がどのような影響を与えるかを明らかにし,低栄養促進菌を特定し,新たな介入法の開発に繋げたいと考えている. 本年度は,同じ施設において,同じ食事を摂取している低栄養状態に陥っていない要介護高齢者より,定期的に糞便を回収した.また,残存歯数や体重など,様々な基礎情報を採取した.そして,糞便より16Sリボソーム解析を行うためのDNAの抽出法を検討した.そして,酵素処理法と比較し,物理的破砕によるDNA抽出方法の方が,効率よく細菌からDNAを採取できることがわかった.
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
今年度は,サンプル回収も予定通りでき,またDNAの抽出法も検討し最適化できたので,概ね順調に進んでいると考える.
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今後の研究の推進方策 |
今年度に最適化したDNAの抽出法を用い,来年度は回収した全サンプルからDNAを抽出する予定である.また,これまでショートリードのシークエンスサーを用いて解析していたため,細菌の種の同定まで至らなかった.来年度は,ナノポア社のロングリードを読むことが可能なシークエンサーを用いて解析を行い,細菌の種の同定まで試みる予定である. また,引き続き,定期的に患者サンプルを回収し,前向きコホート研究の準備も進めていく予定である.
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次年度使用額が生じた理由 |
本来,DNAの抽出等は業者に依頼する予定であったが,我々自身で行ったほうが,DNA抽出法の最適化など,より迅速に可能であると考えたため,DNA抽出キットを購入し,我々自身で行った.その結果,人件費が削減できたため,今年度の使用額が減額となった.持ち越した研究費は,次年度のシークエンス費に用いる.つまり,1サンプルあたりのシークエンス量を増やし,より深い解析を実施するのに役立てる予定である.
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