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2023 年度 実施状況報告書

ゲノム編集とscRNA-seq解析を用いた天疱瘡や類天疱瘡発症の分子病態解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K10209
研究機関福岡歯科大学

研究代表者

古村 南夫  福岡歯科大学, 口腔歯学部, 教授 (10315070)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
キーワード自己免疫水疱症 / バイオマーカー
研究実績の概要

自己免疫水疱症の発症に関わる自己抗体が標的とする表皮細胞の細胞間結合蛋白抗原の遺伝子をゲノム編集でノックアウトしたケラチノサイトを構築した。3次元培養ケラチノサイトを対象にして、最新鋭の次世代シーケンサーによるシングルセルRNAシークエンシングにて包括的RNAトランスクリプトーム解析を行った。細胞間接着や細胞分化とのかかわり、天疱瘡の病態形成に関係するシグナル伝達機構などを中心に、解析を加える。
CRISPR/Cas9 システムを用いたゲノム編集により、自己免疫水疱症の抗原であるデスモグレイン3をノックアウトし、口腔粘膜3次元のケラチノサイト培養系を構築した。デスモグレイン3の発現消失とその影響について、蛍光抗体法や免疫ブロット法により確認した。デスモグレイン3のCas9-gRNAプラスミドは本学で既に作製されたものを用いた。自己免疫水疱症天疱瘡のもう一つの抗原であるデスモグレイン1のノックアウトについては確立できていないため、今後確立手段についてさらに検討を重ねる必要がある。
ノックアウト細胞は2次元および3次元培養にて、患者血清抗体やモノクローナル抗体を添加したものと無添加群を対照として、シングルセルRNAシーケンシングにてmRNAとmiRNA発現プロファイルを確認後、相互比較し包括的トランスクリプトーム解析を行う。必要なアウトソーシング解析に掛かる費用が高額であるため、今後さらに解析対象の絞り込みなど行いながら、研究を推進していく予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ゲノム編集でノックアウト実験を行い、シングルセルRNAシークエンシングにて包括的RNAトランスクリプトーム解析を開始した。今後、デスモグレイン3ノックアウト細胞で得られたシングルセルすなわち構成する細胞ごとの遺伝子発現パターンが得られたため、細胞接着、細胞分化との関連性を中心に解析を進めていく予定である。

今後の研究の推進方策

アウトソーシングで可能な解析法を含めて、シーケンシング結果の検討をさらに進める。今後の解析事項の重要性などを検討したうえで、再度必要ならば、シングルセルRNAシーケンシング解析を繰り返しながら研究を推進していく予定である。

次年度使用額が生じた理由

アウトソーシングによる解析費用が本年度研究費による実行可能な上限を超えたため、次年度使用額にすることにより翌年度分として請求した助成金と併せて研究を進めていくため。

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公開日: 2024-12-25  

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