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2022 年度 実施状況報告書

Machine Learning for Structure-Rich Data-Scarce Domains

研究課題

研究課題/領域番号 22K12150
研究機関京都大学

研究代表者

NGUYEN Canh・Hao  京都大学, 化学研究所, 講師 (90626889)

研究期間 (年度) 2022-04-01 – 2025-03-31
キーワードGraph neural networks / machine learning
研究実績の概要

We are working on the topic of predicting properties of two drugs, formulated as a pair of graphs. Due to its potential high dimensionality and small scale data, we have to leverage more data from different sources to avoid overfitting. The solution is to learn representation of two drugs within a network of drugs, proteins and other biological information.

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

We have found some small but novel methods for particular problem of learning representations of two drugs in its special context.

今後の研究の推進方策

We continue to investigate learning problem with small data by leveraging information from other source to learn reliably.

次年度使用額が生じた理由

Due to corona visus pandemic, we have not proceed to use all the cost yet.

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件)

  • [雑誌論文] Central-Smoothing Hypergraph Neural Networks for Predicting Drug?Drug Interactions2023

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Duc Anh、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 0 ページ: 1~6

    • DOI

      10.1109/TNNLS.2023.3261860

    • 査読あり
  • [雑誌論文] SPARSE: a sparse hypergraph neural network for learning multiple types of latent combinations to accurately predict drug?drug interactions2022

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Duc Anh、Nguyen Canh Hao、Petschner Peter、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 ページ: i333~i341

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac250

    • 査読あり / 国際共著

URL: 

公開日: 2023-12-25  

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