| 研究課題/領域番号 |
22K15210
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
塚本 聡美 国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, 特別研究員 (10929847)
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| 研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| キーワード | 神経幹細胞 / 遺伝子振動発現 / 神経・脳発生 / 遺伝子レポーター解析 |
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| 研究実績の概要 |
転写因子Hes1は、神経幹細胞において、2-3時間周期で振動的に発現し、この振動的発現は、細胞間で非同期的であることが知られる。Hes1の発現の細胞間の非同期性は現象として興味深い一方で、その細胞ごとに固有な振動は、長年、下流遺伝子の探索を困難としてきた。
本研究では、神経幹細胞におけるHes1の振動発現の下流遺伝子を同定するため、光遺伝学的ツール（hGAVPO-Hes1）を用いてHes1遺伝子の同期的な振動発現を誘導し、RNA-seq解析を実施した。その結果、Hes1依存的に発現が変化する候補遺伝子群が抽出された。今年度は、それらの下流候補遺伝子のいくつかについて、レポーター神経幹細胞株を作製した。また、作製したレポーター細胞株について、生細胞イメージングを行うための顕微鏡環境・撮影条件を設定した。さらに、取得したイメージング画像に対し、予備的な定量化解析を実施した。加えて、Hes1遺伝子の直接的な下流遺伝子を同定するため、CHIP-seq解析を行い、約1900個の遺伝子が同定された。これにより、RNA-seqで同定された遺伝子のうち、直接的な下流遺伝子が明らかにされた。これらの解析により、Hes1の下流に存在する細胞内のシグナル伝達系について、いくつかの仮説がもたらされた。
今後は、作製したレポーター細胞株について、複数の撮像条件にて定量化解析を行い、Hes1と新規遺伝子との関係を明らかにする。また、Hes1と下流遺伝子の発現動態が細胞内プロセスにもたらす役割を明らかにする。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
今年度は、 Hes1の下流遺伝子候補のうち、いくつかの遺伝子について、ゲノム編集（CRISPR-Cas9法）により、多色レポーター神経幹細胞を作製した。また、作製したレポーター神経幹細胞株について、多色イメージングが可能であることを確認した。さらに、取得したイメージング画像について、予備的な定量化解析を実施した。加えて、Hes1遺伝子の直接的な下流遺伝子を同定するため、CHIP-seq解析を行い、約1900個の遺伝子を同定した。これらの結果から、本研究はおおむね順調に進展していると考えられる。
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は、作製したレポーター神経幹細胞株について、複数の条件にて、定量化解析を行い、Hes1と新規振動遺伝子との関係を明らかにする。また、Hes1の振動と下流遺伝子の発現動態が細胞内プロセスにもたらす役割を明らかにする。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
次年度にNGS解析やイメージング解析のためのPC購入費を計上するため。
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