研究課題/領域番号 |
22K16329
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研究機関 | 大阪公立大学 |
研究代表者 |
藤本 康介 大阪公立大学, 大学院医学研究科, 准教授 (30802805)
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研究期間 (年度) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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キーワード | 腸内細菌 / バクテリオファージ / 急性移植片対宿主病 |
研究実績の概要 |
自身のゲノムによる遺伝的な背景にさまざまな環境因子が相まって疾患感受性が高まると言われている。環境因子として腸内細菌叢が宿主に与える影響は病態メカニズムを考える上で非常に重要であり、近年では腸内細菌叢の構成異常(dysbiosis)だけでなく、疾患の発症や病態に直接的に関わる腸内共生病原菌(pathobiont)も次々と同定されている。同種移植は血液腫瘍分野において非常に重要な治療法として確立されているが、同種移植後の特有な合併症として移植片対宿主病(GVHD: graft-versus-host disease)が挙げられる。近年、同種移植後のpathobiontとしてEnterococcus属細菌が同定されたが、同種移植後では腸内のEnterococcus属細菌が増加し、それによりGVHD関連死亡率が増加することが明らかとなった。本研究課題では、46症例の同種移植患者から経時的に集めた糞便検体の16SrRNA解析を行い、30症例においてEnterococcus属細菌の割合が顕著に増加していることを確認した。Enterococcus属細菌の割合が多い糞便検体からEnterococcus選択培地を用いて複数の菌株を単離し、PCR法を用いてEnterococcus faecalisとEnterococcus faeciumの菌株を選別した。得られた菌株のショットガンシークエンスを行った。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本研究課題では、メタゲノム解析技術を用いて、移植片対宿主病(GVHD: graft-versus-host disease)のリスクを高めるpathobiontに対する次世代ファージ療法の確立を目指すものである。目的達成のために、1)同種移植患者糞便を用いたE. faecalisの単離、2)E. faecalis特異的な溶菌酵素の探索およびその溶菌活性の解析、3)GVHDモデルマウスを用いた溶菌酵素の効果の評価を検討する。既に複数の患者糞便検体から数多くのE. faecalisを単離することができた。当初の予定より順調に菌株の単離が進んでおり、それぞれの菌株のショットガンシークエンスまで行った。以上から、実験計画通り概ね順調に進展している。
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今後の研究の推進方策 |
得られたゲノムデータを元に、溶菌酵素候補配列の同定ならびに溶菌酵素の作成を行う。溶菌酵素を作成した後は、その溶菌活性を評価し、溶菌活性を有するものをGVHDモデルマウスでの検討に用いる。
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次年度使用額が生じた理由 |
次年度以降、大規模な動物実験などを予定しているため、一部を繰り越した。
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