2022 年度実施状況報告書

iHep樹立における分化転換および成熟肝細胞機能獲得の機序解明

研究課題

研究課題/領域番号	22K16461
研究機関	京都大学
研究代表者	安田勝太郎京都大学, iPS細胞研究所, 特定研究員 (80938621)
研究期間 (年度)	2022-04-01 – 2024-03-31
キーワード	Direct conversion / iHep / Gene regulatory network
研究実績の概要	令和4年度の計画は、①マウスiHep樹立における6個の転写因子の機能解析、②薬剤誘導性に転写因子群を発現してiHepに分化転換するヒトiPS細胞株の樹立、の2点であった。先ずは①についてであるが、既に同定した6個のコア転写因子候補（Hnf4a, Foxa3, Cebpa, Cebpd, Hnf6, Onecut2）について、1因子ずつ抜いて5因子で作製したiHep（6F-1F_iHep）を中心に、RNA-seqで遺伝子発現解析を実施した。クラスタリングでは2因子(Hnf4a+Foxa3)によるiHep（2F_iHep）と6因子によるiHep（6F-iHep）でクラスターがわかれており、DEG解析で6F_iHepの方が2F_iHepよりもCyp3a11やCps1など主要な成熟肝細胞マーカーの発現が高かった。解析によりHnf4aおよびFoxa3は間葉上皮転換・内胚葉分化に重要であることが確認された一方で、Hnf4a, Foxa3以外の残り4因子について、それぞれ6因子から抜いて作製したiHep(6F-1F_iHep)は、クラスタリングや主成分分析において6F_iHepと非常に近く、各4因子の役割の違いが明確にならなかった。そのため、各4因子について追加の解析を行っているところである。続いて②についてであるが、レンチウイルスベクターにヒトの各転写因子を搭載してヒトiPS細胞に強制発現しようとしたが、入手した各転写因子のplasmidに問題があったため、作業が大幅に遅れ、ヒトiHep樹立のための転写因子を確定させるスクリーニングが実施できていない。現在トラブルは解決し、上記のスクリーニングを5月から開始するところである。
現在までの達成度 (区分)	現在までの達成度 (区分) 3: やや遅れている理由発現遺伝子解析において、Hnf4aとFoxa3の影響が大きいため、他の4因子の機能評価が予想より困難であったため、現在別の手法で解析を試みている。また、ヒト細胞でのiHepの作製に最適な転写因子の組み合わせを確認するスクリーニングにおいて、結果的に入手したヒト転写因子を搭載するplasmidに予期せぬ変異が多数入っていたため、スクリーニングに用いるレンチウイルスベクターの作製にかなり手間取った。
今後の研究の推進方策	マウスについては、各転写因子の機能評価のため、現在新たな解析を実施中である。ヒトiPS細胞からのiHep作製に最適な転写因子の組み合わせを決定するスクリーニングを早急に開始し、決定したら既に入手しているpiggyBacベクターに搭載しヒトiPS細胞に導入して、薬剤誘導性に転写因子群を発現してiHepに分化するヒトiPS細胞株を樹立する。このpiggyBacベクターを導入するヒトiPS細胞株は、健常人および疾患株を用いる予定である。ヒトiHep樹立に使用した転写因子群の機能評価とともに、ヒトiPS細胞由来iHepの肝細胞様細胞としての遺伝子発現および機能の評価を行う。そして、疾患患者由来iHepが疾患表現型を呈することを確認する。