| 研究課題/領域番号 |
22K18685
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
豊田 太郎 東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (80422377)
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| 研究期間 (年度) |
2022-06-30 – 2025-03-31
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| キーワード | ジャイアントベシクル / マイクロ流体デバイス |
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| 研究実績の概要 |
本研究課題は、走化性をもつ遊走性単細胞生物の化学モデル（ここでは人工バクテリアと呼ぶ）を創出することを目的とする。原始細胞が進化の過程でどのように駆動力を得て、走化性という高次機能を獲得してきたかという未解明の謎に対し応募者は、細胞生物学的手法とは相補的に、構成的アプローチとして、素性のわかった有機分子の水中での構造形成と反応の時間発展に立脚した人工バクテリアをつくり、これが実験室進化によって走化性を獲得する時空間発展を計測技術と分析技術を駆使して明らかにすることを着想した。一年目は、人工バクテリアをその場観察するための進化リアクターのプロトタイプ作製および画像解析法の開発に従事した。人工バクテリアは進化リアクター内部で動き回ることから、形態をとらえるために共焦点レーザー走査型蛍光顕微鏡で観察すると、各断面像で位置ずれがおこるために、位置ずれを補正して3次元イメージ構築をする必要がある。そのために、人工バクテリアに見立てたジャイアントベシクルのマイクロ流体デバイスの捕捉構造（特に厚み方向）について精査するとともに、位置連れのある各断面像を修正して3次元イメージ像を構築できるプログラムを開発した。機械学習と転移学習によってジャイアントベシクルの各断面像の中心位置を把握・学習させ、その後にデコンボリューション法を組み込んだ3次元イメージ構築プログラムを自作することで、それらを補正した球形のジャイアントベシクルの3次元イメージ像を取得することができた。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本研究は、人工バクテリアを創出することを目的として、ジャイアントベシクルが走化性を獲得する時空間発展を計測技術と分析技術を駆使して明らかにすることを目指している。このとき、ジャイアントベシクルの動きを精確に顕微鏡像から抽出する必要があり、応募者がこれまで取り組んだことのない画像解析法としての機械学習と転移学習の方法論を導入することとした。一年目でジャイアントベシクルの3次元イメージ像を構築できたことをベースに、翌年度でマイクロ流体デバイス開発（トップダウンアプローチ）と構成分子の有機合成（ボトムアップアプローチ）という研究展開に集中できる点で、順調に進展している。
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| 今後の研究の推進方策 |
二年目は、ジャイアントベシクルの構成分子の有機合成を進めつつも、進化リアクターとなるマイクロ流体デバイスの開発に注力し、人工バクテリアの運動を継続して観測できる双方向観察実験プラットフォームを実現する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
研究申請時に予算に見込んでいた共焦点レーザー走査型顕微鏡用のレーザー光源が、見積り時と価格や納期が変更となり、一年目では購入を見送った。すでに、同等の仕様の光源や光学系を見直すことで、二年目に人工バクテリアの蛍光観察に適した光学系を構築するために、次年度使用額を含めて予算執行する。
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