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2023 年度 実績報告書

電子線散乱と量子化学計算を利用した分子内分極決定法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22K19296
研究機関九州工業大学

研究代表者

安永 卓生  九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (60251394)

研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2024-03-31
キーワード電子顕微鏡 / 電子線回折 / 量子化学計算 / 電子配置
研究実績の概要

電子線と磁性をもたない物質の相互作用は、電子により遮蔽された原子核の静電ポテンシャルである。そのため、電子線回折による構造解析においては、電子の分布考慮し、電子密度ではなく、静電ポテンシャルをつかって構造計算することが適切である。本研究では、R因子を評価関数として、電子密度と静電ポテンシャルによる構造解析を行い、比較を行った。電子密度及び静電ポテンシャルともに、量子化学計算を用いて、対応する原子核の配置を変更しながら、計算を行った。その結果、静電ポテンシャルによる構造解析のほうが、R因子が低下することが分かった。さらに、芳香環についた水酸基、及びメチル基における水素の配置について、R因子の極小値をもつ構造があることがわかった。また、このR因子の極小値を用いた構造は、電子密度を用いた配置と静電ポテンシャルを用いた配置では異なっており、ここでも静電ポテンシャルを用いた構造のほうがR因子が小さく、芳香環についた水酸基は、芳香環のもつ四重双極子からみて、適切な配置であった。以上のことから、量子化学計算を行った静電ポテンシャルを用いることにより、精密な構造決定が可能であることが示された。ただし、温度因子に関しては、分子全体の揺らぎに関するものしか考慮できていないため、R因子の低下が不十分である。今後、原子毎の原子核位置の動きに対応した、静電ポテンシャルの揺らぎを計算する手法を構築することを通して、より精密な構造決定につなげることに挑戦する。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うちオープンアクセス 1件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] 計測分析を未来につなぐためのデータの在り方と標準化2024

    • 著者名/発表者名
      安永卓生
    • 雑誌名

      計測標準と計量管理

      巻: 73 ページ: 4-12

    • オープンアクセス
  • [図書] タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例2023

    • 著者名/発表者名
      児嶋長次郎他
    • 総ページ数
      530
    • 出版者
      NTS
    • ISBN
      978-486104-995-8
  • [図書] クライオ電子顕微鏡ハンドブック2023

    • 著者名/発表者名
      難波啓一他
    • 総ページ数
      460
    • 出版者
      NTS
    • ISBN
      978-4-86043-804-3
  • [備考] Eospedia

    • URL

      https://www.yasunaga-lab.bio.kyutech.ac.jp/EosJ/

URL: 

公開日: 2024-12-25  

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