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2023 年度 実施状況報告書

深海底熱水噴出孔チムニー内部における始原的古細菌の生態と代謝の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22K19340
研究機関東京大学

研究代表者

鈴木 庸平  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (00359168)

研究分担者 金井 昭夫  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 教授 (60260329)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2025-03-31
キーワード金属硫化物チムニー / 光熱変換赤外分光法 / Pacearhaeota
研究実績の概要

本研究の目的は、「チムニー内部で始原的な特徴を有する生命が、どのように生命活動を営んでいるのか?」という問いを解明することである。令和4年度は、先行するメタゲノム解析に加えプロテオーム解析を実施することで、深海熱水噴出孔チムニー内部でDPANN古細菌のPacearchaeotaが優先していることを明らかにした。令和5年度は、深海熱水噴出孔チムニー内部に生息する微生物の共生を明らかにした。
さらに、南マリアナトラフの熱水噴出域で採取したチムニー試料を、精密ダイヤモンドバンドソーを用いて切断し、分析用の薄片を作成した。樹脂埋めなしで作成した薄片は、切断面の研磨等の処理をせずに分析に供した。次に、光熱変換赤外分光法(Optical-photothermal IR spectroscopy, O-PTIR)を用いて、チムニー内部で微生物が生息する箇所を詳細に解析した。また、別に作成した同サイトのチムニー薄片試料
を対象に、大型放射光施設(SPring-8)の軟X線光物性ビームラインBL17SUにて解析した結果とも比較した。R5年度の結果は、R4年度分とまとめ、論文化を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

R5年度末に結果を取りまとめ論文を作成し国際誌へ投稿を行ったが、データの追加と再投稿が必要となった。補助事業の目的をより精緻に達成するための研究の実施や論文投稿などを、R6年度に行うことになった。

今後の研究の推進方策

R6年4月の時点で必要な追加実験は完了しているので、再投稿のための準備を行なっているところである。

次年度使用額が生じた理由

R5年度末に結果を取りまとめ論文を作成し国際誌へ投稿を行ったが、データの追加と再投稿が必要となった。論文投稿費用のため、オープンアクセス料と英文校閲費が必要となったため、次年度使用額が生じた。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2023

すべて 雑誌論文 (1件) (うちオープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] Genome-resolved meta-omics unveils rock-hosted lifestyle of enigmatic DPANN archaea2023

    • 著者名/発表者名
      Takamiya Hinako、Kouduka Mariko、Kato Shingo、Suga Hiroki、Oura Masaki、Yokoyama Tadashi、Suzuki Michio、Mori Masaru、Kanai Akio、Suzuki Yohey
    • 雑誌名

      biorxiv

      巻: 6 ページ: 1-34

    • DOI

      10.1101/2023.06.16.545063

    • オープンアクセス

URL: 

公開日: 2024-12-25  

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