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2023 年度 実績報告書

シングルセルグライコミクスによる膵がん幹細胞糖鎖マーカーの探索

研究課題

研究課題/領域番号 22K19471
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

舘野 浩章  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (30450670)

研究分担者 下村 治  筑波大学, 医学医療系, 講師 (60808070)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2024-03-31
キーワード膵癌 / 糖鎖 / シングルセル
研究実績の概要

膵がんの5年生存率は未だ10%未満であり、新たな治療診断技術の開発が世界中で切望されている。細胞の最表層に存在する糖鎖はがん化に伴い劇的に変化することから、新たな創薬標的として期待されている。申請者らは最近、個々の細胞に発現する糖鎖とRNAを同時解析する世界初の技術(scGR-seq)を開発した。本研究では、scGR-seqを用いて患者由来膵がん腫瘍組織を解析することで、腫瘍組織を構成する個々の細胞に発現する糖鎖とRNAの情報を取得するとともに、がん幹細胞の新たな糖鎖マーカーを同定することを目的とした。本研究で新たに同定したがん幹細胞糖鎖マーカーは、膵がんの新たな創薬標的として医療応用を目指す。本年度はドロップレット技術をscGR-seqに導入することで、1万個の単一細胞を一斉解析する技術、ドロップレット型scGR-seq、を開発し、論文発表した。本技術を用いて膵癌細胞株と正常膵管細胞の解析を行い、フローサイトメトリーで得られたデータと比較検証した。その結果、scGR-seqで得られたデータは、フローサイトメトリーで得られた結果と高い相関を示すことがわかった。さらにドロップレット型scGR-seqを用いて膵癌オルガノイド及び膵癌患者組織の解析を行い、ClassicalからBasalに移行する過程の糖鎖構造変化を解析するとともに膵癌サブタイプごとの糖鎖マーカーを同定した。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 4件、 招待講演 6件)

  • [雑誌論文] Droplet‐Based Glycan and RNA Sequencing for Profiling the Distinct Cellular Glyco‐States in Single Cells2024

    • 著者名/発表者名
      Keisham Sunanda、Saito Sayoko、Kowashi Satori、Tateno Hiroaki
    • 雑誌名

      Small Methods

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1002/smtd.202301338

    • 査読あり
  • [学会発表] Single-cell glycomic profiling by sequencing2024

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      ASEAN-Japan Consortium on Nanopore and Emerging Technologies
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 1細胞グライコームマッピング法の開発と神経科学への応用2024

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      第129回日本解剖学会総会・全国学術集会 シンポジウム
    • 招待講演
  • [学会発表] Mapping the cellular glyco-states in single cells2023

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      2023 Korean Sciety for Glycoscience Annual Meeting
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Droplet-based Glycan and RNA Sequencing for Profiling the Distinct Cellular Glyco-states in Single Cells2023

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      Glyco26
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] グライコミクスによる膵癌診断・治療法の開発2023

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      第36回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • 招待講演
  • [学会発表] Application of Glycotechnology to Tissue Engineering and Regenerative Medicine2023

    • 著者名/発表者名
      舘野浩章
    • 学会等名
      TERMIS-AP 2023 Conference
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2024-12-25  

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