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2022 年度 実施状況報告書

尿中細胞の深層学習・画像解析による腎疾患早期診断方法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 22K19511
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

林 香  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 教授 (60445294)

研究分担者 伊藤 裕  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 教授 (40252457)
菱川 彰人  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (50867489)
楠本 大  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (70571727)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2025-03-31
キーワード慢性腎臓病 / 尿中赤血球 / Deep learning
研究実績の概要

本研究では、畳み込みニューラルネットワークを用いた画像解析により、尿中の細胞成分を認識し、1)糸球体疾患を示唆する変形赤血球の質的診断、2)腎疾患の活動性を示唆する尿中ポドサイトの認識を目指す。更に3)臨床データ・腎生検組織標本との統合的解析を行う。2022年度は、変形赤血球の質的診断を目指して研究を開始した。
血尿を認めた場合、尿沈渣の観察により、出血部位が腎糸球体(糸球体性血尿)か糸球体以外の部位によるものか(非糸球体性血尿)を鑑別することができる。糸球体性血尿では、赤血球が糸球体基底膜を通過する際の機械的損傷や尿細管を通過する際の急激な浸透圧変化などで変形し、変形赤血球(dysmorphic RBC)となる。本研究では顕微鏡的血尿を指摘され、腎臓内科外来に通院中、腎生検目的に検査入院した症例から尿検体を採取し検討する。尿沈渣標本を作成後、専門の臨床検査技師により変形赤血球(dysmorphic RBC)、均一赤血球(isomorphic RBC)をラベル付けし、教師データを作成する。今までの画像認識研究の経験よりおおよそ1-3万個の赤血球画像を標識することで十分な機械学習が可能と考えられており、実現可能な数である。機械学習に際しては、慶應AIメディカルセンターで利用している既存のGPUサーバーを利用し、教師データでの学習後に正診率を検証する。既に教師データの取り込みと学習を開始している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

適切な教師データの取得およびデータ解析の環境整備に時間を要したため、教師データの取り込みと変形赤血球と非変形赤血球の機械学習をおこなっている段階である。

今後の研究の推進方策

引き続き教師データの取り込みを行い、学習の精度を高めていく予定である。尿中赤血球の機械学習がある程度軌道に乗った段階で、尿中ポドサイトの染色による明確化と形態認識についても並行して進める予定である。

次年度使用額が生じた理由

端数の金額(113円)が残金として残ったが、次年度の培養細胞実験における消耗品費として、次年度予算と合わせて使用を予定している。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件)

  • [雑誌論文] Significance of podocyte DNA damage and glomerular DNA methylation in CKD patients with proteinuria2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto Norifumi、Hayashi Kaori、Hishikawa Akihito、Hashiguchi Akinori、Nakamichi Ran、Sugita-Nishimura Erina、Yoshida-Hama Eriko、Azegami Tatsuhiko、Nakayama Takashin、Itoh Hiroshi
    • 雑誌名

      Hypertension Research

      巻: 46 ページ: 1000~1008

    • DOI

      10.1038/s41440-023-01169-2

  • [雑誌論文] DNA-damaged podocyte-CD8 T?cell crosstalk exacerbates kidney injury by altering DNA methylation2023

    • 著者名/発表者名
      Nakamichi Ran、Hishikawa Akihito、Chikuma Shunsuke、Yoshimura Akihiko、Sasaki Takashi、Hashiguchi Akinori、Abe Takaya、Tokuhara Tomoko、Yoshimoto Norifumi、Nishimura Erina Sugita、Hama Eriko Yoshida、Azegami Tatsuhiko、Nakayama Takashin、Hayashi Kaori、Itoh Hiroshi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 ページ: 112302~112302

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112302

  • [雑誌論文] Plasminogen activator inhibitor 1 is not a major causative factor for exacerbation in a mouse model of SARS-CoV-2 infection2023

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Takashin、Azegami Tatsuhiko、Kiso Maki、Imai Masaki、Uraki Ryuta、Hayashi Kaori、Hishikawa Akihito、Yoshimoto Norifumi、Nakamichi Ran、Sugita-Nishimura Erina、Yoshida-Hama Eriko、Kawaoka Yoshihiro、Itoh Hiroshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41598-023-30305-8

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Vaccination against connective tissue growth factor attenuates the development of renal fibrosis2022

    • 著者名/発表者名
      Nakayama Takashin、Azegami Tatsuhiko、Hayashi Kaori、Hishikawa Akihito、Yoshimoto Norifumi、Nakamichi Ran、Sugita Erina、Itoh Hiroshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41598-022-15118-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Altered DNA methylation in kidney disease: useful markers and therapeutic targets2022

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Kaori
    • 雑誌名

      Clinical and Experimental Nephrology

      巻: 26 ページ: 309~315

    • DOI

      10.1007/s10157-022-02181-5

    • 査読あり / オープンアクセス

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公開日: 2023-12-25  

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