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2023 年度 実施状況報告書

腸内細菌から動脈硬化を予測する:AIを用いた挑戦

研究課題

研究課題/領域番号 22K19660
研究機関福岡大学

研究代表者

有馬 久富  福岡大学, 医学部, 教授 (20437784)

研究分担者 前田 俊樹  福岡大学, 医学部, 准教授 (50555555)
原田 勝孝  福岡大学, 経済学部, 准教授 (30738810)
西 巧  福岡県保健環境研究所, その他部局等, 研究員 (20760739)
三浦 伸一郎  福岡大学, 医学部, 教授 (20343709)
小川 正浩  福岡大学, 医学部, 教授 (70341485)
廣松 賢治  福岡大学, 医学部, 教授 (80252237)
平井 郁仁  福岡大学, 医学部, 教授 (10389356)
吉村 力  福岡大学, 医学部, 准教授 (20511885)
川添 美紀  福岡大学, 医学部, 講師 (30469374)
佐藤 敦  福岡大学, 医学部, 講師 (60816263)
阿部 真紀子  福岡大学, 医学部, 講師 (10909617)
研究期間 (年度) 2022-06-30 – 2025-03-31
キーワード腸内細菌 / 動脈硬化 / AI / 機械学習
研究実績の概要

本研究の目的は、現在進行中である福岡県地域一般住民1500名を対象とする前向きコホート研究のデータをもちいて、人工知能(AI)の一分野である機械学習を実施し、動脈硬化(胸腹部CTで評価した冠動脈・大動脈石灰化)を予測する腸内細菌を明らかにすることである。
2023年度は、以下の作業をおこなった。
前向きコホート研究:福岡県の地域一般住民を対象とした前向きコホート研究(福岡動脈硬化疫学研究:FESTA)を2019年に開始しているが、2023年度は長崎県を新たなフィールドに加えた。福岡県において129名、長崎県において47名、計176名から研究参加の同意を取得した。そのうち、173名については、胸腹部CT検査まで実施した。2023年度までの研究参加者総数は約1100名で、そのうち約800名において胸腹部CT検査を実施している。
フィールド調査:参加者から文書による研究参加の同意を得て、以下の調査をおこなった。①問診(喫煙歴、飲酒歴、病歴、生活習慣など)、身体計測、血液生化学検査、尿検査、②携帯型活動量計による活動量測定、睡眠検査、③Multidetector CT(MDCT):冠動脈・大動脈石灰化については、トレーニングされた研究者が胸腹部CTのDICOM画像および医用画像解析ソフトを用いて評価し、Agatston scoreを算出した。④腸内細菌の同定:便検体を採取し、次世代シークエンサーを用いて16S rRNA遺伝子のV3-V4領域を系統的に解析し、属・種よりさらに細かいOTU(Operational Taxonomic Unit)レベルまで同定した。
データベースの整備:検査結果のデータ入力を行った。また、外れ値や欠損値を随時確認することにより、データクリーニングを実施した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新たに176名から同意を取得し、腸内細菌検査、胸腹部CT検査、画像解析、データベースの整備を実施した。したがって、おおむね順調に進展していると考える。

今後の研究の推進方策

今後も、以下の作業をおこなってゆく
前向きコホート研究:福岡県における住民健診受診者に、研究者から研究内容の説明を行い、研究参加の同意をいただく。
フィールド調査:参加者から文書による研究参加の同意を得て、以下の調査をおこなう。①問診(喫煙歴、飲酒歴、病歴、生活習慣など)、身体計測、血液生化学検査、尿検査、②携帯型活動量計による活動量測定、睡眠検査、③Multidetector CT(MDCT):冠動脈・大動脈石灰化については、トレーニングされた研究者が胸腹部CTのDICOM画像および医用画像解析ソフトを用いて評価し、Agatston scoreを算出する。④腸内細菌の同定:便検体を採取し、次世代シークエンサーを用いて16S rRNA遺伝子のV3-V4領域を系統的に解析し、属・種よりさらに細かいOTU(Operational Taxonomic Unit)レベルまで同定する。
データベースの整備:検査結果のデータ入力を行う。また、外れ値や欠損値を随時確認することにより、データクリーニングを実施する。
人工知能(AI)の一分野である機械学習を用いた検討:機械学習のひとつであるスパース・モデリングの手法を用いて、動脈硬化の進展/予防につながる腸内細菌を明らかにする。

次年度使用額が生じた理由

研究を手伝っていただいているアルバイトの人件費が想定よりも少なかったため、次年度使用額が生じた。次年度使用額については、研究の実施に必要な胸腹部CT検査・腸内細菌検査などの費用にあてる予定である。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The gut microbiota and coronary artery calcification in Japanese men2024

    • 著者名/発表者名
      Okami Yukiko、Arima Hisatomi、Kondo Keiko、Hexun Zhang、Yano Yuichiro、Kadota Aya、Torii Sayuki、Hisamatsu Takashi、Fujiyoshi Akira、Kadowaki Sayaka、Watanabe Yoshiyuki、Andoh Akira、Nakagawa Yoshihisa、Ueshima Hirotsugu、Miura Katsuyuki
    • 雑誌名

      American Heart Journal

      巻: 267 ページ: 12~21

    • DOI

      10.1016/j.ahj.2023.09.009

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of gut microbiome with COPD in Japanese male residents: the SESSA study2024

    • 著者名/発表者名
      Kawashima Satoru、Kinose Daisuke、Arima Hisatomi、Kondo Keiko、Yamazaki Akio、Uchida Yasuki、Nakagawa Hiroaki、Yamaguchi Masafumi、Segawa Hiroyoshi、Torii Sayuki、Okami Yukiko、Kadota Aya、Yano Yuichiro、Andoh Akira、Miura Katsuyuki、Nakano Yasutaka、Ueshima Hirotsugu
    • 雑誌名

      ERJ Open Research

      巻: 10 ページ: 00788~2023

    • DOI

      10.1183/23120541.00788-2023

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Relationship between abdominal circumference and the incidence of hyperuricemia in the general Japanese population2024

    • 著者名/発表者名
      Kawano Kazumi、Ueno Tamami、Maeda Toshiki、Nohara Chihiro、Maki Kaori、Iwanaga Kazuyo、Morinaga Akiko、Funakoshi Shunsuke、Abe Makiko、Satoh Atsushi、Kawazoe Miki、Yoshimura Chikara、Takahashi Koji、Tada Kazuhiro、Ito Kenji、Yasuno Tetsuhiko、Mukobara Shigeaki、Kawanami Daiji、Masutani Kosuke、Arima Hisatomi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 14 ページ: 4573

    • DOI

      10.1038/s41598-024-55008-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Association of step counts with cognitive function in apparently healthy middle-aged and older Japanese men2024

    • 著者名/発表者名
      Shibukawa Takeshi、Fujiyoshi Akira、Moniruzzaman Mohammad、Miyagawa Naoko、Kadota Aya、Kondo Keiko、Saito Yoshino、Kadowaki Sayaka、Hisamatsu Takashi、Yano Yuichiro、Arima Hisatomi、Tooyama Ikuo、Ueshima Hirotsugu、Miura Katsuyuki
    • 雑誌名

      Preventive Medicine Reports

      巻: 38 ページ: 102615~102615

    • DOI

      10.1016/j.pmedr.2024.102615

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association between serum ALT levels and incidence of new-onset diabetes in general population of Japanese: a longitudinal observational study (ISSA-CKD)2023

    • 著者名/発表者名
      Morinaga Akiko、Iwanaga Kazuyo、Maki Kaori、Ueno Tamami、Kawano Kazumi、Funakoshi Shunsuke、Yamanokuchi Toshitaka、Tsuji Masayoshi、Abe Makiko、Satoh Atsushi、Kawazoe Miki、Maeda Toshiki、Yoshimura Chikara、Takahashi Koji、Tada Kazuhiro、Ito Kenji、Yasuno Tetsuhiko、Kawanami Daiji、Masutani Kosuke、Arima Hisatomi
    • 雑誌名

      BMJ Open

      巻: 13 ページ: e074007~e074007

    • DOI

      10.1136/bmjopen-2023-074007

    • 査読あり
  • [備考] 福岡大学医学部 衛生・公衆衛生学教室 研究紹介

    • URL

      https://www.med.fukuoka-u.ac.jp/p_health/research.html

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公開日: 2024-12-25  

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