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2023 年度 研究成果報告書

Measurement of the mycorrhizal hyphal turnover through soil imaging: Resolving the image analysis bottleneck with AI

研究課題

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研究課題/領域番号 22K20595
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0603:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
研究機関国立研究開発法人森林研究・整備機構

研究代表者

SCHAEFER Holger・Christian  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 研究員 (80897231)

研究期間 (年度) 2022-08-31 – 2024-03-31
キーワード森林炭素循環 / 土壌微生物 / 菌根菌 / 菌糸 / 土壌断面撮影 / 画像分析 / 人工知能
研究成果の概要

本研究では、人工知能(AI)を活用して土壌断面画像上の菌糸量を自動的に測定する手法を開発した。まず、自作の撮影装置を用いて土壌断面の高解像画像を撮り、画像の一部において菌糸を手動でマークした。マークした画像を用いて、AIが菌糸と土壌背景のピクセルを識別できるように学習を行った。学習させたAIの活用により、土壌断面画像の分析時間を数日間(手動分析)から数分(AIによる自動分析)に減らせることができた。また、AIによる自動画像分析の正確度は高かった。

自由記述の分野

森林生態学、微生物生態学

研究成果の学術的意義や社会的意義

殆どの樹木は菌根菌と共生し、炭素を糖類として菌根菌に供給するため、森林土壌における菌糸バイオマスの変動を明らかにすることが、森林炭素循環の動態の理解・予測に向けて重要である。本研究では、人工知能を活用して土壌断面画像における菌糸量変動を手動分析より十分に速く、正確に自動測定できる手法を開発した。開発した手法は森林土壌における炭素循環を定量化する今後の研究に役立つと考えられる。

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公開日: 2025-01-30  

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