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2023 年度 実績報告書

Nonsense mediated mRNA decayによるRNAウイルスゲノムの品質管理と進化制御

研究課題

研究課題/領域番号 22K20759
研究機関京都大学

研究代表者

小森園 亮  京都大学, 医生物学研究所, 特定助教 (10964637)

研究期間 (年度) 2022-08-31 – 2024-03-31
キーワードRNAウイルス / ウイルス進化 / RNA分解
研究実績の概要

急性感染性および持続感染性ウイルスにおけるNMD機構の影響を解析するため、RNAウイルスの1種であるコクサッキーウイルスB3(CVB3)を複数の細胞株に接種し、細胞生存性を評価した結果、ヒトアストロサイト由来CCF-STTG1, KINGS-1, Becker細胞株およびヒト膵臓がん由来PANC-1細胞株で細胞傷害性なしに持続的に子孫ウイルス粒子を産生することが明らかとなった。以上より、1種のRNAウイルスで急性感染および持続感染両方の感染スタイルにおけるNMD機構の影響、かつ経時的な配列解析が可能となった。
次に、NMD機構の因子であるUPF1/2/3B, SMG1/5/6/7遺伝子ノックダウン細胞をHEK293Tおよびヒトオリゴデンドロサイト由来HOG細胞株を用いて樹立した。これらNMDノックダウン細胞を用いてCVB3、ボルナ病ウイルス(BoDV-1)を接種し感染性をqRT-PCR、IFAおよびtitration assayにより評価した結果、shUPF1およびshUPF2細胞においてCVB3では有意に上清中のウイルスRNA量が上昇し、BoDV-1では細胞内ウイルスゲノムRNA量が上昇した。同様に、NMD阻害剤であるNMDI-14をHEK293T, HOG, Huh7細胞に投与後CVB3およびBoDV-1を接種した結果、細胞内ウイルスRNA量が有意に上昇した。またCCF-STTG1およびPANC-1細胞にCVB3を接種後NMDI-14を投与した結果、同様にウイルスRNA量が上昇した。以上の結果より、NMD機構は急性感染性および持続感染性問わずRNAウイルスの複製を制御していることが示唆された。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Contact-number-driven virus evolution: A multi-level modeling framework for the evolution of acute or persistent RNA virus infection2023

    • 著者名/発表者名
      Sunagawa Junya、Komorizono Ryo、Park Hyeongki、Hart William S.、Thompson Robin N.、Makino Akiko、Tomonaga Keizo、Iwami Shingo、Yamaguchi Ryo
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 19 ページ: -

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1011173

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Reverse genetics of parrot bornavirus 4 reveals a unique splicing of the glycoprotein gene that affects viral propagation2023

    • 著者名/発表者名
      Komorizono Ryo、Fujino Kan、Kessler Susanne、Runge Solveig、Kanda Takehiro、Horie Masayuki、Makino Akiko、Rubbenstroth Dennis、Tomonaga Keizo
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: 97 ページ: -

    • DOI

      10.1128/jvi.00509-23

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Isolation may select for earlier and higher peak viral load but shorter duration in SARS-CoV-2 evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Sunagawa Junya、Park Hyeongki、Kim Kwang Su、Komorizono Ryo、Choi Sooyoun、Ramirez Torres Lucia、Woo Joohyeon、Jeong Yong Dam、Hart William S.、Thompson Robin N.、Aihara Kazuyuki、Iwami Shingo、Yamaguchi Ryo
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41467-023-43043-2

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Excel-REGENS: The ex vivo gene cell therapy using REVec-based genetically engineered stem cells.2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Komorizono, Shima Yoshizumi, Keizo Tomonaga
    • 学会等名
      第70回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] ボルナウイルスベクターを用いた遺伝子細胞治療薬の開発2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Komorizono
    • 学会等名
      第29回日本遺伝子細胞治療学会学術集会
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA Virus Based Episomal Vector for Highly Efficient Genetic Engineering of Human Mesenchymal Stromal Cells2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Komorizono, Shima Yoshizumi, Miya Kawanaka, Keizo Tomonaga
    • 学会等名
      American Society of Gene & Cell Therapy The 26th Annual Meeting
    • 国際学会
  • [学会発表] 自己複製型RNAウイルスベクター「REVec」の応用2023

    • 著者名/発表者名
      小森園亮
    • 学会等名
      BioJapan2023
  • [産業財産権] ボルナウイルスベクターを利用した細胞の遺伝子改変と当該細胞を用いた細胞治療薬2024

    • 発明者名
      小森園亮、朝長啓造
    • 権利者名
      京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2024- 45885

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公開日: 2024-12-25  

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