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2023 年度 実施状況報告書

植物ウイルスの混合感染における相互作用と進化機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22KJ0140
配分区分基金
研究機関北海道大学

研究代表者

川久保 修佑  北海道大学, 農学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2023-03-08 – 2025-03-31
キーワードウイルス学 / 進化 / RNAサイレンシング / 宿主適応 / 分子系統学
研究実績の概要

ポティウイルス属は200以上のウイルス種によって構成される植物RNAウイルス最大の分類群であり、単子葉植物から双子葉植物までを含む極めて広範な宿主域を持つが、宿主域がどのように決定されるかは、未だ明らかでないことが多い。ポティウイルスの1種リーキ黄色条斑ウイルス(LYSV)はニンニクの重要病原ウイルスであるが、ニンニク以外のネギ属植物でも感染が報告されており、異なる宿主への適応過程や分子機構は明らかにされてない。LYSVが感染しているネギ属植物を採集し、ウイルスのゲノム解析を行なったところ、LYSV はP1 遺伝子に68 アミノ酸の欠失を持つS-type と欠失を持たないN-type に対応した2つの分子系統グループに13 世紀ごろ分岐したことが明らかになった。また、birth-death modelを用いた適応度推定によりS-typeの方がN-typeよりも高い適応度を持つことが示された。さらに、N-typeの分離株の中にはリーキ特異的に感染するLYSV からなる単系統グループが存在することが明らかになった。リーキの変異種と異種間交雑種を調査すると、リーキ特異的系統グループに属するLYSV 分離株の感染が確認された。宿主適応における進化方向性を決定する重要因子として、ポティウイルスが持つ主要なRNAサイレンシングサプレッサー(RSS)タンパク質であるP1とHC-Proに着目し、タンパク質発現系でRSS活性を定量した。リーキ特異的系統グループに属するLYSVがコードするP1とHC-Proをリーキ細胞で共発現させると、ニンニクに感染するLYSVよりも高いRSS 活性を示した。RSS 活性を変化させることにより、異なる宿主に適応しそれが進化方向性を決定する一因であることを、系統樹情報の解析と分子生物学実験を融合したアプローチにより示した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の計画通り、ウイルスと宿主の相互作用がどのように互いの進化を推進してきたのかを描出することができた。
また本研究成果をまとめた論文は、米国微生物学会が発行する国際誌Microbiology Spectrumに掲載されている。

今後の研究の推進方策

2023年度の研究成果より、ウイルスの進化的戦略が様々な外的要因との相互作用のもと動的に変化していることが示唆された。今後は、このようなウイルス進化を追跡および推定したデータに基づき、ウイルスの未来の進化が予測可能かどうかについても迫りたい。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] National Research Council of Italy(イタリア)

    • 国名
      イタリア
    • 外国機関名
      National Research Council of Italy
  • [雑誌論文] An Inexpensive System for Rapid and Accurate On-site Detection of Garlic-Infected Viruses by Agarose Gel Electrophoresis Followed by Array Assay2024

    • 著者名/発表者名
      Furuta Kazuyoshi、Kawakubo Shusuke、Sasaki Jun、Masuta Chikara
    • 雑誌名

      The Plant Pathology Journal

      巻: 40 ページ: 40~47

    • DOI

      10.5423/ppj.ft.11.2023.0146

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Two mutually exclusive evolutionary scenarios for allexiviruses that overcome host RNA silencing and autophagy by regulating viral CRP expression2023

    • 著者名/発表者名
      Kim Hangil、Kawakubo Shusuke、Takahashi Haruna、Masuta Chikara
    • 雑誌名

      PLOS Pathogens

      巻: 19 ページ: e1011457

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1011457

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Host-specific adaptation drove the coevolution of leek yellow stripe virus and Allium plants2023

    • 著者名/発表者名
      Kawakubo Shusuke、Kim Hangil、Takeshita Minoru、Masuta Chikara
    • 雑誌名

      Microbiology Spectrum

      巻: 11 ページ: 02340-23

    • DOI

      10.1128/SPECTRUM.02340-23

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] キュウリモザイクウイルスサテライトRNAの発生年代推定とその起源2024

    • 著者名/発表者名
      川久保修佑, Hangil Kim, 増田税
    • 学会等名
      令和6年度日本植物病理学会本大会
  • [学会発表] Coevolution of leek yellow stripe virus and Allium plants driven by host adaptive diversification and protein involvement of RNA silencing suppressor2023

    • 著者名/発表者名
      Shusuke Kawakubo, Hangil Kim, Minoru Takeshita, Chikara Masuta
    • 学会等名
      8th European Congress of Virology
    • 国際学会
  • [学会発表] ニンニク病原性ウイルスの疫学動態と関与する分子メカニズム2023

    • 著者名/発表者名
      川久保修佑
    • 学会等名
      第17回ウイルス学キャンプ in 湯河原
  • [学会発表] Host-adaptive evolution of leek yellow stripe virus determined by viral RNA silencing suppressor activity in a host-dependent manner2023

    • 著者名/発表者名
      川久保 修佑, Hangil Kim, 竹下 稔, 増田 税
    • 学会等名
      第70回日本ウイルス学会学術集会
  • [学会発表] Phylogeny-driven study on host adaptive co-evolution of garlic potyvirus and Allium plants2023

    • 著者名/発表者名
      Shusuke Kawakubo
    • 学会等名
      2023 IPMB Spotlights Seminars on Plant Viruses
    • 国際学会

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公開日: 2024-12-25  

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