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2021 年度 実績報告書

植物受精卵の発生制御機構を司る核内クロマチン構造変遷と父母因子の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 21J01093
配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

戸田 絵梨香  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2021-04-28 – 2024-03-31
キーワード受精卵 / 配偶子 / 核合一 / 父母因子 / イネ / 発生
研究実績の概要

被子植物の受精卵では、卵核と精核が融合し受精卵核となったのちに第一分裂が起こり、その後の胚発生を進行させる。そのため、受精卵発生の正常な進行に向けては、受精後の雌雄核の合一及びそれに伴うダイナミックな核内クロマチンの構造変化や遺伝子発現変動による受精卵発生制御機構の関与が想定される。そこで本研究では、雌雄核の合一時期にあたる受精卵の初期発生過程に焦点を当て、受精卵発生制御機構を司る父母因子の役割およびその分子基盤の一端の解明に取り組んでいる。
配偶子融合直後からの遺伝子発現プロファイルを明らかにするため、イネ初期受精卵の時系列トランスクリプトーム解析を行った。その結果、各ステージの遺伝子発現データが再現性よく得られ、受精卵の初期発生過程で発現変動を示す遺伝子群が同定された。また、受精卵内における父性アリルからの転写開始時期が、雌雄核の融合開始時期と一致していることが示唆された。さらに、受精卵の初期発生過程において、母方依存的な発現から両アリル発現へとゲノムワイドな発現プロファイルの移行が確認された。これら遺伝子発現データを基に、受精直後から発現変動を示す遺伝子、および、受精卵の初期発生過程において片親アリル依存的な発現を示す遺伝子の絞り込みを進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

イネ初期受精卵の時系列トランスクリプトームデータを基に、雌雄核の合一時期にあたる初期発生過程における遺伝子発現プロファイルの解析および機能解析に向けた発現変動遺伝子の選定を進めている。

今後の研究の推進方策

①イネ受精卵の初期発生過程における発現変動遺伝子の機能解析:イネ受精卵の遺伝子発現データから同定された発現変動遺伝子群の中から、主に片親アリル依存的な発現を示し、かつ、受精卵発生制御への関与が見込まれる候補遺伝子を選定し、イネあるいはシロイヌナズナを用いた標的変異体系統の作出を行う。作出した標的変異体の表現型を解析し、稔実率の低下など、受精・発生不全が見込まれる系統を選抜しその機能解析を進める。
②イネ配偶子・受精卵のエピゲノム解析に向けた予備的実験:受精卵核内のクロマチン構造変化の解析に向けて、解析試料の調製法の検討を行う。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Regulatory functions of ROS dynamics via glutathione metabolism and glutathione peroxidase activity in developing rice zygote2021

    • 著者名/発表者名
      Rattanawong Kasidit、Koiso Narumi、Toda Erika、Kinoshita Atsuko、Tanaka Mari、Tsuji Hiroyuki、Okamoto Takashi
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 108 ページ: 1097~1115

    • DOI

      10.1111/tpj.15497

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Plant genome engineering from lab to field-a Keystone Symposia report2021

    • 著者名/発表者名
      Cable J, Ronald PC, Voytas D, Zhang F, Levy AA, Takatsuka A, Arimura S, Jacobsen SE, Toki S, Toda E, Gao C, Zhu J, Boch J, Van Eck J, Mahfouz M, Andersson M, Fridman E, Weiss T, Wang K, Qi Y, Jores T, Adams T, Bagchi R
    • 雑誌名

      Annals of the New York Academy of Sciences

      巻: 1506 ページ: 35~54

    • DOI

      10.1111/nyas.14675

    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Isolation of gametes and zygotes from Setaria viridis2021

    • 著者名/発表者名
      Toda Erika、Kiba Takatoshi、Kato Norio、Okamoto Takashi
    • 雑誌名

      BioRxiv

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1101/2021.11.01.466850

    • オープンアクセス
  • [学会発表] イネ受精卵への物質導入によるゲノム編集2021

    • 著者名/発表者名
      戸田絵梨香
    • 学会等名
      日本ゲノム編集学会第6回大会
  • [学会発表] イネ受精卵の最初期発生過程における遺伝子発現変動および父母因子の発現プロファイル2021

    • 著者名/発表者名
      戸田絵梨香, 越水静, 木下温子, 永田博基, 赤坂大輔, 大西由之佑, 東山哲也, 木下哲, 矢野健太郎, 岡本龍史
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] 野生蘭ネジバナにおける単一受精説の検証2021

    • 著者名/発表者名
      水上茜, 福村薫, 加藤ふゆき, 戸田絵梨香, 時田(松浦)公美, 鈴木孝征, 東山哲也
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] キメラリプレッサーを用いたイネ卵細胞の分裂・発生を誘導する新規転写因子の探索2021

    • 著者名/発表者名
      澤本陸, 大島良美, 貴嶋紗久, 光田展隆, 池田美穂, 高崎寛則, 高木優, 戸田絵梨香, 岡本龍史
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] イネ受精卵発生を誘導するOsASGR-BBML1の標的遺伝子群の同定2021

    • 著者名/発表者名
      増尾心之介, 大島良美, 貴嶋紗久, 光田展隆, 池田美穂, 高崎寛則, 高木優, 戸田絵梨香, 木下温子, 岡本龍史
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] Embryo dependent and independent gene expression in endosperm2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y, Takasaki H, Maruyama D, Toda E, Okamoto T, Takagi-Ohme M
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
  • [学会発表] イネ受精卵の最初期発生過程における遺伝子発現プロファイルの解析2021

    • 著者名/発表者名
      戸田絵梨香、越水静、木下温子、東山哲也、矢野健太郎、岡本龍史
    • 学会等名
      第4回植物インフォマティクス研究会・年会
  • [学会発表] Functional analysis of the endosperm genes expressed in an embryonic development-dependent manner in Arabidopsis2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang Y, Maruyama D, Toda E, Okamoto T, Oshima Y, Mitsuda N, Takasaki H, Takagi-Ohme M
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会

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公開日: 2023-12-25  

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