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2021 年度 実績報告書

分子進化的手法による高性能な蛍光免疫センサーQuenchbody構築法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 21J21386
配分区分補助金
研究機関東京工業大学

研究代表者

井上 暁人  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2021-04-28 – 2024-03-31
キーワードバイオテクノロジー / タンパク質工学 / 抗体工学 / ケミカルバイオロジー / 分子進化 / 蛍光 / 酵母提示系 / 免疫測定
研究実績の概要

1. 酵母提示抗体ライブラリを用いた高性能なQ-body選択
研究協力者である徳島大学村上博士より分与を受けた30種余りのヒト血清アルブミン結合ナノ抗体を材料に,これらをコイルドコイル形成ペプチドE4と融合して酵母細胞表面で提示させ,外部からFITC-TAMRA標識コイルドコイル形成ペプチドK4を付加してQ-body化し,抗原応答の高いQ-bodyを選択した。この結果得られた,抗原依存的蛍光応答の高いクローンは,大腸菌で発現させてQ-body化しても他のクローンより高い応答を示した。さらに酵母表面やビーズ上で蛍光応答が向上することが新たにわかり、これらの本研究成果をまとめて論文発表を行った(Sci. Rep.)。
2. ランダムなトリプトファン残基挿入によるQ-body応答の向上
1で選択されたナノ抗体をテンプレートとし、その超可変領域(CDR)のチロシン残基にトリプトファン残基をランダムに導入したライブラリから抗原結合能を示し、かつクエンチを示すナノ抗体を選択した。その結果、複数のトリプトファン残基を含む変異体が獲得された。さらに選択された変異体を大腸菌で発現させ、蛍光応答を見ると抗原結合を損なうことなく、より高い応答を示すことが確認され、本手法を用いてナノ抗体を材料としたQ-bodyを分子進化させることに成功した。
3. 低分子認識VHHのQ-body応答の向上
低分子認識ナノ抗体としてはコルチゾールを認識するナノ抗体を新たなモデルとし、立体構造をもとにCDR1にトリプトファン残基の変異を導入した。その結果、野生型と比べて約2倍の蛍光応答を示すことが確認され、低分子認識ナノ抗体についても分子進化が可能であることが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本年度、想定していたQ-body用抗体ライブラリの構築には至らなかったが、タンパク質および低分子を認識するナノ抗体を分子進化させることに成功しており、おおむね順調といえる。
また学会発表については国内2件、国外2件と予定通り参加することができ、論文発表については共著者として1報、第一著者として1報とこちらも予定通り出版できている。

今後の研究の推進方策

1については、さらにより安定に多量体構造を形成するペプチドをC末端に付加することで、選択されたQ-bodyのさらなる感度向上を目指す。
2,3については得られた変異体に対してさらにランダム変異を加えることでQ-bodyとしての最大応答を目指す。
以上に加えて、Kruseらが開発した酵母提示ナノ抗体ライブラリをモデルとし、Q-body用抗体ライブラリの設計を検討するとともに、scFvまたはFab断片を材料としたQ-bodyについても酵母表面に提示することで本手法の拡張を目指す。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Rapid construction of fluorescence quenching-based immunosensor Q-bodies using α-helical coiled-coil peptides2021

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Takanobu、Inoue Akihito、Kitaguchi Tetsuya、Ueda Hiroshi
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 57 ページ: 8206~8209

    • DOI

      10.1039/D1CC02605D

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation and selection of potent fluorescent immunosensors by combining fluorescent peptide and nanobodies displayed on yeast surface2021

    • 著者名/発表者名
      Inoue Akihito、Yasuda Takanobu、Zhu Bo、Kitaguchi Tetsuya、Murakami Akikazu、Ueda Hiroshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 ページ: 22590

    • DOI

      10.1038/s41598-021-02022-7

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 酵母細胞表層提示系を用いた抗ヒト血清アルブミン(HSA) ナノ抗体由来“mini Q-body”の選択2021

    • 著者名/発表者名
      井上暁人, 安田貴信, 北口哲也, 村上明一, 上田宏
    • 学会等名
      第54回化学工学会秋季大会
  • [学会発表] 酵母提示系を用いたナノ抗体由来の蛍光免疫センサ“mini Q-body”選択法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      井上暁人, 安田貴信, 北口哲也, 村上明一, 上田宏
    • 学会等名
      第 73回生物工学会大会
  • [学会発表] Construction of mini Q-body using the nanobody to detect chemotherapy agent2021

    • 著者名/発表者名
      Inoue A., Ohmuro Y., Kitaguchi T., Ueda H.
    • 学会等名
      Biosensors2021
    • 国際学会
  • [学会発表] Construction of mini Q-body using the nanobody to detect chemotherapy agent2021

    • 著者名/発表者名
      Inoue A., Ohmuro Y., Kitaguchi T., Ueda H.
    • 学会等名
      VIB nanobody conference
    • 国際学会

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公開日: 2022-12-28   更新日: 2023-08-01  

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