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2021 年度 実績報告書

Cryo-EM による V-ATPase の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 20J00162
配分区分補助金
研究機関大阪大学

研究代表者

中西 温子  大阪大学, 超高圧電子顕微鏡センター, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2020-04-24 – 2023-03-31
キーワードCryo-electron microscopy / 低温電子顕微鏡 / V-ATPase / 構造解析
研究実績の概要

V-ATPase (液胞型 ATPase、以下 VoV1 と記す) は、細胞のほとんどの空胞系膜のほか、破骨細胞やがん細胞の細胞膜にも存在し、ATP の加水分解エネルギーを使いプロトンを輸送することで、細胞内外の酸性環境を制御している。VoV1 が形成する酸性環境は、細胞において多くの重要な役割を果たしている一方、VoV1 の機能・構造に関する十分な知見は得られていない。令和3年度の研究では、研究初年度に引き続き、構造解析を行うための哺乳類細胞由来 VoV1 の精製系確立を中心に研究を遂行し、ラット脳組織およびがん細胞から VoV1 を精製することに成功した。精製試料を負染色法にて観察したところ、安定的に精製された VoV1 複合体を確認することができた。次いで、低温電子顕微鏡 (Cryo-EM) による単粒子解析を行うための凍結試料を作製し、Cryo-EM 観察した結果、VoV1 と思われる密度を確認した。
一方、細胞内で機能している VoV1 の構造を解析するため、VoV1 が局在する細胞内オルガネラであるシナプス小胞を対象として、トモグラフィー解析を試みた。Cryo-EM を用いて、氷包埋したシナプス小胞の傾斜画像シリーズを取得し、3次元像を再構成した結果、より高分解能の構造解析に適した再構成像を得ることができなかった。解析結果から、傾斜画像間の位置合わせを高精度で行う必要性が示唆されたことから、試料作製方法を最適化する必要があることが明らかとなった。また、より高分解能で構造解析を行うための Cryo-EM 画像の収集方法についても現在検討を行なっている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究2年度目においては、構造解析を行うための哺乳類細胞由来 VoV1 の精製系を確立し、ラット脳組織だけでなく、がん細胞からも VoV1 を精製することができた。Cryo-EM 観察の結果、安定的に精製された VoV1 が観察されたことから、VoV1 の単粒子解析を行うための重要な一歩であると期待できる。一方、シナプス小胞のトモグラフィー解析については、傾斜画像間の位置合わせを高精度で行う必要性があることが明らかになった。一部に課題が残るものの、全体としては概ね順調に進展していると考えている。

今後の研究の推進方策

研究2年度目では、哺乳類細胞由来 VoV1 を精製し、Cryo-EM 観察することに成功した一方、単粒子解析に適した密度で凍結試料を作成することができなかった。今後においては、良好な密度で VoV1 を観察するため、VoV1 を吸着させる支持膜を選定するとともに、がん細胞における VoV1 の発現量を増やすような因子を探索する。また、シナプス小胞のトモグラフィー解析については、傾斜画像間の位置合わせを高精度で行うため、位置合わせを行うためのマーカーとなる金コロイド粒子の密度を最適化する。さらに、Cryo-EM 画像の収集方法を最適化することで、シナプス小胞に存在する VoV1 の高分解能構造解析を目指す。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 2021 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural snapshots of V/A-ATPase reveal the rotary catalytic mechanism of rotary ATPases2022

    • 著者名/発表者名
      Kishikawa J.、Nakanishi A.、Nakano A.、Saeki S.、Furuta A.、Kato T.、Mistuoka K.、Yokoyama K.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 ページ: -

    • DOI

      10.1038/s41467-022-28832-5

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 好熱菌FoF1の動的解析によって回転機構を明らかにする2022

    • 著者名/発表者名
      中野敦樹、中西温子、岸川淳一、横山謙
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議
  • [学会発表] アクチン繊維とファシン複合体のクライオ電子線トモグラフィーとサブトモグラム平均化2021

    • 著者名/発表者名
      中西温子、梶村直子、栗田俊、安永卓生、光岡薫
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第 77 回学術講演会
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるATP合成酵素の回転機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      中野敦樹、中西温子、岸川淳一、横山謙
    • 学会等名
      第 94 回 日本生化学会大会
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析によるATPγS存在下V/A-ATPaseの中間体構造2021

    • 著者名/発表者名
      佐伯詩織、岸川淳一、中西温子、中野敦樹、横山謙
    • 学会等名
      第 94 回 日本生化学会大会
  • [学会発表] Structural intermediates in rotary V/A-ATPase from initial to steady state visualized by time-resolved cryo-electron microscopy2021

    • 著者名/発表者名
      中西温子、岸川淳一、西澤知宏、光岡薫、横山謙
    • 学会等名
      第 59 回 日本生物物理学会年会
  • [備考] クライオ電子顕微鏡によるスナップショットにより回転分子モータータンパク質の回転機構を解明

    • URL

      https://www.kyoto-su.ac.jp/news/2022_ls/20220325_400a_ronbun.html

URL: 

公開日: 2022-12-28   更新日: 2023-08-01  

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