| 研究課題/領域番号 |
19J40070
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究機関 | 国立研究開発法人国立国際医療研究センター |
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研究代表者 |
矢原 寛子 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, ゲノム医科学プロジェクト, 特別研究員(RPD)
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| 研究期間 (年度) |
2020-01-06 – 2024-03-31
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| キーワード | 顎骨骨髄炎 / 遺伝的要因 / バイオマーカー / 微生物叢 |
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| 研究実績の概要 |
顎骨骨髄炎の中でも免疫系の恒常性維持に異常を来した疾患に焦点を当てた研究計画の中で、本年度は、①当該疾患に関する簡便で臨床応用可能なバイオマーカーを明らかにし、②疾患の環境因子として、特徴的で発症の引き金になり得る口腔内微生物叢を明らかにすることを目指し、末梢血採血と唾液採取による検体収集を行い、末梢血採血と唾液採取により収集した検体から一連のデータを取得する計画であった。その計画通りに実験を進め、まず、採取した血液のリンパ球サブセット検査を行い、データを得ることができた。次に、血液からのRNA抽出プロトコールを確立し、RNAを抽出し、QCを通過した患者・健常者あわせて約20名分のサンプルについて、グロビンを除去した上で、１サンプルあたり最低6Gbの解読量を確保した全血RNA-Seqのデータを得ることが出来た。次に、サイトカインパネルを用いたマルチプレックスアレイでの血清サイトカインの発現検討も実施することができた。また、採取した唾液から、DNA抽出を完了し、患者10サンプルについて、1サンプルあたり最低10Gbの解読量を確保したショットガンメタゲノム解読を行うことができた。
7月から出産に伴う産休を取得し、来年3月まで育休を取得予定である。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
計画していた実験・シークエンシングを一通り終了し、貴重なデータを得ることが出来た。
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| 今後の研究の推進方策 |
7月から出産・育児のため研究を一時中断しているが、計画していたデータは一通り得られており、データを解析して論文化を目指すCOVID-19の影響で研究室に足を運ぶことのできない状況と学会参加の制限が生じているが、外注およびオンラインでの打ち合わせ・議論を適宜利用しつつ、円滑な研究の推進と研究成果の発表に努める。
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