研究課題
今年度は、以下二つの研究項目を中心に研究を進めた。研究項目２ 蚊地域集団のウイルス抵抗性遺伝子の多様性評価(フィリピン・インドネシアとの共同研究）：メトロマニラとバンドン近郊のチマヒ市、各世帯の屋内に誘虫紫外線ランプと吸引ファンを備えた電動蚊採捕機を設置し、ネッタイシマカ等の多様な蚊成虫を採取した。採取した蚊サンプルは形態学的に同定した後、RNAlaterに個体ごとに入れて冷凍庫内に保存した。メトロマニラで採取・保存したネッタイシマカ個体から十分な量のDNAを抽出するためのプロトコルを確立し,ウイルス抵抗性遺伝子を含む様々な遺伝子をゲノム全体からランダムに選択して、それらの遺伝的多様性を調べた。具体的には、次世代シーケンサーを使ったddRAD解析により、約１０００遺伝子座を検出し、メトロマニラ内の地域個体群の遺伝的多様性ならびに地域個体群間の遺伝的差異を調べた。研究項目３「蚊地域集団のデングウイルス感染率・体内濃度と抵抗性遺伝子の関係の検証(フィリピン・インドネシアとの共同研究）」：研究項目２で採取・保存した蚊個体の一部の個体を使って、個体レベルから十分な量のRNAを抽出するためのプロトコルを確立した。インドネシアのバンドンに設置した愛媛大学ーパジャジャラン大学国際共同研究ラボラトリーにおいてデングウイルスの１～４型をそれぞれ定量PCRで検出する実験手法を最適化し、現地でデングウイルスを検出・定量できる体制を整備した。
2: おおむね順調に進展している
研究項目２（蚊地域集団のウイルス抵抗性遺伝子の多様性評価）、研究項目３（蚊地域集団のデングウイルス感染率・体内濃度と抵抗性遺伝子の関係の検証）共にインドネシア、フィリピンにおける蚊採取は順調に行われ、また、採取した蚊から十分な量の核酸（ＤＮＡ，ＲＮＡ）を抽出して、デングウイルスを現地で定量・検出するプロトコルを確立することができた。以上より、概ね順調に進展しているを評価した。
研究項目１（蚊ゲノムのウイルス抵抗性遺伝子の網羅的探索）：標的遺伝子を除去する酵素Cas9を発現するネッタイシマカ培養細胞系を構築する。研究項目３（蚊地域集団のデングウイルス感染率・体内濃度と抵抗性遺伝子の関係の検証）：フィリピンのマニラ首都圏とインドネシアのバンドンを対象にして、ネッタイシマカ体内のデングウイルス感染率・体内濃度と抵抗性遺伝子の関係を検証する。
次年度に行う次世代シークエンシング解析などの高価な解析のための予算を確保しておいた。
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すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 4件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 10件、 招待講演 1件)
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
巻: 14 ページ: 1360438
10.3389/fcimb.2024.1360438/full
PLoS ONE
巻: 19(3) ページ: e0298656
10.1371/journal.pone.0298656
Tropical Medicine and Infectious Disease
巻: 9(3) ページ: 60
10.3390/tropicalmed9030060
Virology
巻: 591 ページ: 109982
10.1016/j.virol.2024.109982
Royal Society Open Science
巻: 11 (1) ページ: 231373
10.1098/rsos.231373
Global Medical and Health Communication
巻: 11 (3) ページ: 225-233
10.29313/gmhc.v11i3.12749
巻: 13 ページ: 1252656
10.3389/fcimb.2023.1252656
