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2014 年度 実績報告書

特異なクラスター活性中心をもつ酸化還元金属酵素の生物無機化学

研究課題

研究課題/領域番号 23000007
研究機関名古屋大学

研究代表者

巽 和行  名古屋大学, 物質科学国際研究センター, 特任教授 (10155096)

研究期間 (年度) 2011-05-31 – 2016-03-31
キーワードクラスター / 酸化還元酵素 / ニトロゲナーゼ / ヒドロゲナーゼ / COヒドロゲナーゼ
研究実績の概要

本年度も研究は順調に進み、以下に示す予想以上の重要な成果が得られた。
(1) ヒドリドを有する[NiFe]ヒドロゲナーゼモデルの構築 : これまで極めて困難であった還元型[NiFe]ヒドロゲナーゼの活性部位モデルとなるFe-Ni錯体を、CO/CN配位子をもつFe(II)錯体とNi(O)錯体の反応によって達成し、本錯体がヒドロゲナーゼの機能を再現するプロトン化反応によってヒドリド錯体を生成することが示唆された。一方、同様のFe(II)錯体とNi(II)ヒドリド錯体との反応でも、ヒドリド配位子をもつFe(II)-Ni(II)錯体の生成が確認され、期待以上の進捗が見られた。現在、これらの錯体の結晶化による構造の解明を進めている。
(2) 光化学系II酸素発生中心モデルとなるマンガンクラスター : かさ高いアルコキシド/シロキシドを補助配位子に用い、マンガンアミド錯体を前駆体とする我々独自の有機溶媒中での自己集積反応を開拓し、一連のMn/0, Mn/OH, Mn/Ca/0クラスターの合成に成功している。その実績を踏まえ、かさ高いフェノキシドを配位子とするMn錯体を用いたクラスター合成を検討した。Mn(II)二核フェノキシド錯体を酸化すると、Mn(III)を含むラダー型の四核オキソクラスターが得られた。またトリフェニルメトキシ基を有するMn(II)二核錯体を用いた場合には、オキソ架橋Mn(IV)二核錯体とキュバン型四核Mn(III)オキソクラスターが得られた。これらは光化学系II酸素発生中心に存在する[4Mn-Ca-40]クラスターのよい前駆体と考えられ、種々のCa錯体との反応を検討している。
(3) DPORを利用した人工酵素構築 : 暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素(DPOR)の基質結合部位に合成金属クラスター導入のために2つのCys残基を導入した変異型酵素FL-Cに対し、2種の人工金属クラスター(Fe/SクラスターとMo/Fe/Sクラスター)の導入を試み、“キメラ酵素”のアセチレン還元活性を検討した。その結果、低いながらもエチレン生成が認められ、その生成量はFeクラスター再構成FL-Cの方が、Moクラスター再構成FL-Cに比べわずかに高かった。ポルフィリン環の還元を本来の触媒活性とするDPORにアセチレン還元活性が付与された可能性が示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

研究実績の概要に述べたように、今年度は当初予定していた以上の研究の進展が見られた。特に、[NiFe]ヒドロゲナーゼのモデル研究および光化学系II酸素発生中心モデルのでは下記の特筆すべき成果をあげることができた。
1) これまで種々の[NiFe]ヒドロゲナーゼ活性中心モデルとなるチオラート架橋Ni/Fe二核錯体の合成には成功していたが、今回初めてヒドリドを有するモデル錯体の合成に成功した。この構造解析と反応性の解明により、[NiFe]ヒドロゲナーゼが水素を活性化する機構解明の端緒が拓かれると期待される。
2) 光化学系II酸素発生中心に存在する[4Mn-Ca-40]クラスターのモデル構築に取り組み、非プロトン性有機溶媒中でマンガン(II)アミド錯体を前駆体として用いる独自の合成手法により、様々なマンガンオキソクラスターの合成に成功した。特に、酸素発生に必要と考えられる高酸化マンガンを含むオキソクラスターの合成は大きな課題であったが、この合成手法を開拓したことは、今後の酸素発生メカニズムを解明に向け、極めて重要な成果である。
また、ニトロゲナーゼP-clusterモデルの構築や、アセチルCoAシンターゼのモデル研究も順調に進捗している。アセチルCoA合成酵素の2核ニッケル構造のより優れたモデル錯体によるモデル反応を達成するとともに、極めてかさ高いチオラートを用いたチオラート置換P-clusterモデルの物性解明に向けて検討を続けている。さらに、生化学分野との共同研究も順調で、ニトロゲナーゼ類似のDPOR酵素の研究において、合成した金属硫黄クラスターを導入し基質還元活性を検討している。

今後の研究の推進方策

酸化還元金属酵素のクラスター活性中心に関する本研究は引き続き順調に成果をあげている。今後も、これまでの研究推進方策に基づいて以下の各研究課題を引き続き強力に推進する。
<ニトロゲナーゼ活性中心>
ニトロゲナーゼFeMo-Coの活性中心で6つの鉄に囲まれた原子が炭素であるとの報告を踏まえ、中心に炭素原子を含む[8Fe-6S-C]クラスターモデルの構築を検討する。これまでに培った[8Fe-7S]クラスター合成のノウハウを最大限に活用し、リンイリドを炭素源として構築を目指す。さらに、生化学者との共同研究も継続し、ニトロゲナーゼの特異な構造を持つクラスター活性中心がタンパク質環境下で構築される仕組みの解明をめざす。また、ニトロゲナーゼ様のユニットからなるDPOR酵素の研究者と共同し、DPOR活性中心への金属硫黄クラスター導入によってニトロゲナーゼ機能とDPOR機能の関連性について調べる。新しい試みとして、DPORの生合成過程、すなわちBchNタンパク質とBchBタンパク質がアセンブルする過程をin vitroで再現し、この過程を人工金属クラスター存在下で行うことでより効率的なキメラ酵素の創出を試みる。
<[NiFe]ヒドロゲナーゼ活性中心>。
これまで酸化型および還元型ヒドロゲナーゼ活性中心のモデル錯体、特に最近合成に成功したヒドリドを有するモデル錯体を用い、ヒドロゲナーゼ酵素機能を模する反応の開拓により酵素反応機構の解明に資する成果をあげたい。
<光化学系II酸素発生中心>
引き続き、光化学系II酸素発生中心の構造モデル構築として、Caを含むMn/Ca/0クラスターの合成研究を推進する。これまで培った鉄硫黄クラスター合成のノウハウを生かし、かさ高いアルコキシド配位子を利用してマンガン酸素(ヒドロキシド)クラスターモデルの高度化を行う。特に高酸化状態のマンガンを含むクラスターの構築に焦点をあて、酸素発生機構の解明に迫りたい。

  • 研究成果

    (36件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (24件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Heterolytic Activation of Dihydrogen Molecule by Hydroxo-/Sulfido-Bridged Ruthenium-Germanium Dinuclear Complex. Theoretical Insights2015

    • 著者名/発表者名
      N. Ochi, T. Matsumoto, T. Dei, Y. Nakao, H. Sato, K. Tatsumi, S. Sakaki
    • 雑誌名

      Inorg. Chem.

      巻: 54 ページ: 576-585

    • DOI

      10.1021/ic502463y

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of cytochrome C_m stimulates cyanobacterial heterotrophic growth in the dark2015

    • 著者名/発表者名
      Hiraide, Y., Oshima, K., Fujisawa, T., Uesaka, K., Hirose, Y., Tsujimoto, R., Yamamoto, H., Okamoto, S., Nakamura, Y., Terauchi, K., Omata, T., Ihara, K., Hattori, M. and Fujita, Y.
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 57 ページ: 334-345

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu165

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evolutionary aspects and regulation of tetrapyrrole biosynthesis in cyanobacteria under aerobic and anaerobic environments2015

    • 著者名/発表者名
      Fujita, Y., Tsujimoto, R. and Aoki, R.
    • 雑誌名

      Life

      巻: 5 ページ: 1172-1203

    • DOI

      10.3390/life5021172

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Structure of 3-(Diethylborylethynyl)pyridine : a nonplanarly Arranged Cyclic Dimer2014

    • 著者名/発表者名
      S. Wakabayashi, M. Kuse, A. Kida, S. Komeda, K. Tatsumi, Y. Sugihara
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry

      巻: 12 ページ: 5382-5387

    • DOI

      10.1039/C40B00849A

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Flexible Nature of Iron-Sulfur Clusters Relevant to Nitrogenase Active Sites : What we know and What we do not2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatsumi
    • 雑誌名

      J. Biological Inorg. Chem

      巻: 19 ページ: S154

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Convenient Route to Synthetic Analogues of the Oxidized Form of High-Potential Iron-Sulfur Proteins2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tanifuji, N. Yamada, T. Tajima, T. Sasamori, N. Tokitoh, T. Matsuo, K. Tamao, Y. Ohki, K. Tatsumi
    • 雑誌名

      Inorg. Chem.

      巻: 53 ページ: 4000-4009

    • DOI

      10.1021/ic402890k

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of V/Fe/S Clusters Using Vanadium(III)Thiolate Complexes Bearing a Phenoxide-Based Tridentate Ligand2014

    • 著者名/発表者名
      N. Taniyama, Y. Ohki, K. Tatsumi
    • 雑誌名

      Inorg. Chem.

      巻: 53 ページ: 5438-5446

    • DOI

      10.1021/ic4030603

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dark-operative protochlorophyllide oxidoreductase generates substrate radicals by an iron-sulphur cluster in bacteriochlorophyll biosynthesis2014

    • 著者名/発表者名
      Nomata, J., Kondo, T., Mizoguchi, T., Tamiaki, H., Itoh, S. and Fujita, Y.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 4 ページ: 5,455

    • DOI

      10.1038/srep05455

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reconstitution of a sequential reaction of two nitrogenase-like enzymes in the bacteriochlorophyll biosynthetic pathways of Rhodobacter capsulatus2014

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, H., Kato, M., Yamanashi, K., and Fujita, Y.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 448 ページ: 200-205

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.04.087

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcriptional regulators ChlR and CnfR are essential for diazotrophic growth of nonheterocystous cyanobacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Tsujimoto, R., Kamiya, N. and Fujita, Y.
    • 雑誌名

      Proceedings of National Academy of Science of USA

      巻: 111 ページ: 6762-6767

    • DOI

      10.1073/pnas.1323570111

    • 査読あり
  • [学会発表] Toward Structural and Functional Analogues of the Nitrogenase Active Site2015

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      The 95th CSJ Asian International Symposium
    • 発表場所
      Nihon University
    • 年月日
      2015-03-27
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] 暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素の反応機構解析2015

    • 著者名/発表者名
      藤田祐一
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2015-03-05
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] ニトロゲナーゼの機能モデル化に向けた第一歩2015

    • 著者名/発表者名
      大木靖弘
    • 学会等名
      分子研研究会 生物無機化学の最先端と今後の展望 : 金属と生体分子の作用機序解明とモデル化および応用への展開
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスホール
    • 年月日
      2015-01-06 – 2015-01-07
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Chemistry of the Nitrogenase P-Cluster and FeMo-co2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatusmi
    • 学会等名
      University of Freiburg
    • 発表場所
      Freiburg, Germany
    • 年月日
      2014-12-15
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] ニトロゲナーゼ活性中心の構造と機能の模倣を目指して2014

    • 著者名/発表者名
      大木靖弘
    • 学会等名
      第45回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
    • 発表場所
      中部大学
    • 年月日
      2014-11-29 – 2014-11-30
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Cluster Geometry of the Nitrogenase FeMo-co2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatusmi
    • 学会等名
      18th IRTG Joint Symposium
    • 発表場所
      Münster, Germany
    • 年月日
      2014-11-27 – 2014-11-29
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Iron-Sulfur Clusters Structurally Analogous to the FeMo-cofactor of Nitrogenase2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      Campus Asia Sendai Symposium 2014
    • 発表場所
      Tohoku University
    • 年月日
      2014-11-26 – 2014-11-27
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Structural Analogues of Metal-Sulfur Clusters in Reductases : Synthesis and Core Transformations2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      Vietnam Malaysia International Chemical Congress
    • 発表場所
      Hanoi (Vietnam)
    • 年月日
      2014-11-07 – 2014-11-09
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Structural Analogues of Metal-Sulfur Clusters in Reductases : Synthesis and Core Transformations2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      Malaysian International chemical Congress (18MICC 2014)
    • 発表場所
      Kuara-Lumpur (Malaysia)
    • 年月日
      2014-11-03 – 2014-11-05
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] CnfR is a master transcriptional activator essential for nitrogen fixation in nonheterocystous cyanobacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Fujita, Y.
    • 学会等名
      3rd Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis and Nitrogen Fixation
    • 発表場所
      中国、成都
    • 年月日
      2014-10-27 – 2014-10-30
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Chlorophyll biosynthesis under low oxygen environments2014

    • 著者名/発表者名
      Fujita, Y.
    • 学会等名
      Institute for Protein Research Seminar
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2014-10-24
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Reversible Transformation between Cuboidal Fe4S4 and Dinuclear Fe2S2 Cores2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatsumi
    • 学会等名
      The 16th Japan-Korea Joint Symposium on Organometallic and Coordination Chemistry
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 年月日
      2014-10-23 – 2014-10-25
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Organometallic Chemistry of Reductases-A Clue to Building Future Sustainable Society-2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatsumi
    • 学会等名
      South Europe-Japan Joint Forum on Inorganic Chemistry and Its Interfaces(JSPS-CNRS)
    • 発表場所
      Strasbourg, France
    • 年月日
      2014-10-17 – 2014-10-18
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] 金属錯体の理論研究から還元系金属酵素の生物無機化学研究へ2014

    • 著者名/発表者名
      巽和行
    • 学会等名
      錯体化学秋の学校
    • 発表場所
      西丹沢, 神奈川
    • 年月日
      2014-09-20
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] アセチルCoA合成酵素の反応中間体モデルとなるジアミドジチオラート型mbea配位子をもつ二核ニッケル錯体の合成と反応2014

    • 著者名/発表者名
      大須理恵・大木靖弘・唯美津木・巽和行・松本剛
    • 学会等名
      錯体化学会第64回討論会
    • 発表場所
      中央大学・東京
    • 年月日
      2014-09-18 – 2014-09-20
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] かさ高いterphenyl基をリン上に導入したジホスフィン配位子を有する単核ニッケル錯体の合成と反応2014

    • 著者名/発表者名
      鈴木宏徳・唯美津木・大木靖弘・松本剛
    • 学会等名
      錯体化学会第64回討論会
    • 発表場所
      中央大学・東京
    • 年月日
      2014-09-18 – 2014-09-20
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] N-Heterocyclic Carbene Complexes of Transition Metals Directed Toward Small Molecule Activation and Transformation2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      Japan-UK Joint Symposium on Coordination Chemistry
    • 発表場所
      Chuo University
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Chemistry of the Nitrogenase P-Cluster2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatsumi, K. Shin, A. Nagasaki, Y. Ohki
    • 学会等名
      The 2nd Japan-UK Joint Symposium on Coordination Chemistry
    • 発表場所
      Chuo University, Tokyo
    • 年月日
      2014-09-16 – 2014-09-19
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Reversible Transformation between Cuboidal Fe4S4 and Dinuclear Fe2S2 Cores2014

    • 著者名/発表者名
      K. Tatsumi
    • 学会等名
      The 12th European Biological Inorganic Chemistry Conference(EuroBIC-12)
    • 発表場所
      Zurich
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-28
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Synthesis and Reaction of Dinuclear Nickel Complexes Modeling Intermediates in the Enzymatic Cycle of Acetyl CoA Synthase2014

    • 著者名/発表者名
      R. Osu, Y. Ozawa, Y. Ohki, T. Matsumoto, K. Tatsumi
    • 学会等名
      XXXVI International Conference on Organometallic Chemistry. (ICOMC 2014)
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-07-13 – 2014-07-18
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Synthetic Analogues of Metal Centers in Nitrogenase and Iron-Sulfur Enzymes2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      Gordon Research Conference 2014 on Iron Sulfur Enzymes
    • 発表場所
      Stonehill College(Easton, MA, USA)
    • 年月日
      2014-06-15 – 2014-06-20
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Synthesis and Reactions of Coordinatively Unsaturated Iron Complexes of N-Heterocyclic Carbenes2014

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Ohki
    • 学会等名
      The 17th Joint Symposium of Core-to-Core/IRTG Programs on Elements Function for Transformative Catalysis and Materials
    • 発表場所
      Nagoya University
    • 年月日
      2014-06-12 – 2014-06-13
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] Model Studies on Nickel Enzymes Playing Key Roles in Autotrophic Carbon Fixation2014

    • 著者名/発表者名
      T. Matsumoto
    • 学会等名
      EMTECH, Universiti Putra Malaysia (UPM)-University Of Hyogo (UH), Japan Joint Colloquium 2014
    • 発表場所
      Putra, Malaysia
    • 年月日
      2014-05-26 – 2014-05-27
    • 説明
      【発表確定】
  • [学会発表] 金属酵素クラスター活性中心の化学-生物機能に挑戦する化学研究への期待-2014

    • 著者名/発表者名
      巽和行
    • 学会等名
      第4回公開シンポジウム, 新学術領域研究「元素ブロック高分子材料の創出」
    • 発表場所
      熊本市国際交流会館, 熊本
    • 年月日
      2014-04-23
    • 説明
      【発表確定】
  • [図書] 科学の健全な発展のために2015

    • 著者名/発表者名
      日本学術振興会「科学の健全な発展のために」編集委員会
    • 総ページ数
      141
    • 出版者
      丸善出版
    • 説明
      【発行確定】
  • [産業財産権] シアノバクテリアにおける完全暗所従属栄養能に関連する遺伝子及びその利用2015

    • 発明者名
      平出優人・藤田祐一
    • 権利者名
      名古屋大学
    • 産業財産権種類
      特許権
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2015/057046
    • 出願年月日
      2015-03-10

URL: 

公開日: 2016-06-01  

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