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タンパク質－タンパク質間相互作用は、多くの場合幅広い準安定状態を含む相互作用界面を持っているとされている。そのような相互作用の自由エネルギーランドスケープをBarnase/Barstar複合体とEIN/HPr複合体について水中の全原子網羅的サンプリングシミュレーションを用いて決定した。その結果、高々μモル程度の解離定数を持つタンパク質－タンパク質間相互作用における過渡的複合体は、相互作用形成経路上の準安定状態ではなく、平衡状態における極めて広い構造分布の準安定構造であり、それらは生状態の機能的構造の出現を一過性の過渡的なものとしていることが分かった。
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