研究課題/領域番号 |
23300109
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
生体生命情報学
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研究機関 | 東京大学 |
研究代表者 |
清水 謙多郎 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80178970)
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研究分担者 |
寺田 透 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (40359641)
角越 和也 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教 (90431832)
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研究期間 (年度) |
2011-04-01 – 2015-03-31
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キーワード | タンパク質 / 糖鎖 / 相互作用予測 / データベース / バイオインフォマティクス |
研究成果の概要 |
本研究では、タンパク質-糖鎖の相互作用に関して、糖鎖結合タンパク質予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合するかどうかを予測)、タンパク質-糖鎖結合部位予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合する残基、構造が得られている場合は空間上の位置を予測)、結合糖鎖予測(与えられたタンパク質に結合する糖鎖を予測)、タンパク質-糖鎖ドッキング予測、タンパク質-糖鎖相互作用解析、糖修飾部位予測(タンパク質が糖鎖修飾を受ける部位を予測)の各手法を実現し、統合的に利用できるようにするとともに、タンパ質-糖鎖の相互作用 に関して、配列、構造、機能に関するさまざまな情報を登録した総合的なデータベースを構築した。
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自由記述の分野 |
生命情報科学
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