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2014 年度 研究成果報告書

タンパク質・糖鎖相互作用予測システムおよびデータベースの開発

研究課題

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研究課題/領域番号 23300109
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体生命情報学
研究機関東京大学

研究代表者

清水 謙多郎  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80178970)

研究分担者 寺田 透  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (40359641)
角越 和也  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教 (90431832)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2015-03-31
キーワードタンパク質 / 糖鎖 / 相互作用予測 / データベース / バイオインフォマティクス
研究成果の概要

本研究では、タンパク質-糖鎖の相互作用に関して、糖鎖結合タンパク質予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合するかどうかを予測)、タンパク質-糖鎖結合部位予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合する残基、構造が得られている場合は空間上の位置を予測)、結合糖鎖予測(与えられたタンパク質に結合する糖鎖を予測)、タンパク質-糖鎖ドッキング予測、タンパク質-糖鎖相互作用解析、糖修飾部位予測(タンパク質が糖鎖修飾を受ける部位を予測)の各手法を実現し、統合的に利用できるようにするとともに、タンパ質-糖鎖の相互作用
に関して、配列、構造、機能に関するさまざまな情報を登録した総合的なデータベースを構築した。

自由記述の分野

生命情報科学

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公開日: 2016-06-03  

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