• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2011 年度 実績報告書

酵母の量的均衡遺伝子が作るネットワークの全容解明

研究課題

研究課題/領域番号 23310140
研究機関岡山大学

研究代表者

守屋 央朗  岡山大学, 異分野融合先端研究コア, 准教授 (60500808)

研究分担者 牧野 能士  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教 (20443442)
キーワードゲノム / 遺伝子量不均衡 / 酵母
研究概要

〈研究の目的〉遺伝子量不均衡により細胞機能に悪影響を及ぼす遺伝子のことを量的均衡遺伝子(DBG)と呼ぶ。DBGの多くは、病気の原因遺伝子である可能性が指摘されている事に加え、DBGはゲノムの基本構造を決めている可能性もある。しかし、実際の生物のゲノム上にどれくらいDBGが存在しているのかは全く分かっていない。そこで本研究では、出芽酵母のDBGとそのパートナーを、申請者が開発した遺伝子綱引き法により網羅的に同定し、DBGとそのパートナーが作るネットワークの全容を明らかにする事を目的とする。本研究で得られる知識は、ゲノムの進化や完全性の維持機構を考える上で非常に重要な役割を果たすと考えられる。さらには、遺伝子コピー数の変化によって生じる病気の原因遺伝子の解明やその発症メカニズムの解明にもつながると期待される。
〈研究実施計画〉研究目的の達成のために、本研究ではgTOWを中心的実験手法として、出芽酵母の遺伝子について、(1)わずかなコピー数の変動により細胞機能に悪影響を及ぼす遺伝子を網羅的に取得し、(2)それらのパートナー遺伝子の同定を行う。また、本研究で同定されたDBGついて、(3)特徴となる性質やヒトDBGとの関わりを情報学的に解析する。さらに、(4)「DBGネットワーク仮説」を検証する実験、(5)分裂酵母のDBGの同定にも着手する。
〈本年度の研究実績〉本年度は上記計画に基づき、わずかなコピー数変動に伴い細胞機能に悪影響をおよぼす遺伝子の絞り込みを行なった。その結果、限界コピー数が10倍以下の遺伝子115個を取得した。これらの遺伝子は細胞骨格や細胞内の輸送に関わる遺伝子が多く含まれていた。また、これらの遺伝子のパートナーとなっている遺伝子の組み合わせを探索し、13ペアについて量的な均衡関係あるすなわちDBGであることが確かめられた。現在パートナーが同定されていない遺伝子についてもパートナー遺伝子の探索を続けている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究費に採択されてからいち早く研究体制を構築することができた。特に予想外の事態も発生せず研究は順調に進展している。

今後の研究の推進方策

現在のところ研究は順調に進展していることから、特に特別な推進方策をとる予定はない。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2011 その他

すべて 学会発表 (6件) 備考 (1件)

  • [学会発表] Dosage sensitive geneと均衡関係にある遺伝子の同定2011

    • 著者名/発表者名
      金高令子、守屋央朗
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2011-12-14
  • [学会発表] Dosage sensitive geneと均衡関係にある遺伝子の同定2011

    • 著者名/発表者名
      金高令子、守屋央朗
    • 学会等名
      イーストワークショップ
    • 発表場所
      香川県さぬき市
    • 年月日
      2011-11-12
  • [学会発表] 出芽酵母の遺伝子量感受性遺伝子2011

    • 著者名/発表者名
      守屋央朗
    • 学会等名
      第7回真菌分子細胞研究会
    • 発表場所
      香川県さぬき市(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-12
  • [学会発表] 酵母細胞システムのロバストネス解析2011

    • 著者名/発表者名
      守屋央朗
    • 学会等名
      第49会日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] Dosage sensitive geneのパートナー分子の同定2011

    • 著者名/発表者名
      金高令子、守屋央朗
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム第44回年会
    • 発表場所
      福岡県博多市
    • 年月日
      2011-09-06
  • [学会発表] Identification of dosage sensitive genes on the budding yeast genome2011

    • 著者名/発表者名
      守屋央朗
    • 学会等名
      Young Researchers Conference on Evolutionary Genomics
    • 発表場所
      東京(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-01
  • [備考]

    • URL

      http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/HMlab/

URL: 

公開日: 2013-06-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi