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本研究では、miRNAなど生体内でプロセシングを受けるRNAを高精度に検出するために、起案者が開発した短いRNAには強く結合し、それと同じ配列を中央部にもつ長いRNAには結合しない、5'末端に修飾ヌクレオシドpdAChcmPを有する人工核酸 (pdAChcmPNA)をさらに発
展させた新手法を開発する。そのために、新規pdAChcmPの構造を改変した新規誘導体の開発、短鎖RNA結合能を増強する新規ラベル化法、蛍光核酸を用いた新規検出法などの開発を行う。昨年度までに合成した塩基部、糖部、リン酸バックボーンを固定化した誘導体の逆転写酵素のプライマーとしての性質をもとにRT-PCR法への応用を検討し、標的miRNAとわずかに一塩基程度鎖長が異なる、isomiRの識別を検討した。その結果、5'末端にコンホメーションを固定化しない修飾ヌクレオシドdAChcmPを導入した場合に最も優れた識別能を示すことが明らかになり研究も目標を達成することができた。また、並行して検討していた新規ラベル化法の開発も、ターゲットRNAの末端をRNAリガーゼを用いて、2’-アミノヌクレオシドでラベル化する方法を確立することができた。
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