ＲＮＡ成熟マシナリーの構造的基盤と機能進化

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23350081
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 愛媛大学
• 研究代表者: 堀 弘幸 愛媛大学, 理工学研究科, 教授 (20256960)
• 研究分担者: 鈴木 勉 東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (20292782) ; 平田 章 愛媛大学, 大学院・理工学研究科, 講師 (60527381)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: 核酸 / 酵素 / タンパク質 / ＲＮＡ

研究概要

本研究は、「RNA成熟システムの全体像を物理・化学的手法で包括的に理解する」ことを目標とした。申請は、３年間の短期申請で、生命の３つのドメイン（真正細菌、古細菌、真核生物）で起源生物に近い単細胞生物のRNA成熟システムを中心に調べた。RNA成熟に関わるtRNA修飾酵素、tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼなどについて、X線結晶構造解析、生化学的解析を併用して、その性質を明らかにした。また、遺伝子破壊株解析からRNA修飾ヌクレオシドと修飾酵素のネットワークの環境応答を明らかにした。さらに、古細菌tRNAの新規修飾をいくつか発見した。

研究成果

• [雑誌論文] Methylated nucleosides in tRNA and tRNA methyltransferases (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Hori
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distinct tRNA modifications in the thermo-acidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum (2013)
  • 著者名/発表者名: C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, T. Kawamura, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori
  • 雑誌名: FEBS Letters 587 ページ: 3575-3580
  • 査読あり
• [雑誌論文] The catalytic domain of topological knot tRNA methyltransferase (TrmH) discriminates between substrate tRNA and nonsubstrate tRNA via an induced-fit process (2013)
  • 著者名/発表者名: A. Ochi, K. Makabe, R. Yamagami, A. Hirata, R. Sakaguchi, Y.M. Hou, K. Watanabe, O. Nureki, K. Kuwajima, and H. Hori
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 288 ページ: 25562-25574
  • 査読あり
• [雑誌論文] Degradation of initiator tRNAMet by Xrn1/2 via its accumulation in the nucleus of heat-treated HeLa cells (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Watanabe, R. Miyagawa, C. Tomikawa, R. Mizuno, A. Takahashi, H. Hori, and K. Ijiri
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41 ページ: 4671-4685
  • 査読あり
• [雑誌論文] The tRNA recognition mechanism of folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO) (2012)
  • 著者名/発表者名: R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Tomikawa, A. Ochi, C. Iwashita, A. Hirata, R. Ishitani, O. Nureki, and H. Hori
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 287 ページ: 42480-42494
  • 査読あり
• [雑誌論文] X-ray structure of the fourth type of archaeal tRNA splicing endonuclease : insight into the evolution of a novel three-unit composition and a unique loop involved in broad substrate specificity (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Hirata, K. Fujishima, R. Yamagami, T. Kawamura, J. F. Banfield, A. Kanai, and H. Hori
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 ページ: 10554-10566
  • 査読あり
• [雑誌論文] The 2'-O-methylation status of a single guanosine controls transfer RNA-mediated Toll-like receptor 7 activation or inhibition (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Jöckel, G. Nees, R. Sommer, Y. Zhao, D. Cherkasov, H. Hori, G. Ehm, M. Schnare, M. Nain, A. Kaufmann, and S. Bauer
  • 雑誌名: J. Exp. Med 巻: 209 ページ: 235-241
  • 査読あり
• [雑誌論文] Substrate tRNA recognition mechanism of a multi-site-specific tRNA methyltransferase, Aquifex aeolicus Trm1, based on the X-ray crystal structure (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Awai, A. Ochi, Ihsanawati, T. Sengoku, A. Hirata, Y. Bessho, S. Yokoyama, and H. Hori
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 286 ページ: 35236-35246
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cleavage of intron from the standard or non-standard position of the precursor tRNA by the splicing endonuclease of Aeropyrum pernix, a hyper-thermophilic Crenarchaeon, involves a novel RNA recognition site in the Crenarchaea specific loop (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Hirata, T. Kitajima, and H. Hori
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 39 ページ: 9376-9389
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pseudouridine at position 55 (Ψ55) in tRNA controls the contents of other modified nucleotides for low-temperature adaptation in the extreme-thermophilic eubacterium Thermus thermophilus (2011)
  • 著者名/発表者名: K. Ishida, T. Kunibayashi, C. Tomikawa, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 39 ページ: 2304-2318
  • 査読あり
• [学会発表] Prediction of genes for tRNA modifications in the thermoacidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryo Anraku, Miyu Higashiguchi, Takuya Kawamura, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20131203-06
• [学会発表] Alteration of solid-phase DNA probe method for large-scale tRNA purification (2013)
  • 著者名/発表者名: Ai Kazayama, Ryota Yamagami, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20131203-06
• [学会発表] Novel tRNA modifications in the thermophilic-acidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum (2013)
  • 著者名/発表者名: Chie Tomikawa, Takayuki Ohira, Yasushi Inoue, Takuya Kawamura, Akihiko Yamagishi, Tsutomu Suzuki, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20131203-06
• [学会発表] The synthesis mechanism of a tRNA modification in thermophilic bacteria (2013)
  • 著者名/発表者名: Takuya Kawamura, Chie Tomikawa, Takayuki Ohira, Yasushi Inoue, Nobukazu Nameki, Natsuhisa Oka, Hiroki Taniguchi, Kaori Ando, Satoshi Ohno, Akihiko Yamagishi, Tsutom Suzuki, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: Riboclub 2013 Annual Meeting
  • 発表場所: Canada
  • 年月日: 20130922-24
• [学会発表] X-ray crystal structure of the fourth type of tRNA splicing endonuclease from an uncultivated archaeon Candidatus Micrarchaeum acidiphilum (ARMAN-2) (2013)
  • 著者名/発表者名: Akira Hirata, Kosuke Fujishima, Ryota Yamagami, Takuya Kawamura, Jillian F. Banfiled, Akio Kanai and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2013
  • 発表場所: Deutschland
  • 年月日: 20130908-13
• [学会発表] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来tRNATrpの修飾ヌクレオシド分析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 前田雄太, 平田 章, 長野倫子, 土手智裕, 鈴木健夫, 金井保, 鈴木勉, 堀弘幸
  • 学会等名: 2013年度極限環境生物学会年会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス
  • 年月日: 2013-10-27
• [学会発表] Thermococcus kodakarensis 由来tRNAメチル化酵素(Trm-m22G10)の構造機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西山聖示, 平田章, 田村俊浩, 堀 弘幸
  • 学会等名: 2013年度極限環境生物学会年会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス
  • 年月日: 2013-10-27
• [学会発表] Does D20 formation by eubacterial dihydrouridine synthase require the other modified nucleotides for its modification in tRNA? (2013)
  • 著者名/発表者名: 楠葉浩晃, 吉田剛士, 岩崎絵梨, 粟井貴子, 平田章, 冨川千恵, 山上龍太, 堀弘幸
  • 学会等名: 第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会
  • 発表場所: 大阪大学豊中キャンパス
  • 年月日: 2013-09-21
• [学会発表] Eukaryotic tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112) recognizes the whole structure of tRNA (2013)
  • 著者名/発表者名: Shiho Ohmori, Yu Nishida, Kazuki Okada, Akira Hirata, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: 第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会
  • 発表場所: 大阪大学豊中キャンパス
  • 年月日: 2013-09-21
• [学会発表] 固相化DNAプローブ法を用いた好熱菌tRNAの大量精製法の確立 (2013)
  • 著者名/発表者名: Ai Kazayama, Ryota Yamagami, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: 第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会
  • 発表場所: 大阪大学豊中キャンパス
  • 年月日: 2013-09-21
• [学会発表] 葉酸依存性tRNA(m5U54)メチル化酵素TrmFOはどうやってtRNA中のU54を認識しているのか? (2013)
  • 著者名/発表者名: 山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 冨川千恵, 越智杏奈, 岩下智香子, 平田章, 石谷隆一郎, 濡木理, 堀 弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] m7G46およびΨ55を中心としたThermus thermophilustRNA修飾ネットワーク (2013)
  • 著者名/発表者名: 冨川千恵, 石田一雄, 国林貴史, 金井保, 横川隆志, 堀弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] 熱ストレスによる開始tRNAMetの細胞内動態 (2013)
  • 著者名/発表者名: 渡邉和則, 宮川隆, 冨川千恵, 水野利恵, 高橋昭久, 大槻高史, 堀弘幸, 井尻憲一
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] 真正細菌ジヒドロウリジン合成酵素はD20形成にtRNA上の他の修飾ヌクレオチドを必要とする (2013)
  • 著者名/発表者名: 楠葉浩晃, 吉田剛士, 岩崎絵梨, 粟井貴子, 平田章, 冨川千恵, 山上龍太, 堀弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] Thermoplasma acidophilum 由来tRNALeuにおいてArchaeosine が2カ所に形成されるメカニズムの解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 河村卓哉, 冨川千恵, 大平高之 , 井上仁, 行木信一, 岡夏央, 谷口浩輝, 安藤香織, 大野敏, 山岸明彦, 鈴木勉, 横川隆志, 堀弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 2´-5´RNAリガーゼの機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 平田章, 長野倫子, 石丸雄基, 金井保, 鈴木健夫, 佐藤朝子, 金井昭夫, 鈴木勉, 堀弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] Yeast tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の基質認識機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大森志穂, 西田裕, 岡田和樹, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 松山
  • 年月日: 2013-07-24
• [学会発表] 極小アーキア(古細菌)における4番目のタイプtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのX線結晶構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 平田章, 藤島皓介, 山上龍太, 河村卓哉, Jillina F. Banfield, 金井昭夫, 堀弘幸
  • 学会等名: 第13回蛋白質科学会
  • 発表場所: 鳥取
  • 年月日: 2013-06-12
• [学会発表] tRNA modifications in thermoacidophilic archaeon (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の基質認識機構の解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西田裕, 岡田和樹, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Expression and purification of yeast tRNA (Cm32/Gm34) methyltransferase (Trm7) (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshii, A. Hirata, and H. Hori
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Structural and functional analyses of archaeal 2'-5' RNA ligase (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Nagano, A. Hirata, Y. Ishimaru, T. Kanai, and H. Hori
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Research for substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI) (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, A. Ochi and H. Hori
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Improvement of a protein purification method for nucleic acid-free in the case of recombinant tRNA (N2, N2-guanine)-dimethyltransferase (Trm1) from Aquifex aeolicus (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Nishiyama, A. Hirata, T. Awai, and H. Hori
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20121211-14
• [学会発表] Negative control of Gm18, m5s2U54 and m1A58 modifications by pseudouridine55 modification in Thermus thermophilus tRNAs : the tRNA modification network in extreme thermophile (2012)
  • 著者名/発表者名: C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori
  • 学会等名: 24th tRNA workshop
  • 発表場所: Chilli
  • 年月日: 20121202-06
• [学会発表] Substrate transfer RNA recognition mechanism of tRNA (m5U54) methyltransferase (TrmFO) based on the biochemical and structural analysis. (2012)
  • 著者名/発表者名: R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Iwashita, A. Hirata, O. Nureki, and H. Hori
  • 学会等名: 第2回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: SPring-8 (Harima)
  • 年月日: 2012-09-28
• [学会発表] Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI) (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, A. Ochi and H. Hori
  • 学会等名: 第2回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: SPring-8 (Harima)
  • 年月日: 2012-09-28
• [学会発表] Functional analysis of yeast tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112) (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Nishida, K. Okada, A. Hirata, and H. Hori
  • 学会等名: 第2回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: SPring-8 (Harima)
  • 年月日: 2012-09-28
• [学会発表] Adaptation of Thermus thermophilus to environmental temperature via tRNA modification enzymes-modified nucleotides network in tRNA (2012)
  • 著者名/発表者名: C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori
  • 学会等名: 第2回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: SPring-8 (Harima)
  • 年月日: 2012-09-28
• [学会発表] Visiting Yellowstone National Park, the place of discovery of thermophiles (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Hori
  • 学会等名: 第2回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: SPring-8 (Harima)
  • 年月日: 2012-09-28
• [学会発表] Transfer RNA modifications in thermophilic bacteria (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori
  • 学会等名: 9th Extremophiles 2012
  • 発表場所: Spain
  • 年月日: 2012-09-09
• [学会発表] Transfer RNA recognition mechanism of Thermus thermophilus folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO) (2012)
  • 著者名/発表者名: R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Tomikawa, A. Ochi, C. Iwashita, A. Hirata, R. Ishitani, O. Nureki, and H. Hori
  • 学会等名: 9th Extremophiles 2012
  • 発表場所: Spain
  • 年月日: 2012-09-09
• [学会発表] Structural insight into the evolution and broad substrate specificity of the fourth type of tRNA splicing endonuclease (2012)
  • 著者名/発表者名: A. Hirata, K. Fujishima, R. Yamagami, T. Kawamura, J. F. Banfiled, A. Kanai, and H. Hori
  • 学会等名: 9th Extremophiles 2012
  • 発表場所: Spain
  • 年月日: 2012-09-09
• [学会発表] 極小アーキアにおけるtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼの構造機能解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平田章, 藤島皓介, 山上龍太, 河村卓哉, J. F. Banfield, 堀弘幸
  • 学会等名: 第25回日本アーキア研究会
  • 発表場所: 兵庫
  • 年月日: 2012-07-18
• [学会発表] tRNA modifications in Thermoplasma acidophilum (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-07-16
• [学会発表] サーマス・サーモフィラス由来tRNAメチル化酵素TrmFOの基質認識機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 冨川千恵, 越智杏奈, 岩下智香子, 平田章, 石谷隆一郎, 濡木理, 堀弘幸
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-07-16
• [学会発表] 高度好熱菌tRNA中のシュードウリジン55修飾は, 温度変化への適応因子として機能する (2012)
  • 著者名/発表者名: 冨川千恵, 石田一雄, 国林貴史, 越智杏奈, 金井保, 平田章, 岩下知香子, 堀弘幸
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-07-16
• [学会発表] アーキアにおける2'-5' RNA ligaseの構造機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野倫子, 石丸雄基, 金井保, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第12回極限環境生物学会年会
  • 発表場所: 長崎
  • 年月日: 20111127-28
• [学会発表] Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI) (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Takuma, Masayuki Minoji, Natsumi Ushio, Chie Tomikawa, Akira Hirata, Anna Ochi, and Hiroyuki Hori
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 20111109-11
• [学会発表] Thermus thermophilus tRNA (m1A58) methyltransferase [Trm1]の基質認識メカニズムの解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 詫間浩之, 美濃地真之, 牛尾なつみ, 冨川千恵, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西田裕, 岡田和樹, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] 超好熱性古細菌Thermococcus kodakaraensis由来tRNA(m2G10/m22G10) methyltransferase (TK0981)の酵素学的性質の決定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田村俊浩, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] サーマス・サーモフィラス由来葉酸依存性tRNA(m5U54)メチル化酵素の基質認識機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 岩下知香子, 平田章, 濡木理, 堀弘幸
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] Transfer RNA modifications in Thermoplasma acidophilum (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2011
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Recognition and cleavage of intron in precursor tRNA by the splicing endonuclease from Aperopyrum pernix, an aerobic hyper-thermophilic Crenarchaeon, thorough a novel RNA recognition site in Crenarchaea specific loop (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Hirata, T. Kitajima, and H. Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2011
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Relationship between 5-methyluridine modification at position 54 in tRNA and tRNA modification network in Thermus thermophiles (2011)
  • 著者名/発表者名: R. Yamagami, N. Shigi, S.-I. Asai, K. Watanabe, and H. Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2011
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Structural and functional analyses of archaeal 2'-5' RNA ligase (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Nagano, A. Hirata, Y. Ishimaru, T. Kanai, and H. Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2011
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] Multisite specific tRNA methyltransferase Trm1 from a hyper-thermophilic eubacterium, Aquifex aeolicus (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Awai, A. Ochi, Ihsanawati, T. Sengoku, S. Kimura, C. Tomikawa, T. Yokogawa, A. Hirata, Y. Bessho, T. Suzuki, S. Yokoyama and H. Hori
  • 学会等名: Thermophiles 2011
  • 発表場所: Big Sky, Montana, USA
  • 年月日: 2011-09-12
• [学会発表] 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西田裕, 岡田和樹, 平田章, 堀弘幸
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング
  • 発表場所: 大府(愛知)
  • 年月日: 2011-08-30
• [学会発表] 古細菌における2' - 5' RNA ligaseの構造機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長野倫子, 平田章, 石丸雄基, 金井保, 堀弘幸
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング
  • 発表場所: 大府(愛知)
  • 年月日: 2011-08-30
• [学会発表] Elucidation of substrate tRNA recognition mechanism by tRNA (m1A58) methyltransferase[TrmI] from Thermus thermophiles (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, C. Iwashita, A. Ochi, and H. Hori
  • 学会等名: 第1回モデル生物丸ごと一匹学会・第10回高度好熱菌連携会議
  • 発表場所: 理研・播磨(Spring-8)
  • 年月日: 2011-08-19
• [学会発表] The crystal structure analysis and establishment of activity mesurement system of Thermus thermophilus tRNA (Um34, Cm34) methyltransferase [YibK] (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Matsugi, A. Hirata, and H. Hori
  • 学会等名: 第1回モデル生物丸ごと一匹学会・第10回高度好熱菌連携会議
  • 発表場所: 理研・播磨(Spring-8)
  • 年月日: 2011-08-19
• [学会発表] Substrate tRNA recognition mechanism of FAD/folate-dependet tRNA m5U54 methyltransferase TrmFO (2011)
  • 著者名/発表者名: R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Iwashita, A. Hirata, O. Nureki, and H. Hori
  • 学会等名: 16th Annual Meeting of RNA Society (RNA 2011Kyoto)
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] Regulation of tRNA modification network by pseudouridine 55 in Thermus thermophiles (2011)
  • 著者名/発表者名: C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori
  • 学会等名: 16th Annual Meeting of RNA Society (RNA 2011Kyoto)
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] A conserved Lys residue in Crenarchaea specific loop determines a broad substratespecificity of Crenarchaeal RNA splicing endonuclease (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Hirata, T. Kitajima, and H. Hori
  • 学会等名: 16th Annual Meeting of RNA Society (RNA 2011Kyoto)
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] Transfer RNA recognition mechanism of multi-site specific tRNA methyltransferase (Trm1) from Aquifex aeolicus (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Awai, A. Ochi, Ihsanawati, A. Hirata, Y. Bessho, S. Yokoyama, and H. Hori
  • 学会等名: 16th Annual Meeting of RNA Society (RNA 2011Kyoto)
  • 発表場所: Kyoto
  • 年月日: 2011-06-16
• [図書] 「生命分子を統合するRNA-その秘められた役割と制御機構」1-3「tRNA修飾の構造と機能」実験医学増刊号 (2013)
  • 著者名/発表者名: 堀弘幸
  • 総ページ数: 37-46
  • 出版者: 羊土社
• [図書] Degradation of hypo-modified tRNA in Thermus thermophilus, an extreme-thermophilic eubacteria, Advanced in Genetic Research, Vol. 6 (K. V. Urbano eds) (2011)
  • 著者名/発表者名: C. Tomikawa and H. Hori
  • 総ページ数: 391-396
  • 出版者: Nova Science Publisher
• [備考]
  • URL: http://www.ehime-u.ac.jp/~achem/bchem/