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2013 年度 実績報告書

苔類植物を用いた陸上植物の生活環制御遺伝子の祖先的機能の研究

研究課題

研究課題/領域番号 23370022
研究機関京都大学

研究代表者

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
キーワード苔類植物 / ゼニゴケ / 生活環制御 / 発生 / 生殖成長 / 環境応答 / トランスクリプトーム / 比較機能ゲノム
研究概要

3つの研究課題のうち、転写因子MpLFY を要とする転写制御ネットワークとその調節下の発生・生理過程に関しては、懸案であったノックアウト(KO)株を雌雄それぞれの背景について確立することができ、表現型の解析も進展しつつある。KO株の表現型解析に当たっては、遺伝的背景の不均一性が表現型の解釈を誤らせたり、評価を難しくする可能性があることが判明し、KO株とKO株に野生型遺伝子を再導入した相補KO株とを比較する、KO株と標準野生型株を交配して得られたF1集団における表現型の分離を解析する、等の方策が有効であることを確認した。そうした手法により、MpLFYが生殖器官の形成・成長促進に関わる可能性、受精卵に最初の分裂に必須である可能性があることが明らかになった。制御標的遺伝子の探索に関しては、申請当初に進めていたマイクロアレイを用いたアプローチで得られた候補遺伝子が、検証の結果、いずれも真の制御標的とは考えにくいことが明らかになったことから、KO株や機能誘導株とRNA seqを組み合わせたアプローチを進めてきた。KO株の確立が遅れたが、KO株、相補KO株、標準野生型株の三者を比較することで候補遺伝子を絞るところまで到達することができた。2つのMADS ボックス転写因子が関わる発生・生理過程に関しては、共同研究を予定していたOsnabruck大学の研究グループの研究体制の変化もあり、大きな進展がなかった。しかし、研究コミュニティ内で利用できるRNA seq解析の知見からは、MpLFYとの関わりを再検討する価値があると考えられる。MADS ボックス転写因子の代わりに、4つあるSPL転写因子のうち、発生と関わりそうな2つを選んで解析をおこなった。どちらについてもKO株を得ることができた。3つのPEBP が関わる生理過程に関しては、無性芽の休眠への関与を示唆する知見を得ることができた。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2015 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (9件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Light-dependent destabilization of PHL in Arabidopsis.2014

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., Kudo, D., Koto, T., Shimizu, H., and Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant Signaling & Behavior

      巻: 9 ページ: e28118

    • DOI

      10.4161/psb.28118

    • 査読あり
  • [雑誌論文] シロイヌナズナとゼニゴケにおける概日時計と光周性2014

    • 著者名/発表者名
      遠藤 求, 久保田 茜, 河内孝之, 荒木 崇
    • 雑誌名

      植物の生長調節

      巻: 49 ページ: 未定

  • [雑誌論文] PHYTOCHROME-DEPENDENT LATEFLOWERING accelerates flowering through physical interactions with phytochrome B and CONSTANS2013

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., Tanigawa, Y., Murakami, T., Araki, T., and Nagatani, A.
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 110 ページ: 18017-18022

    • DOI

      10.1073/pnas.1310631110

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phloem long-distance delivery of FLOWERING LOCUS T (FT) to the apex2013

    • 著者名/発表者名
      Yoo, S.-C., Chen, C., Rojas, M., Daimon, Y., Ham, B.-K., Araki, T., and Lucas, W.
    • 雑誌名

      Plant Journal

      巻: 75 ページ: 456-468

    • DOI

      10.1111/tpj.12213

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BRANCHED1 interacts with FLOWERING LOCUS T to repress the floral transition of the axillary meristems in Arabidopsis2013

    • 著者名/発表者名
      Niwa, M., Daimon, Y., Kurotani, K., Higo, A., Pruneda-Paz, J.L., Breton, G., Mitsuda, N., Kay, S.A., Ohme-Takagi, M., Endo, M., and Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 25 ページ: 1228-1242

    • DOI

      10.1105/tpc.112.109090

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Florigen is involved in axillary bud development at multiple stages in Arabidopsis.2013

    • 著者名/発表者名
      Niwa, M., M., Endo, M., and Araki, T.
    • 雑誌名

      Plant Signaling & Behavior

      巻: 8 ページ: e27167

    • DOI

      10.4161/psb.27167

    • 査読あり
  • [学会発表] Struggling with LEAFY (Reproductive Development Session)

    • 著者名/発表者名
      荒木 崇
    • 学会等名
      4th International Marchantia Workshop 2013
    • 発表場所
      Buln Buln Cabin, Yanakie, VIC, Australia
  • [学会発表] FD-FT複合体形成を制御するタンパク質キナーゼの探索

    • 著者名/発表者名
      川本 望, 笹部美知子, 遠藤 求, 町田泰則, 荒木 崇
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学札幌キャンパス (札幌市)
  • [学会発表] 維管束の概日時計は主要時計としての性質を持つ

    • 著者名/発表者名
      遠藤 求, 荒木 崇
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学札幌キャンパス (札幌市)
  • [学会発表] シロイヌナズナ14-3-3 タンパク質のFT, TFL1, FDとの相互作用による花成制御機構の解析

    • 著者名/発表者名
      肥後あすか, 川本 望, 遠藤 求, 荒木 崇
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学札幌キャンパス (札幌市)
  • [学会発表] シロイヌナズナFT/TSF との相互作用を介したBRC1による側芽相転換の調節

    • 著者名/発表者名
      丹羽優喜,遠藤 求,荒木 崇
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学札幌キャンパス (札幌市)
  • [学会発表] 維管束の概日時計は主要時計としての性質を持つ

    • 著者名/発表者名
      遠藤 求, 清水華子, Brenda Chow, Steve Kay, 荒木 崇
    • 学会等名
      第20回 日本時間生物学会学術大会
    • 発表場所
      近畿大学東大阪キャンパス (東大阪市)
  • [学会発表] ゼニゴケMpLFYノックアウト株の表現型解析

    • 著者名/発表者名
      丹羽優喜, 酒井友希, 肥後あすか, 遠藤 求, 山口礼子, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス (富山市)
  • [学会発表] 維管束の概日時計は主要時計としての性質を持つ

    • 著者名/発表者名
      遠藤 求, 清水華子, Brenda Chow, Steve Kay, 荒木 崇
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス (富山市)
  • [学会発表] FD-FT複合体形成を制御するタンパク質キナーゼの探索と同定

    • 著者名/発表者名
      川本 望, 笹部美知子, 遠藤 求, 町田泰則, 荒木 崇
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス (富山市)
  • [図書] 植物の科学2015

    • 著者名/発表者名
      塚谷裕一, 荒木 崇(編)
    • 総ページ数
      未定
    • 出版者
      放送大学教育振興会
  • [備考] 京都大学生命科学研究科統合生命科学専攻分子代謝制御学分野HP

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/plantdevbio/index.html

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公開日: 2015-05-28  

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