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2013 年度 実績報告書

外向き型及び内向き型バンド3/抗体複合体の三次元結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 23370049
研究機関京都大学

研究代表者

小林 拓也  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20311730)

研究分担者 濱崎 直孝  長崎国際大学, 薬学部, 名誉教授 (00091265)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
キーワード赤血球 / アニオントランスポーター / バンド3 / X線結晶構造解析 / 抗体
研究概要

バンド3は赤血球膜タンパク質の25%を占める主要膜タンパク質であり、世界中でこれまで30年以上、多くの研究者によって研究がなされている。赤血球膜タンパク質バンド3は、陰イオン交換トランスポーター(Anion Exchanger)ファミリーの一員であり、塩化物イオン(Cl-)と重炭酸イオン(HCO3-)など一価の陰イオンを交換輸送することが知られている。バンド3 は分子量約100 KDaで、大きく二つのドメインから構成されている。バンド3は細胞質に突出したN末ドメイン(40kDa)を介して、アンキリンやスペクトリンなどの細胞骨格タンパク質ネットワークを細胞膜に繋ぎ止め、赤血球の形態を維持している。また、膜貫通部分であるC末ドメイン(55kDa)はCl-とHCO3-の交換反応を司り、炭酸脱水素酵素と協調して組織や細胞の必要酸素量を検出するメタボリックセンサーとして機能し、赤血球の酸素と二酸化炭素運搬に必須の役割を果たしている。従って、C末ドメインの構造異常は陰イオン透過活性だけでなく細胞膜裏打ちタンパク質ネットワーク全体の破綻にも結びついていると考えられる。実際、バンド3異常で溶血性貧血がおこる原因のかなりの部分が細胞膜貫通ドメインの不安定化と推測されている。我々はバンド3の膜貫通ドメインの立体構造を解明し、バンド3タンパクの陰イオン透過機構の解明を目的としている。これまでに分解能3.4オングストロームの電子密度図に対しモデル構築と精密化を進めてきた。しかし、今回の結晶構造では見えていない構造があり、分解能を向上させる必要が出てきた。外向き型バンド3の結晶構造をさらに高分解能で解明し、さらに内向き型バンド3の結晶構造も明らかにしたいと考えている。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) (うち招待講演 5件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] GPCRの立体構造から解き明かす生命科学2014

    • 著者名/発表者名
      小林拓也、岩田想
    • 雑誌名

      実験医学増刊 羊土社

      巻: Vol. 32, No. 10 ページ: 84-91

  • [雑誌論文] Synthesis of photoreactive 2-phenethylamine derivatives - Synthesis of adenosine derivative enabling functional analysis of adenosine receptors by photoaffinity labeling.2013

    • 著者名/発表者名
      Murai Y. et al.
    • 雑誌名

      Eur. J. Org. Chem.

      巻: 2013 ページ: 2428-2433

    • 査読あり
  • [雑誌論文] G蛋白質共役受容体のX線結晶構造解析の進歩2013

    • 著者名/発表者名
      小林拓也
    • 雑誌名

      血栓と循環 メディカルレビュー社

      巻: Vol. 21, No. 3 ページ: 33-40

    • 査読あり
  • [学会発表] Crystallization of human membrane proteins using antibody fragments.

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi T.
    • 学会等名
      Protein Island Matsuyama (PIM) International Symposium 2013
    • 発表場所
      Matsuyama
    • 招待講演
  • [学会発表] Crystallization of mammalian membrane proteins using antibody fragments.

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi T.
    • 学会等名
      4th International Symposium on Diffraction Structural Biology
    • 発表場所
      Nagoya
    • 招待講演
  • [学会発表] 機能性抗体を利用したGPCRのX線結晶構造解析への試み

    • 著者名/発表者名
      小林拓也
    • 学会等名
      千里ライフサイエンスセミナー
    • 発表場所
      大阪市
    • 招待講演
  • [学会発表] GPCRのシグナル伝達分子機構の解明から創薬に向けて

    • 著者名/発表者名
      小林拓也
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜市
    • 招待講演
  • [学会発表] GPCRのX線結晶構造解析と創薬に必要なGPCRの構造情報について

    • 著者名/発表者名
      小林拓也
    • 学会等名
      よこはまNMR構造生物学研究会 第47回ワークショップ
    • 発表場所
      横浜市
    • 招待講演
  • [図書] 「膜タンパク質」の重要性とその構造が拓く未来 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • 著者名/発表者名
      村田武士、小林拓也、野村紀通、岩田想
    • 総ページ数
      pp. 1-10
    • 出版者
      化学同人
  • [図書] ムスカリン性アセチルコリン受容体の構造解析から創薬に向けて 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • 著者名/発表者名
      小林拓也
    • 総ページ数
      pp. 19-25
    • 出版者
      化学同人
  • [図書] 膜タンパク質の発現と精製 「昆虫細胞による生産」 膜タンパク質構造研究 最前線2013

    • 著者名/発表者名
      浅田秀基、小林拓也
    • 総ページ数
      pp. 96-102
    • 出版者
      化学同人
  • [備考] http://cell.mfour.med.kyoto-u.ac.jp/

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公開日: 2015-05-28  

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