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2013 年度 実績報告書

NMRを用いた膜蛋白質構造ライブイメージング技術

研究課題

研究課題/領域番号 23370053
研究機関大阪大学

研究代表者

児嶋 長次郎  大阪大学, たんぱく質研究所, 准教授 (50333563)

研究分担者 藤原 敏道  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (20242381)
研究期間 (年度) 2011-04-01 – 2014-03-31
キーワードNMR / 構造生物学 / 膜蛋白質
研究概要

平成25年度は、平成24年度までに確立した大腸菌由来のバックグラウンドを抑制したpHtrIIの選択標識技術(1)~(3)を用い、目的「膜」蛋白質の生体内でのNMR検出技術を確立した。また平成24年度に引き続き、課題(4)として大腸菌そのものへの高磁場DNP法の適用に取り組むとともに、新規課題(5)として膜蛋白質の構造変化の検出にも取り組んだ。
選択標識技術(1)は、観測する膜蛋白質のみを安定同位体標識する技術であり、2回膜貫通型蛋白質pHtrIIの大腸菌大量発現系において、培養時に非標識培地を、蛋白質の発現誘導時に安定同位体標識培地を用いることで、pHtrIIのみを安定同位体標識した。帰属や立体構造解析を容易にするため、均一標識試料だけでなくアミノ酸選択標識試料を用いた。選択標識技術(2)(3)は、バックグラウンドとなる大腸菌由来のNMR信号を抑制する技術であり、pColdシステムを用いた低温での発現誘導により、発現誘導後の目的膜蛋白質以外の蛋白質の翻訳を抑制した。課題(4)は、大腸菌への高磁場DNP法の適用であり、研究分担者の藤原らが開発中の高磁場DNP法を大腸菌に適用し、大腸菌膜に発現しているpHtrIIの観測に取り組んだ。また、課題(5)は、大腸菌における光刺激依存的な膜蛋白質の構造変化の検出であり、これを行うための光照射システムを高磁場DNP装置に設置し、光照射実験を行った。これらの実験から、大腸菌そのままでの固体NMR信号の検出に成功するとともに、膜蛋白質間相互作用の検出に成功した。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (1件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Purification, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of a rice Rac/Rop GTPase, OsRac12014

    • 著者名/発表者名
      Kosami K
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F70 ページ: 113-115

    • DOI

      10.1107/S2053230X13033645

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure of metallo-DNA with consecutive T-HgII-T base-pairs explains positive entropy for the metallo-base-pair formation2014

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 42 ページ: 4094-4099

    • DOI

      10.1093/nar/gkt1344

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 1H, 15N and 13C resonance assignments of the conserved region in the middle domain of S. pombe Sin1 protein2014

    • 著者名/発表者名
      Kataoka S
    • 雑誌名

      Biomol NMR Assign

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

  • [雑誌論文] Structure and function of florigen and the receptor complex2013

    • 著者名/発表者名
      Ken-ichiro Taoka, Izuru Ohki, Hiroyuki Tsuji, Chojiro Kojima and Ko Shimamoto
    • 雑誌名

      Trends Plant Sci.

      巻: 18 ページ: 287-294

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Formation of the T-HgII-T Metal-Mediated DNA Base Pair; Proposal and Theoretical Calculation of the Reaction Pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Sebera J
    • 雑誌名

      Chemistry

      巻: 19 ページ: 9884-9894

    • DOI

      10.1002/chem.201300460

    • 査読あり
  • [学会発表] Sensitivity-enhanced protein NMR techniques developed for ultra-high field NMR2013

    • 著者名/発表者名
      Kojima C
    • 学会等名
      The 4th Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      Seoul National University(韓国)
    • 年月日
      20130705-20130705
    • 招待講演

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公開日: 2015-05-28  

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