蛋白質の構造機能要素の抽出と応用の為の基盤整備

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 23370074
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物物理学
• 研究機関: 奈良先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 上久保 裕生 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 准教授 (20311128)
• 研究分担者: 片岡 幹雄 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 教授 (30150254) ; 山崎 洋一 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 助教 (40332770)
• 研究期間 (年度): 2011-11-18 – 2014-03-31
• キーワード: 蛋白質工学 / 分子設計 / フォールディング / 酵素

研究概要

蛋白質は最も多様性にとみ、高い機能性を示す分子である。ライフサイエンスの研究分野は言うに及ばず、近年では医薬品への応用などより身近な存在になりつつある。しかしながら、我々は未だ、蛋白質を自在に設計し、望みの機能を実現する手法を手にしていない。本研究では、蛋白質の基本部品（エレメント）の同定を試み、その応用可能性を検討してきた。その結果、エレメントの組み替えによって蛋白質の機能を自在に改変できる可能性を見いだすことに成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Excited-State Proton Transfer in Fluorescent Photoactive Yellow Protein Containing 7-Hydroxycoumarin (2014)
  • 著者名/発表者名: D. Novitasari, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Yamaguchi, M. Kataoka
  • 雑誌名: Advanced Materials Research 巻: 896 ページ: 85-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical analysis of the geometrical isotope effect on the hydrogen bonds in photoactive yellow protein with multi-component density functional theory (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Kita, H. Kamikubo, M. Kataoka, M. Tachikawa
  • 雑誌名: Chem. Phys 巻: 419 ページ: 50-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] (1)H, (13)C, and (15)N resonance assignment of photoactive yellow protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Pool TJ, Oktaviani NA, Kamikubo H, Kataoka M, Mulder FA
  • 雑誌名: Biomol NMR Assign 巻: 7(1) ページ: 97-100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Watching a signaling protein function in real time via 100-ps time-resolved Laue crystallography (2012)
  • 著者名/発表者名: Schotte F, Cho HS, Kaila VR, Kamikubo H, Dashdorj N, Henry ER, Graber TJ, Henning R, Wulff M, Hummer G, Kataoka M, Anfinrud PA
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 109(47) ページ: 19256-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive determination of protein tyrosine pKa values for photoactive yellow protein using indirect 13C NMR spectroscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Oktaviani NA, Pool TJ, Kamikubo H, Slager J, Scheek RM, Kataoka M, Mulder FA
  • 雑誌名: Biophys J. 2012 Feb 巻: 8 ページ: 579-86
  • 査読あり
• [雑誌論文] Changes in the hydrogen-bond network around the chromophore of photoactive yellow protein in the ground and excited states (2011)
  • 著者名/発表者名: Mizuno M, Kamikubo H, Kataoka M, Mizutani Y
  • 雑誌名: J Phys Chem B 巻: 115(29) ページ: 9306-10
  • 査読あり
• [学会発表] Functional modification of a protein by using element implantaion (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Kamikubo
  • 学会等名: Sixth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences : Experiments and Simulations
  • 発表場所: Okazaki, Japan
  • 年月日: 20131125-27
• [学会発表] The mechanism of induced folding of Staphylococcal nuclease (2013)
  • 著者名/発表者名: M. Kataoka
  • 学会等名: Telluride Conference on Protein Dynamics 2013
  • 発表場所: Telluride, USA
  • 年月日: 20130805-09
• [学会発表] Is tertiary structure required for a specific function? (2013)
  • 著者名/発表者名: M. Kataoka
  • 学会等名: 8th Asian Biophysics Association Symposium
  • 発表場所: Jeju, Korea
  • 年月日: 20130526-29
• [備考]
  • URL: http://mswebs.naist.jp/LABs/kataoka/