研究課題
本研究は、教授の斎藤成也と助教（2013年10月より理化学研究所ＱＢＩＣのユニットリーダに移籍、国立遺伝学研究所では客員研究員）の隅山健太がそれぞれほぼ独立して進めてきたものである。斎藤成也は、指導しているIsaac Babarindeを筆頭著者とする論文 "Heterogeneous tempo and mode of conserved noncoding sequence evolution among four mammalian orders"をGenome Biology and Evolutionに発表した（論文１）。本論文では、哺乳類の中の４目（霊長目、齧歯目、肉食目、鯨偶蹄目）についてそれぞれ３種以上のゲノム配列を大規模比較し、各目に特有の、非コード領域で進化的に保存されている塩基配列（ＣＮＳ）を抽出した。その結果、霊長目でもっとも多くＣＮＳが発見され、齧歯類でもっともＣＮＳが少なかった。このことは、霊長類で脳が大きく発達したことと関連があるかもしれない。隅山健太は、米国の研究グループが中心となって進めたシーラカンスゲノムの決定と解析計画にかかわり、昨年Nature誌に発表された論文（論文２）の共著者となった。特に四肢の発達にかかわる非コード領域の同定に関係した。隅山はまた京都大学の松田らのグループとの共同研究を進めて、Journal of Neuroscienceに"GDNF and Endothelin 3 regulate migration of enteric neural crest-derived cells via protein kinase A and Rac1"という論文を発表した（論文３）。また、東京工業大学の岡田らのグループとの共同研究をおこない、PLoS ONE誌に"A SINE-derived element constitutes a unique modular enhancer for mammalian diencephalic Fgf8"という論文を発表した（論文４）。
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Genome Biology and Evolution
巻: 5 ページ: 2330-2343
10.1093/gbe/evt177
Nature
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Journal of Neuroscience
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10.1371/journal.pone.0043785
