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2011 年度 実績報告書

プロテアソーム構造変換による植物のストレス適応能力の解明

研究課題

研究課題/領域番号 23380198
研究機関北海道大学

研究代表者

山口 淳二  北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10183120)

研究分担者 千葉 由佳子  北海道大学, 創成研究機構, 特任助教 (70509546)
柳川 由紀  独立行政法人理化学研究所, 植物科学センター, 研究員 (90432591)
キーワードユビキチン・プロテアソーム / 代謝 / タンパク質分解 / ストレス寛容植物 / シロイヌナズナ
研究概要

本研究では,植物のストレス適応に関与するプロテアソームの構造変換機能の全容解明を目指し,1)プロテオミクスを用いたプロテアソームサブユニット構造変換の解明,2)プロテアソーム相互作用ネットワークの解明,3)SCFタイプE3についての網羅的な解析,の3課題を実施した。
1)プロテアソームパラログ分子の量比が環境変化によってどのように変動していくかについて検討した結果,病原体エリシターflg22処理に伴うプロテアソームサブユニット変動についての研究を進め,サブユニットの酸化(カルボニル化)を検出した。
2)本課題に関しては,すでにまとめの段階となっていて,論文作成,投稿を進めた。
3)シロイヌナズナを用いて,ユビキチン/プロテアソーム依存的なタンパク質分解を制御するSCFタイプE3についての網羅的な解析である。これにより,シロイヌナズナでは多種類のSCFタイプ型E3が存在し,それらが各組織及び細胞内器官で特異的な役割を果たすと示唆される結果を得た。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

3つの計画には,進展具合に差がある。2では論文をまとめる段階であるが,それ以外については,さらに進めていく予定である。

今後の研究の推進方策

最終年度に当たり,すでに得られた研究成果をまとめ,論文報告に結びつけるとともに,将来を見据えた布石を打ちつつ,研究を進展させたい。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 2件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Changes in mRNA stability associated with cold stress in Arabidopsis cells.2013

    • 著者名/発表者名
      Chiba Y, Mineta K, Hirai MY, Suzuki S, Kanaya S, Takahashi H, Onouchi H, Yamaguchi J, Naito S
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 54 ページ: 180-194

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs164

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Arabidopsis ubiquitin ligases ATL31 and ATL6 control the defense response as well as the carbon/nitrogen response.2012

    • 著者名/発表者名
      Maekawa S, Sato T, Asada Y, Yasuda S, Yoshida M, Chiba Y, Yamaguchi J
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology

      巻: 79 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1007/s11103-012-9907-0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sugar-inducible RPT2a, a subunit of 26S proteasome, participates in sugar response in Arabidopsis.2012

    • 著者名/発表者名
      Sun H, Sako K, Suzuki Y, Maekawa S, Yasuda S, Chiba Y, Sato T and Yamaguchi J
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 29 ページ: 279-284

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.12.0409a

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis RPT2a, 19S proteasome subunit, regulates gene silencing via DNA methylation.2012

    • 著者名/発表者名
      Sako K, Maki Y, Kanai T, Kato E, Maekawa S, Yasuda S, Sato T, Watahiki MK, Yamaguchi J
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7 ページ: e37086

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0037086

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A comprehensive analysis of interaction and localization of Arabidopsis SKP1-LIKE (ASK) and F-Box (FBX) proteins.2012

    • 著者名/発表者名
      H. Kuroda , Y. Yanagawa, N. Takahashi, Y. Horii, M. Matsui
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7 ページ: e50009

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0050009

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of gamete membrane dynamics during double fertilization of Arabidopsis.2012

    • 著者名/発表者名
      T. Igawa, Y. Yanagawa, S. Miyagishima, T. Mori
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 126 ページ: 387-394

    • DOI

      10.1007/s10265-012-0528-0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ubiquitin/proteasome-mediated proteolysis is involved in the response to flooding stress in soybean roots2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Yanagawa, S. Komatsu
    • 雑誌名

      Plant Science

      巻: 185-186 ページ: 250-258

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2011.11.014

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 序論:酵母から動植物まで包括するユビキチン-プロテアソーム系の新展開2012

    • 著者名/発表者名
      山口淳二,畠山鎮次
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 84 ページ: 407-408

  • [雑誌論文] 植物のRING型ユビキチンリガーゼとプロテアソームシステムの機能2012

    • 著者名/発表者名
      前川修吾,佐古香織,佐藤長緒
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 84 ページ: 416-424

  • [雑誌論文] プロテオーム解析から解く植物のユビキチン-プロテアソーム研究2012

    • 著者名/発表者名
      柳川由紀
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 84 ページ: 448-454

  • [雑誌論文] 理」にとどまらず器官サイズや遺伝子サイレンシングなど様々な現象を制御-2012

    • 著者名/発表者名
      佐古香織
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 50 ページ: 232-234

  • [学会発表] タンパク質複合体や相互作用するタンパク質の精製,解析方法2012

    • 著者名/発表者名
      柳川由紀
    • 学会等名
      第165回農林交流センターワークショップ「第25回タンパク質構造解析シリーズ・生物機能解明のためのプロテオーム解析-講義と実験-」
    • 発表場所
      農研機構作物研究所(つくば市)
    • 年月日
      20120924-20120926
    • 招待講演
  • [学会発表] ユビキチン-プロテアソームシステムによるC/N代謝制御の分子基盤-シロイヌナズナからマイクロトマトへ2012

    • 著者名/発表者名
      山口淳二
    • 学会等名
      シンポジウム「遺伝子組換え技術を利用した植物の代謝制御」,日本植物細胞分子生物学会(生駒)大会・シンポジウム
    • 発表場所
      奈良先端大学院大学(生駒市)
    • 年月日
      20120803-20120805
    • 招待講演
  • [図書] Frontiers in Agriculture Proteome Research2013

    • 著者名/発表者名
      Yasuda S, Maekawa S, Sato T, Yamaguchi J
    • 総ページ数
      39-44
    • 出版者
      Proteomics approach to study metabolic regulation mediated by ubiquitin-proteasome system in Arabidopsis.
  • [図書] Frontiers in Agriculture Proteome Research2013

    • 著者名/発表者名
      S. Komatsu, Y. Yanagawa
    • 総ページ数
      1-8
    • 出版者
      Cell wall proteomics of crops.
  • [備考] 山口。千葉研究室

    • URL

      http://www.sci.hokudai.ac.jp/~jjyama/keitai2/Welcome.html

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公開日: 2014-07-24  

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